Nové rody cyanobakterií (po roce 2001) Premises 1) Taxonomic classification is a method for registration of world organismal diversity in dependence of evolutionary (genetic) and ecological relations, and phenotypic variation. 2) All new knowledge is necessary to use for the correction of the system; thus, the classification must be continually changed, corrected and re-evaluated. 3) The present system of cyanobacteria (2008) must be modified according to combined markers, in which the molecular data (as a genetic basis) should be corelated with ultrastructural, phenotypic and ecological data. • Přibližně od roku 2000 dochází k reorganizaci klasifikace cyanobakterií. • Pro revizi systému má největší význam aplikace molekulárních (genetických metod. • Ukázalo se, že toto zavedení molekulárních kritérií vede k přesnější definici genetických jednotek (clusterů); v praxi to znamená zmnožení jednotlivých taxonů, zejména na úrovni rodů. • Základním požadavkem pro revizi nových rodů je tzv. kombinovaný (polyfazický) přístup, tj. s použitím genetických kritérií jako základu (% similarity na základě 16S rRNA sekvenace, případně sekvenace dalších genů) a obligatorní aplikací morfologických, ekologických a biochemických dat. • Pro definici nových rodů z bakteriologického hlediska by mělo být uplatňováno jako jedno ze základních kritérií % similarity jednotlivých clusterů vyplývajících ze sekvenace. • U nově stanovených rodů molekulárními metodami je rovněž požadavek autapomorfního cytomorfologického znaku (případně autapomorfní kombinace znaků). • U popisu nových rodů by měla být dodržována pravidla jak botanických tak bakteriologických nomenklatorických předpisů. Koncem 20. století byla provedena rozsáhlá revize na základě morfologických znaků a oproti tradičnímu Geitlerovskému systému popsána a revidována celá řada druhů. Kokální druhy: Asterocapsa Chu 1952, Bacularia Borzi 1905, Chamaecalyx Komárek et Anagnostidis 1986, Coelomoron Buell 1938, Cyanokybus Schiller 1956, Gloeocapsopsis Geitler ex Komárek 1993, Mantellum Dangeard 1941, Pannus Hickel 1991, Rhabdogloea Schroeder 1917, Stanieria Komárek et Anagnodtidis 1986, Xenotholos Gold-Morgan et al. 1994. Oscillatoriální druhy: Arthrospira Stizenberger etx Gomont 1892, Blennothrix Kützing ex Anagnostids et Komárek 1988, Geitlerinema Anagnostidis 1989, Komvophoron Anagnostids et Komárek 1988, Leptolyngbya Anagnostids et Komárek 1988, Planktothrix Anagnostids et Komárek 1988, Symplocastrum (Gomont) Kirchner ex Engler et Prantl 1898, Tychonema Anagnostids et Komárek 1988. Tyto rody, pokud byly ověřovány molekulárními metodami byly vesměs potvrzeny. V moderní taxonomické praxi se uplatňují v principu tři metodické přístupy: • Popis na základě morfologických znaků, tj. tradiční přístup. Takto stanovené jednotky by se měly ovšem morfologicky zřetelně lišit od rodů potvrzených molekulární analýzou. • Stanovení rodů čistě na molekulárním základě. (Většina těchto rodů není validně popsána – nejsou splněna kritéria nomenklatorických kódů.) • Použití různé formy kombinovaného přístupu s molekulárním základem. a) Rody popsané na morfologickém základě (9) • Phormidiochaete Komárek in Anagnostidis 2001 • Trichocoleus Anagnostidis 2001 • Cyanocomperia Hindák 2002 • Planctocyanocapsa Hindák 2002 • Sphaerocavum Azevedo & Sant’Anna 2003 • Cyanocatenula Joosten 2006 • Macrospermum Komárek 2008 • Ophiothrix Sant’Anna et al. (in press) • Streptostemon Sant’Anna et al. (in press) b) Rody popsané pouze na základě molekulárních analýz (4) • (Erythrosphaera Waterbury et al. 1988) = Crocosphaera Zehr et al. 2001; sec. Copeland et al. 2004, 2005 • Halospirulina Nübel et al. 2001 • Thermosynechococcus Katoh et al. 2001 • Acaryochloris Miyashita et al. 2003 c) Rody popsané s kombinovaným přístupem (17) • Halomicronema Abed et al. 2002 • Planktothricoides Suda & Watanabe 2002 • Spirirestis Flechtner & Johansen 2002 • Chroogloeocystis I. Brown et al. 2005 • Cuspidothrix Rajaniemi et al. 2005 • Rexia Casamatta et al. 2006 • Brasilonema Fiore et al. 2007 • Mojavia Řeháková & Johansen 2007 • Halothece (Garcia-Pichel et al. 1998) Margheri et al. 2008 v tisku: • Coleofasciculus Johansen et al. 2009 • Dolichospermum Wacklin et al. 2009 • Geminocystis Korelusová et al. 2009 • Phormidesmis Turicchia et al. 2009 • Plectolyngbya Taton et al. 2009 • Sphaerospermum Zapomělová et al. 2009 Phormidiochaete Komárek in Anagnostidis 2001 Trichocoleus Anagnostidis 2001