Figure 4-23 (part 1 of 2) Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008) figure 4-23 part 1 MNase Figure 4-23 (part 2 of 2) Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008) figure 4-23 part 2 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Na SDS polyakrylamidové gelové elektroforéze jsou patrné 3-4 výrazné proužky odpovídající 11,5 kDa (histon H4), 15,2-15,9 kDa (odpovídá histonům H2A, H2B, H3) a proužky odpovídající ostatním variantám histonových proteinů. jamka 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 vzorek marker vzorek 1 vzorek 1 vzorek 1 vzorek 1 vzorek 2 vzorek 2 vzorek 2 vzorek 2 marker koncentrace (ug/ul) ---------- 15 15 15 15 19 19 19 19 ----------- objem (ul) 7 0,33 0,66 1,33 2 0,26 0,52 1,05 1,58 7 množství (ug) ---------- 5 10 20 30 5 10 20 30 ----------- chromatin fragmentation Pufr 5xA, 100 ml: 50mM NaCl 5M NaCl 50mM MES pH 6.0 0.5M MES 25mM EDTA 0.5M EDTA 1.25M sacharóza Mr = 342.3 3% Triton X-100 100% 750mM spermidin 1M spermidin Pufr 1xA, 100 ml: pufr 5xA voda 100mM PMSF 0.1M PMSF 20mM b-ME 14.3M b-ME 1 ml 10 ml 5 ml 43 g 3 ml 75 μl 80 ml 20 ml 140 μl 100 μl Pufr C, 100 ml: 10mM Tris-Cl pH 7.7 1M Tris-Cl 100mM (NH4)2SO4 2M (NH4)2SO4 10mM MgCl2 Mr = 203.31 - hexahydrát 5mM b-ME 14.3M b-ME 1 ml 5 ml 0.2 g 35 μl chci 0,25M HCl, 10ml 1l…..1,18kg 35% Mr=36,46 mám 1M………36,46g…....…1 l chci 0,25M…..9,115g…...….1l 0,09115g.....0,01l V=m / ρ =0,09115 / 1 180 = 0,000 077 2 l =0,077 2 ml .......100% =0,220 ml .......35% (g / mol) Vypracované protokoly posílejte e – mailem na fojtova@sci.muni.cz nebo schpetra@centrum.cz