1 Bi8120 A lik á b ěč á bi l iBi8120 A lik á b ěč á bi l iBi8120 Aplikovaná buněčná biologieBi8120 Aplikovaná buněčná biologie ĚĚDIFERENCIACE BUNĚKDIFERENCIACE BUNĚK RNDr. Jakub Neradil, Ph.D. Ústav experimentální biologie PřF MU RNDr. Jakub Neradil, Ph.D. Ústav experimentální biologie PřF MUÚstav experimentální biologie PřF MUÚstav experimentální biologie PřF MU 2 Program přednášky:Program přednášky: • diferenciační potenciál buněk dif i č í d áh • diferenciační potenciál buněk dif i č í d áh• diferenciační dráhy • růstové faktory • diferenciační dráhy • růstové faktory • indukovaná diferenciace• indukovaná diferenciace Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 3 Vývoj mnohobuněčného organismuVývoj mnohobuněčného organismu • identický genom ve všech buňkách • kontrola na úrovni genové exprese • identický genom ve všech buňkách • kontrola na úrovni genové exprese• kontrola na úrovni genové exprese 1. buněčná proliferace • kontrola na úrovni genové exprese 1. buněčná proliferace1. buněčná proliferace 2. diferenciace buněk 3. buněčné interakce 1. buněčná proliferace 2. diferenciace buněk 3. buněčné interakce 4. pohyb buněk 5. buněčná smrt 4. pohyb buněk 5. buněčná smrt Lidský organismus: 013 b ěk (2 0 ů ý h ů) Lidský organismus: 013 b ěk (2 0 ů ý h ů) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 1 zygota → 1013 buněk (250 různých typů)1 zygota → 1013 buněk (250 různých typů) 4 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 5 DIFERENCIAČNÍ POTENCIÁL BUNĚKDIFERENCIAČNÍ POTENCIÁL BUNĚKDIFERENCIAČNÍ POTENCIÁL BUNĚKDIFERENCIAČNÍ POTENCIÁL BUNĚK Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 6 Časná embryogeneze u savců:Časná embryogeneze u savců:y g • zygota • morula (8, resp. 16 buněk = blastomery) y g • zygota • morula (8, resp. 16 buněk = blastomery) • blastocysta (~ 64 buněk)• blastocysta (~ 64 buněk) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 7 Blastocysta: • trofoektoderm → Blastocysta: • trofoektoderm → extraembryonální tkáně (placenta) • inner cell mass (ICM) → b extraembryonální tkáně (placenta) • inner cell mass (ICM) → bembryo Gastrulace → 3 zárodečné listy: embryo Gastrulace → 3 zárodečné listy:Gastrulace → 3 zárodečné listy: • ektoderm (neurální a epidermální buňky) • mesoderm (svalová a pojivová tkáň) Gastrulace → 3 zárodečné listy: • ektoderm (neurální a epidermální buňky) • mesoderm (svalová a pojivová tkáň)• mesoderm (svalová a pojivová tkáň) • endoderm (epitel vnitřních orgánů) • mesoderm (svalová a pojivová tkáň) • endoderm (epitel vnitřních orgánů) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 8 Ektoderm • CNS í i č čk Ektoderm • CNS í i č čk• sítnice a čočky • lebeční a senzorická ganglia a nervy i t é b ňk • sítnice a čočky • lebeční a senzorická ganglia a nervy i t é b ňk• pigmentové buňky • pojivová tkáň hlavy • epidermis • pigmentové buňky • pojivová tkáň hlavy • epidermis• epidermis • vlasy, ochlupení • prsní žlázy • epidermis • vlasy, ochlupení • prsní žlázy• prsní žlázy• prsní žlázy Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 9 Mesoderm • lebka a kostra l á káň (l bk i k í l ) Mesoderm • lebka a kostra l á káň (l bk i k í l )• svalová tkáň (lebka i kosterní svalstvo) • dermis ji á tkáň • svalová tkáň (lebka i kosterní svalstvo) • dermis ji á tkáň• pojivová tkáň • urogenitální systém • střevní svalovina • pojivová tkáň • urogenitální systém • střevní svalovina• střevní svalovina • srdce • krevní a lymfatické buňky • střevní svalovina • srdce • krevní a lymfatické buňky• krevní a lymfatické buňky • slezina • krevní a