Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Studium buněk v podmínkách in vitro Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie – 20.2.2013 doc. RNDr. Renata Veselská, Ph.D., M.Sc. Ústav experimentální biologie Přírodovědecká fakulta MU Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 10 µm fibroblasty v buněčné kultuře Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 • vývoj kultivací buněk in vitro • podmínky kultivace eukaryontních buněk in vitro • typy kultivací (terminologie) • vlastnosti normálních a transformovaných buněčných linií • praktické aplikace • archivace, sbírková pracoviště Program přednášky: Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 VÝVOJ KULTIVACÍ BUNĚK IN VITRO Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 • 1907: kultivace nervových vláken izolovaných z žabích embryí (Harrison) • 1912: explantáty kuřecí pojivové tkáně a srdeční svaloviny (Carrel; Burrows) • 1916: trypsinizace a pasážování (Rous & Jones) • 1943: stabilizace první buněčné linie -myší fibroblasty: L-cells (Earle et al.) • 1948: první buněčný klon - L929 (Sanford et al.) • 1952: stabilizace první lidské linie - karcinom děložního krčku: HeLa (Gey et al.) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 1952 - stabilizace první lidské linie HeLa (Gey et al.) • karcinom děložního krčku • Henrietta Lacks (1920-1951) • Johns Hopkins University Hospital (Baltimore, USA) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Linie HeLa: Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 mikrotubuly (anti-Tu) mikrofilamenta (phalloidin) jádra (DAPI) Linie HeLa: Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 KULTIVAČNÍ PODMÍNKY Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Kultivační podmínky pro savčí a lidské buňky • co nejpodobnější podmínkám v původním organismu:  teplota 37oC,  maximální vlhkost vzduchu, 5% CO2  neutrální pH (6,8 až 7,2)  živiny • sterilní prostředí Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Stabilní prostředí pro kultivace CO2 inkubátory • definovaná stabilní teplota (37oC) • maximální vlhkost vzduchu • definovaný stabilní obsah CO2 (5%), příp. i O2 (řízená hypoxie) • vodní nebo vzduchový plášť • vnitřní povrch: měď nebo nerez • připojení tlakových lahví přes redukční ventily Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Bazální médium • tekuté nebo práškové • soli, aminokyseliny, vitamíny, lipidy, zdroj energie, indikátor pH + krevní sérum / růstové faktory Kompletní médium ŽIVNÉ MÉDIUM Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Voda pro tkáňové kultury: • ultrapure type I - resistivita < 18 MΩ/cm • TOC (total organic carbon) < 10 ppb (parts per bilion) Úprava vody pro tkáňové kultury: • reverzní osmóza • absorbce na aktivní uhlík • iontoměniče • elektrodeionizace • UV záření SLOŽENÍ BAZÁLNÍHO MÉDIA: Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Vyvážené solné roztoky (BSS, balanced salt solutions): • udržování pH a osmolality • udržování membránového potenciálu buněk • kofaktory enzymů • tvorba fokálních adhezí (růst na pevném substrátu) • ionty: Na+, K+, Mg2+, Ca2+, Cl-, SO4 2-, PO4 3-, HCO3 • stopové prvky: Fe, Zn, Cu, Se … Hlavní typy BSS: DPBS (Dulbecco's phosphate-buffered saline) HBSS (Hank's balanced salt solution) EBSS (Earle's balanced salt solution) ESSS (Eagle's spinner salt solution) SLOŽENÍ BAZÁLNÍHO MÉDIA: Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Pufrovací systém: • NaHCO3, HEPES (N-2-hydroxyethylpiperazine-N’-2-ethanesulphonic acid) Aminokyseliny: • esenciální, resp. vzácné (člověk, myš): arginin, histidin, isoleucin, leucin, lysin, methionin, fenylalanin, threonin, tryptofan, valin • in vivo syntetizované ve specifických orgánech (játra, resp. ledviny): cystein, glutamin, tyrosin • lze nahradit hydrolyzátem z proteinů (krátké peptidy) SLOŽENÍ BAZÁLNÍHO MÉDIA: Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 • voda • anorganické sloučeniny (ionty, stopové prvky) • aminokyseliny ---------------------------------------------------------------- • vitamíny (zejména skupina B) • lipidy (esenciální mastné kyseliny, cholesterol…) • hormony, růstové faktory (inzulín, hydrokortizol) • glukóza (zdroj energie) • fenolová červeň (indikátor pH) • antibiotika (penicilin + streptomycin) SLOŽENÍ BAZÁLNÍHO MÉDIA: Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Krevní sérum: • fetální telecí/hovězí - FCS/FBS, koňské, lidské... • nedefinovaná směs růstových faktorů a dalších složek • obsah v médiu 5 - 20% podle typu buněk • bezsérová média pro speciální aplikace (definovaná směs růstových faktorů - tzv. serum replacement) Nejdůležitější látky