Praktikum z genetiky rostlin
                                              JS 2008

•    Genetické mapování mutace lycopodioformis Arabidopsis thaliana

•    Genetické mapování genu odolnosti k padlí travnímu u ječmene

•    Využití mapovacího softwaru

•    Identifikace transgenních rostlin Arabidopsis thaliana



                                         Genetické markery

Marker (genetický marker)

= signální gen, signální linie



n  morfologické

n  bílkovinné (izoenzymy)

n  DNA

   1.     založené na hybridizaci DNA

   2.     založené na polymerázové řetězové   reakci

          amplifikace - specifických sekvencí

                               - náhodných sekvencí









                                        Vlastnosti  markerů

•     vysoký polomorfizmus

•     kodominantní charakter dědičnosti

•     častý výskyt v genomu

•     nezávislost na podmínkách prostředí

•     snadná dostupnost

•     snadné a rychlé testování

•     vysoká reprodukovatelnost

•     snadná výměna údajů mezi laboratořemi



















                                    Využití genetických markerů

Základní výzkum i šlechtění

Studium rostlinných genomů

  

•    Otisk DNA (fingerprinting)

•    Stanovení evolučních vztahů (příbuznost genotypů), taxonomie

•   Genetické mapování

                                       3. Genetické mapování

1. Konstrukce genetických map určitého druhu

2.  Identifikace nových DNA markerů

-              Vytváření nástrojů pro MAS (marker-assisted selection)

-              Poziční klonování genů













                                               Schéma
                                              křížení







                             SSR a CAPS markery použité pro mapování ly

5. chromozom

         Název      Pozice  Typ    Polymorfismus (bp)       PCR cyklus

                                                 Col              S96



n     CIW15   8,5 cM  SSR       177           72                        2

n     CIW17   9,0 cM  CAPS    2203     1228/805                14

n     nga 225 13,3 cM  SSR       119         189                        2





                                               Postup

36 vzorků DNA ly z F[2

]Kontroly: rodiče, F[1

]

n   Reakční směs pro SSR markery

n   ELFO



n   Reakční směs pro CAPS markery

n   Štěpení enzymem AccI 37 -oC 3h – CIW17

                                  

n   ELFO