lymfatické buňky • slezina Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 10 Endoderm • žaludek Endoderm • žaludek • tračník • játra • tračník • játrajátra • slinivka • močový měchýř játra • slinivka • močový měchýř• močový měchýř • epiteliální výstelka průdušnice, plic, hltanu,  štítné žlázy, střev • močový měchýř • epiteliální výstelka průdušnice, plic, hltanu,  štítné žlázy, střevštítné žlázy, střevštítné žlázy, střev Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 11 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 12 Totipotence • nelimitovaný diferenciační potenciál Totipotence • nelimitovaný diferenciační potenciál• nelimitovaný diferenciační potenciál • schopnost tvořit embryonální i extraembryonální  tkáně • nelimitovaný diferenciační potenciál • schopnost tvořit embryonální i extraembryonální  tkáně • časná stádia rýhování zygoty (1‐4 dny) Pluripotence • časná stádia rýhování zygoty (1‐4 dny) Pluripotenceu pote ce • schopnost tvořit buňky všech 3 zárodečných listů • buňky ICM (embryonální kmenové buňky, 5‐14dní) u pote ce • schopnost tvořit buňky všech 3 zárodečných listů • buňky ICM (embryonální kmenové buňky, 5‐14dní) Multipotence • schopnost tvořit buňky příslušného typu tkáně Multipotence • schopnost tvořit buňky příslušného typu tkáněp y p yp • např. hematopoetické kmenové buňky, neuronální  kmenové buňky… p y p yp • např. hematopoetické kmenové buňky, neuronální  kmenové buňky… Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 13 totipotentní buňka (zygota, blastomery) totipotentní buňka (zygota, blastomery) pluripotentní buňky (embryonální kmenové) pluripotentní buňky (embryonální kmenové) multipotentní buňky (hematopetické kmenové) multipotentní buňky (hematopetické kmenové)(hematopetické kmenové)(hematopetické kmenové) progenitorové buňkyprogenitorové buňkyprogenitorové buňkyprogenitorové buňky i ál ě dif éi ál ě dif éterminálně diferencované  buňky terminálně diferencované  buňky Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 14 Rozdíl v diferenciačním  potenciálu kmenových a  Rozdíl v diferenciačním  potenciálu kmenových a p ý progenitorových buněk p ý progenitorových buněk Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 15 Eukaryontní buňka: • 5000 různých bílkovin (109 ‐ 1010 molekul) Eukaryontní buňka: • 5000 různých bílkovin (109 ‐ 1010 molekul)• 5000 různých bílkovin (10 10 molekul) • každý buněčný typ vytváří asi 100 specifických  proteinů • 5000 různých bílkovin (10 10 molekul) • každý buněčný typ vytváří asi 100 specifických  proteinů • housekeeping genes: exprimovány konstitutivně na relativně nízké  • housekeeping genes: exprimovány konstitutivně na relativně nízké  úrovni ve všech buňkách organismu • housekeeping proteins: úrovni ve všech buňkách organismu • housekeeping proteins:housekeeping proteins: esenciální metabolické enzymy, buněčné  komponenty housekeeping proteins: esenciální metabolické enzymy, buněčné  komponenty • exprese různých genů závisí na typu buňky, fázi buněčného cyklu atd. • exprese různých genů závisí na typu buňky, fázi buněčného cyklu atd. Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 16 Příčiny diferenciace:Příčiny diferenciace:Příčiny diferenciace: • postupné změny v aktivitě genů Příčiny diferenciace: • postupné změny v aktivitě genůpostupné změny v aktivitě genů (programovány v genomu) postupné změny v aktivitě genů (programovány v genomu) • odpověď na molekulární signály vysílané  ostatními buňkami • odpověď na molekulární signály vysílané  ostatními buňkamiostatními buňkami • odpověď na fyzikální kontakt s ostatními ostatními buňkami • odpověď na fyzikální kontakt s ostatnímiodpověď na fyzikální kontakt s ostatními buňkami odpověď na fyzikální kontakt s ostatními buňkami Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 17 Signály regulující diferenciaci  Solubilní regulátory • Hormony (glukagon, hydrokortison, tyroxin,…) Rů t é f kt (TGF t f jí í ů t ý f kt• Růstové faktory (TGF‐transformující růstový faktor,  FGF‐fibroblastový růstový faktor, interleukiny, …) • Vitaminy (D, A …) • Ionty (Ca2+ )• Ionty (Ca , …)  Fyzické kontakty mezi buňkami (gap junctions)  Kontakt buněk s mezibuněčnou matrix (kolagen, laminin, …)  Polarita a tvar buněk Polarita a tvar buněk   Fyzikální parametry prostředí (teplota, parciální tlak O2, …) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 18 Molekulární mechanismy diferenciace • nejdůležitějším místem regulace je iniciace Molekulární mechanismy diferenciace • nejdůležitějším místem regulace je iniciacenejdůležitějším místem regulace je iniciace  transkripce • vazba regulačních proteinů na specifické sekvence  ( l č í bl ) nejdůležitějším místem regulace je iniciace  transkripce • vazba regulačních proteinů na specifické sekvence  ( l č í bl )DNA (regulační oblasti) • relativně malý počet strukturních motivů DNA (regulační oblasti) • relativně malý počet strukturních motivů Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 19 Molekulární mechanismy diferenciaceMolekulární mechanismy diferenciace • 2 základní mechanismy účinku regulačních proteinů: a) ovlivnění vazby RNA polymerázy a transkripčních  faktorů na promotor • 2 základní mechanismy účinku regulačních proteinů: a) ovlivnění vazby RNA polymerázy a transkripčních  faktorů na promotorfaktorů na promotor b) lokální modifikace struktury chromatinu v oblasti  promotoru faktorů na promotor b) lokální modifikace struktury chromatinu v oblasti  promotoru • kombinace regulačních proteinů  • u člověka asi 3000 TFs • kombinace regulačních proteinů  • u člověka asi 3000 TFsu člověka asi 3000 TFs • ±5 TFs působí společně a reguluje transkripci jednoho  genu u člověka asi 3000 TFs • ±5 TFs působí společně a reguluje transkripci jednoho  genu • jeden TF reguluje více genů (pozitivně i negativně) • tkáňová specifita • jeden TF reguluje více genů (pozitivně i negativně) • tkáňová specifita Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 20 Zachování exprese genů po rozdělení buňky Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 21 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 22 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 23 DIFERENCIAČNÍ DRÁHYDIFERENCIAČNÍ DRÁHYDIFERENCIAČNÍ DRÁHYDIFERENCIAČNÍ DRÁHY Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 24 Diferenciace buňky směřovány do určitého vývojového směru (linie) – tentobuňky směřovány do určitého vývojového směru (linie)  tento  stav nelze měnit (například buňky erytroidní linie „nepřeskočí“ do  linie myeloidní) Dediferenciace ztráta diferencovaného fenotypu • je obvyklá in vitro (adaptace na kultivační podmínky) • in vivo u nižších živočichů (regenerace obojživelníků) • experimentálně – příprava iPS cellsexperimentálně  příprava iPS cells Transdiferenciace h t čitý h b ěk čité tká ě ( č t ě SC bschopnost určitých buněk určité tkáně (včetně SCs nebo  progenitorů) diferencovat do buněk typických pro jiné orgány  nebo tkáně (např. hematopoetické) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 25 Epigenetic landscape: H.C. Waddington (1957) Epigenetic landscape: T. Graf & T. Enver (2009) role transkripčních faktorů‐ role transkripčních faktorů Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 26 Indukovaná transdiferenciace Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 27 Diferenciační  potenciál  Diferenciační  potenciál  hematopoetických  kmenových buněk hematopoetických  kmenových buněk Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 28 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 29 Diferenciace  krevních buněk Diferenciace  krevních buněk ‐ vliv růstových  faktorů a jiných  cytokinů ‐ vliv růstových  faktorů a jiných  cytokinůcytokinůcytokinů Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 30 Vliv TFs na diferenciaci  krevních buněkkrevních buněk Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 31 Porucha diferenciace krevních buněk  Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 32 Průběh neuronální diferenciacePrůběh neuronální diferenciace Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 33 Regulace neuronální  d fdiferenciace  TGF‐ superfamilyTGF  superfamily • TGF‐  (1‐3) • BMPs• BMPs • nodal • activin Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 34 Neuronální diferenciaceNeuronální diferenciace Kmenová buňka: • nestin Kmenová buňka: • nestin • GFAP • DNA • GFAP • DNA Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 35 Neuronální  diferenciace Neuronální  diferenciace Progenitorová  b ňk Progenitorová  b ňkbuňka: • ‐tubulin III • GFAP buňka: • ‐tubulin III • GFAPGFAP • DNA GFAP • DNA Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 36 Neuronální diferenciaceNeuronální diferenciace Neurony: • ‐tubulin III Neurony: • ‐tubulin III • DNA  • DNA Gliové buňky: • GFAP DNA Gliové buňky: • GFAP DNA• DNA• DNA Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 37 Diferenciace příčně pruhované svalovinyDiferenciace příčně pruhované svaloviny diferenciaci doprovází  • zástava buněčného cyklu ě f l i diferenciaci doprovází  • zástava buněčného cyklu ě f l i• změna morfologie  • fůze v syncytia • změna morfologie  • fůze v syncytia Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 38 Diferenciace příčně pruhované svalovinyDiferenciace příčně pruhované svaloviny • svalové prekurzory exprimují mrf4, myf5 a myoD • in vitro: po odstanění růstových faktorů se spustí diferenciace • svalové prekurzory exprimují mrf4, myf5 a myoD • in vitro: po odstanění růstových faktorů se spustí diferenciace • exprese svalově specifických proteinů:  myogenin, svalový aktin, myosin II, tropomyosin ... • exprese svalově specifických proteinů:  myogenin, svalový aktin, myosin II, tropomyosin ... Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 39 RŮSTOVÉ FAKTORYRŮSTOVÉ FAKTORYRŮSTOVÉ FAKTORYRŮSTOVÉ FAKTORY Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 40 Růstové faktory (Growth Factors)Růstové faktory (Growth Factors) • vazba na příslušný membránový receptor • aktivace specifické intracelulární signální dráhy • vazba na příslušný membránový receptor • aktivace specifické intracelulární signální dráhy • stimulace přežívání a růstu buněk (metabolismus,  zvyšování objemu, antiapoptotické) • některé fungují i jako mitogeny (např PDGF) resp • stimulace přežívání a růstu buněk (metabolismus,  zvyšování objemu, antiapoptotické) • některé fungují i jako mitogeny (např PDGF) resp• některé fungují i jako mitogeny (např. PDGF), resp.  induktory diferenciace • např. cytokiny, hormony (insulin), ... růstové faktory • některé fungují i jako mitogeny (např. PDGF), resp.  induktory diferenciace • např. cytokiny, hormony (insulin), ... růstové faktory CytokinyCytokiny • signální proteiny ovlivňující buněčnou proliferaci,  diferenciaci a imunitní odpověď  (interleukiny G CSF GM CSF ) • signální proteiny ovlivňující buněčnou proliferaci,  diferenciaci a imunitní odpověď  (interleukiny G CSF GM CSF ) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. (interleukiny, G‐CSF, GM‐CSF...)