obsažené v séru: • růstové faktory • albumin • transferrin • anti-proteázy (antitrypsin, macroglobulin) • attachment factors (fibronectin, laminin, fetuin) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Výhody použití séra: • směs nejdůležitějších faktorů pro přežívání a proliferaci buněk • univerzální použití pro kultivaci většiny buněčných typů • ochrana buněčné kultury před výkyvy prostředí a toxickými vlivy (změny pH, ionty těžkých kovů, endotoxiny, proteolytické enzymy) Nevýhody použití séra : • potíže s reprodukovatelností (původ zvířat, krmení, roční doba…) • riziko kontaminace • dostupnost a cena • vliv na produkci proteinů do média Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Typy médií pro savčí buňky: • Eagleovo médium (BME) a jeho modifikace (např. EMEM, AMEM, DMEM, GMEM, JMEM) • RPMI média (např. RPMI 1629, RPMI 1630, RPMI 1640) • další média užívaná se sérem (např. Fischerovo, Williamsovo) • média užívaná bez séra (TC199, MCDB) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Sterilní prostředí • práce v tzv. laminárních boxech (HEPA filtry) - typ podle úrovně Biosafety Level (BSL) • jednorázový plastik (sterilizováno radiací) • sterilní sklo, nástroje a roztoky (horkovzdušná sterilizace, autoklávování) • antibiotika (běžně směs Pen/Str, případně gentamycin, amphotericin, nystatin) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 BSL-1 • mikroorganismy, které nezpůsobují onemocnění u zdravých dospělých; standardizované lidské a živočišné buněčné linie BSL-2 • běžné patogeny středního rizika, mohou způsobovat různě závažná onemocnění, která lze dobře léčit (HBV, Salmonella, Toxoplasma, klinický materiál - krev, tělní tekutiny, tkáně; některé sbírkové linie - např. HeLa) ÚROVNĚ BIOLOGICKÉHO RIZIKA = BIOSAFETY LEVELS (BSLs) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Laminární box - biohazard třída I horizontální vertikální Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Laminární box - biohazard třída II HEPA filtry (částice > 0,3 mm) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 BSL-3 • lokální nebo exotické patogeny vysokého rizika, respiračně přenosné, způsobují závažná a potenciálně letální onemocnění, která jsou obtížně léčitelná • Mycobacterium tuberculosis, virus encefalitidy St. Louis, antrax BSL-4 • extrémně rizikové patogeny, respiračně přenosné, způsobují letální onemocnění, proti nimž neexistuje léčba ani vakcinace • hemorrhagické viry (Ebola, Marburg) ÚROVNĚ BIOLOGICKÉHO RIZIKA = BIOSAFETY LEVELS (BSLs) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 BIOSAFETY LEVEL 3 (BSL-3) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 BIOSAFETY LEVEL 4 (BSL-4) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Typy kontaminací • mykoplazmata • viry • bakterie, plísně, kvasinky • kontaminace jinou buněčnou linií (cross-contamination) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Kontaminace – mykoplazmata Detekce mykoplazmat: a) fluorescencenční mikroskopie (značení DNA) b) PCR Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 KULTIVAČNÍ POSTUPY Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 invertovaný mikroskop Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Typy buněčných kultur: • adherované: rostou přichycené na pevném podkladu • suspenzní: rostou volně v médiu Kultivace na živné vrstvě (feeder-layer): • obvykle inaktivované myší buňky (fibroblasty, peritoneální makrofágy) • hybridomy, embryonální kmenové buňky Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Suspenzní kultury • odstranění starého média centrifugací • naředění buněk v čerstvém médiu • přenesení do nové kultivační lahvičky/misky s čerstvým médiem Adherované buňky • odstranění starého média, oplach v pufru • uvolnění buněk z podkladu proteolýzou fokálních adhezí (trypsin) • inaktivace trypsinu přidáním séra • alternativa: mechanické uvolnění (škrabky) • centrifugace, naředění buněk v čerstvém médiu • přenesení do nové kultivační lahvičky/misky s čerstvým médiem SUBKULTIVACE (PASÁŽOVÁNÍ) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 DĚLENÍ BUNĚK V PODMÍNKÁCH IN VITRO: Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 TYPY KULTIVACÍ (TERMINOLOGIE) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 TKÁŇOVÉ KULTURY / CELL CULTURES • orgánová/tkáňová kultura (organ/tissue culture) trojrozměrná kultura nerozvolněné tkáně, která si uchovává histologické znaky a vlastnosti původní tkáně v prostředí in vivo • buněčná kultura (cell culture) kultura odvozená z jednotlivých buněk, které už nejsou spojeny do struktury tkáně • primokultura / primární kultura (primary culture) buňky v kultuře jsou