HARMONOGRAM PRAKTIK Z GENOVÉHO INŽENÝRSTVÍ 2009 DEN ČAS Úloha I. Izolace restrikčních endonukleáz Úloha II. Klonování v pBluescript Úloha III. Klonování v pSP72 pondělí 18.5.09 9:00-10:00 "teorie, seznámení se s jednotlivými experimenty" 10:00-10:30 založení PCR-HSP60 (modifikace konců inzertu) 10:30-11:00 Zahájení centrifugace buněk 11:00-11:30 založení štěpení vektorové DNA založení štěpení vektorové DNA - prázdný pBluescript (EcoRI+BamHI) - pBluescript s endolyzinem (KpnI+SacI) Zvážení výtěžku buněk - expresní vektor pSP72 (KpnI+SacI) 11:30-13:00 Částečné štěpení buněčné stěny Sonikace 13:00-14:00 centrifugace restriktáz srážení DNA streptomycinem příprava dialyzační hadice příprava standardního agarózového gelu příprava preparativního agarózového gelu OBĚD 14:00-15:00 přečištění a štěpení produktu PCR (EcoRI+BamHI) centrifugace vysrážené DNA defosforylace pSP72 15:00-16:00 přečištění naštěpeného plazmidu a produktu PCR přenesení restriktáz do dialyzační hadice preparativní elektroforéza inzertu a vektoru 16:30-17:30 elektroforéza přečištěné DNA izolace vektoru (pSP72) a inzertu z gelu úterý 19.5.09 8:00-9:00 příprava ligačních směsí úloha II příprava ligačních směsí úloha III výměna dialyzačního roztoku středa 20.5.09 8:00-8:45 transformace do buněk TOP10F' transformace do buněk JM109(DE3) 8:45-9:15 nalití misek LBA+Amp+IPTG+xGal nalití misek LBA+Amp 9:15-10:15 teplotní šok a inkubace teplotní šok a inkubace nanesení kontrolních gelů dokončení izolace restrikčních endonukleáz 10:15-11:00 rozplnění do alikvot výsev na selekční médium výsev na selekční médium čtvrtek 21.5.09 8:00-8:30 založení restrikčního štěpení fágové DNA 8:30-11:00 příprava agarózového gelu přečárkování transformant na selekční půdu založení funkčního testu=přerazítkování cca 10:30 elektroforéza naštěpené fágové DNA transformant na půdu LBA+Amp+IPTG pátek 22.5.09 8:00-8:30 izolace metodou lyze varem založení inkubace s chloroformem 8:30-10:00 Vyštěpení inzertu EcoRI a BamHI přelití ploten usmrcenými buňkami S.aureus vyhodnocení gelu a úspěšnosti izolace restriktáz "elektroforéza DNA, výsledek bude k dispozici v Po" vyhodnocení funkčního testu ##### Sheet/List 2 ##### ##### Sheet/List 3 #####