získány přímo z původní tkáně nebo fragmentu orgánu Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 primokultura multiformního glioblastomu - 5. den Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 primokultura multiformního glioblastomu - 12. den Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 primokultura multiformního glioblastomu - 12. den Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Buněčná linie • populace buněk odvozená z primokultury při první pasáži a dále udržovaná v podmínkách in vitro (pasáž = přenos buněk z jedné kultivační nádobky do nádobky nové) • diploidní (normální nenádorové buňky) • stabilizovaná (nádorově transformované buňky) • charakterizace buněčné linie: označení (název), druh organismu, pohlaví, věk, výchozí orgán, typ kultury, počet pasáží, růstové parametry, morfologie, karyotyp, markery Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Buněčný kmen • buněčná populace, získaná subkultivací z původní linie - vyselektována na základě exprese určitého znaku Buněčný klon • buněčná populace, vzniklá pomnožením jediné buňky, izolované z původní linie • všechny buňky v buněčném klonu teoreticky identické, avšak v praxi určitý stupeň heterogenity Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 NORMÁLNÍ A TRANSFORMOVANÉ BUNĚČNÉ LINIE Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Růstové parametry buněčných linií: • generační doba období mezi dvěma mitózami = délka buněčného cyklu • population doubling time (PDT) čas, potřebný ke zdvojnásobení počtu buněk v populaci • lifespan (délka života) geneticky naprogramovaný počet dělení buňky • kontaktní inhibice zástava proliferace po dosažení určité limitní saturační density Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Kontaktní inhibice Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Diploidní buněčné linie: • normální nenádorové buňky • omezená délka života in vitro • standardní karyotyp (diploidní) • obvykle anchorage-dependent (vyžadují substrát k přichycení) • schopnost kontaktní inhibice • tzv. "stárnutí kultury" = změna morfologie a růstových parametrů se vzrůstající dobou v podmínkách in vitro • LEP (lidské embryonální plíce) HPLC (lidské lymfocyty periferní krve) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Stabilizované buněčné linie: • nádorově transformované buňky • neomezený generační potenciál = nesmrtelnost v podmínkách in vitro • kratší PDT, redukovaná závislost na podkladu • obvykle heteroploidní, resp. aneuploidní • často bez schopnosti kontaktní inhibice • lidské adherované: HeLa, A431, MCF-7, Saos-2… lidské suspenzní: HL-60, Jurkat, HeLa-S… L929, 3T3 (myší fribroblasty), CHO (chinese hamster ovary) MDCK (Madine-Darby canine kidney) VERO (African green monkey kidney) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Rozdíl v počtu chromosomů během kultivace normální buňky (gliové buňky) transformované buňky (maligní melanom) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 PRAKTICKÉ APLIKACE Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 • základní výzkum (buněčná biologie, cytogenetika, onkologie, imunologie, biochemie, molekulární biologie, virologie…) • prenatální diagnostika • toxikologie (testy léčiv, kosmetických přípravků, implantátů • reprodukční medicína (IVF) • klinická onkologie (typizace nádorů, testování multidrug resistance, hodnocení markerů) • výroba očkovacích látek (virové vakcíny) • průmyslová výroba specifických buněčných produktů (transgenní linie) • příprava buněčných a tkáňových derivátů (např. kůže) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 KRYOKONZERVACE, ARCHIVACE, SBÍRKOVÁ PRACOVIŠTĚ Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Kryokonzervace živočišných buněk • kultura v exponenciální fázi růstu • po trypsinizaci resuspendování v zamražovací směsi: 90% sérum (FCS) + 10% kryoprotektivum (DMSO, glycerol) • dvoustupňové zamražování: "pomalý krok" (optimální pokles o 1oC za minutu) "rychlý krok" (přemístění kryoampulí z -8OoC do - 15OoC (hlubokomrazící boxy) nebo do -196oC (kontejnery s tekutým dusíkem) • rozmražování: nejprve rychlé ohřátí (rozmražení směsi), pak pomalé přidávání vychlazeného média (cca 1ml za minutu) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Příklady kryoprotektiv: glyceroldimethylsulfoxid (DMSO) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Vliv rychlosti zamražování na přežití buněk: Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 American Type Culture Collection (ATCC) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013 European Collection of Cell Cultures (ECACC) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2013