(interleukiny, G‐CSF, GM‐CSF...) 41 Příklady růstových faktorůPříklady růstových faktorů EGF (Epidermal Growth Factor) • specifická vazba na EGFR (Epidermal Growth Factor Receptor) EGF (Epidermal Growth Factor) • specifická vazba na EGFR (Epidermal Growth Factor Receptor)• specifická vazba na EGFR (Epidermal Growth Factor Receptor)  → aktivace RTK kaskády  FGF Family (Fibroblast Growth Factor) • specifická vazba na EGFR (Epidermal Growth Factor Receptor)  → aktivace RTK kaskády  FGF Family (Fibroblast Growth Factor)y • 22 molekul • FGF2 = bFGF (basic fibroblast growth factor) y • 22 molekul • FGF2 = bFGF (basic fibroblast growth factor) • receptory FGFR1‐4 VEGF (Vascular Endothelial Growth Factor) • receptory FGFR1‐4 VEGF (Vascular Endothelial Growth Factor) • stimulace vaskulárních endotelií → angiogeneze • v případě hypoxie ‐ exprese HIF ‐> VEGF • stimulace vaskulárních endotelií → angiogeneze • v případě hypoxie ‐ exprese HIF ‐> VEGF Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 42 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 43 TGF (Transforming Growth Factor)TGF (Transforming Growth Factor)TGF (Transforming Growth Factor) • up‐regulace u některých typů nádorů TGF (Transforming Growth Factor) • up‐regulace u některých typů nádorů • schopnost indukovat nádorovou transformaci v  podmínkách in vitro (krysí fibroblasty ledvin)  ( k fá k é b ňk k ) • schopnost indukovat nádorovou transformaci v  podmínkách in vitro (krysí fibroblasty ledvin)  ( k fá k é b ňk k )• TGF‐α (makrofágy, mozkové buňky, keratinocyty):  vývoj epitelu ‐ příbuznost s EGF, vazba na EGFR TGF  i f  1  2  3 dif i b ěk • TGF‐α (makrofágy, mozkové buňky, keratinocyty):  vývoj epitelu ‐ příbuznost s EGF, vazba na EGFR TGF  i f  1  2  3 dif i b ěk• TGF‐ ‐ isoformy  1,  2,  3: diferenciace buněk,  vývoj embrya, regulace imunitního systému, apoptóza • TGF‐ ‐ isoformy  1,  2,  3: diferenciace buněk,  vývoj embrya, regulace imunitního systému, apoptóza Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 44 Neurotrofiny (Neurotrophins)Neurotrofiny (Neurotrophins) • produkovány cílovou tkání → přežívání neuronů,  neuronální diferenciace • produkovány cílovou tkání → přežívání neuronů,  neuronální diferenciace • receptory: p75, Trk receptory (A,B,C) • receptory: p75, Trk receptory (A,B,C) • NGF (nerve growth factor)  • BDNF (brain‐derived • NGF (nerve growth factor)  • BDNF (brain‐derivedBDNF (brain derived neurotrophic factor) NT 3 ( hi 3) BDNF (brain derived neurotrophic factor) NT 3 ( hi 3)• NT‐3 (neutrophin‐3) • NT‐4 (neutrophin‐4) • NT‐3 (neutrophin‐3) • NT‐4 (neutrophin‐4) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 45 Pleiotropní efekt BDNFPleiotropní efekt BDNF Hematopoetic Precursor Cell Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. Hematopoetic Precursor Cell 46 BDNF‐indukovaná neovaskularizaceBDNF‐indukovaná neovaskularizace HPCs‐ hematopoietic precursor cells, MCs ‐ mural cell, ECs endothelial cells Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 47 EPO (Erythropoietin) d k l d i á h EPO (Erythropoietin) d k l d i á h• produkce v ledvinách  • stimulace tvorby erytrocytů • rekombinantní EPO • produkce v ledvinách  • stimulace tvorby erytrocytů • rekombinantní EPO• rekombinantní EPO TPO (Thrombopoietin) • produkce ve slezině a v ledvinách • rekombinantní EPO TPO (Thrombopoietin) • produkce ve slezině a v ledvinách• produkce ve slezině a v ledvinách • stimulace tvorby megakaryocytů, krevních destiček G CSF (G l t C l Sti l ti F t ) • produkce ve slezině a v ledvinách • stimulace tvorby megakaryocytů, krevních destiček G CSF (G l t C l Sti l ti F t )G‐CSF (Granulocyte Colony Stimulating Factor) • stimulace tvorby granulocytů/neutrofilů ( G‐CSF (Granulocyte Colony Stimulating Factor) • stimulace tvorby granulocytů/neutrofilů (GM‐CSF (Granulocyte Macrophage Colony Stimulating Factor) GM‐CSF (Granulocyte Macrophage Colony Stimulating Factor) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 48 RECEPTOROVÉ TYROZIN‐KINÁZY  funkce: regulace proliferace, diferenciace, metabolismu, aj.g p j lidský genom : 59 genů (+alternativní sestřih) → 20 receptorových rodin Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 49 DOMÉNY : • extracelulární (receptorová) • transmembránovátransmembránová  • cytoplasmatická (tyrozin kinázová) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 50 AKTIVACE: dimerizace vlivem růstových faktorů → cross‐fosforylace a) → konformační změna – stimulace katalytické aktivity b) → tvorba vazebných míst pro domény adaptorových            proteinů (Grb‐2)proteinů (Grb 2) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 51 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 52 INDUKOVANÁ DIFERENCIACEINDUKOVANÁ DIFERENCIACEINDUKOVANÁ DIFERENCIACEINDUKOVANÁ DIFERENCIACE Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 53 Indukovaná diferenciace • induktory diferenciace (růstové faktory vitamíny Indukovaná diferenciace • induktory diferenciace (růstové faktory vitamínyinduktory diferenciace (růstové faktory, vitamíny,  inhibitory kináz, změny v kultivaci, syntetické látky…) • indukce příslušné diferenciační dráhy  induktory diferenciace (růstové faktory, vitamíny,  inhibitory kináz, změny v kultivaci, syntetické látky…) • indukce příslušné diferenciační dráhy  • inhibice signálních drah pro „self‐renewal“ ů • inhibice signálních drah pro „self‐renewal“ ůPříklady induktorů diferenciace in vitro: • kyselina all‐trans retinová (ATRA) • 1 25 dihydroxycholekalciferol (1 25(OH) D ) Příklady induktorů diferenciace in vitro: • kyselina all‐trans retinová (ATRA) • 1 25 dihydroxycholekalciferol (1 25(OH) D )• 1,25‐dihydroxycholekalciferol (1,25(OH)2‐D3) • phorbol myristylacetát (PMA)  • trichostatin • 1,25‐dihydroxycholekalciferol (1,25(OH)2‐D3) • phorbol myristylacetát (PMA)  • trichostatin• trichostatin • dimethylsulfoxid (DMSO) • SU5402 (inhibitor FGFR1)... • trichostatin • dimethylsulfoxid (DMSO) • SU5402 (inhibitor FGFR1)... Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. SU5 0 ( b to G )SU5 0 ( b to G ) 54 Kyselina all‐trans retinová (ATRA) y ( ) jako induktor diferenciace Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 55 Kyselina retinová (RA) jako modelový induktor diferenciace (a morfogeneze) Kyselina retinová (RA) jako modelový induktor diferenciace (a morfogeneze)induktor diferenciace (a morfogeneze)induktor diferenciace (a morfogeneze) 1. vazba na jaderné receptory (RAR, RXR) 2. vazba komplexu na regulační oblast (RARE) 3 acetylace histonů  aktivace transkripce 1. vazba na jaderné receptory (RAR, RXR) 2. vazba komplexu na regulační oblast (RARE) 3 acetylace histonů  aktivace transkripce Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 3. acetylace histonů  aktivace transkripce3. acetylace histonů  aktivace transkripce 56 Linie HL‐60:Linie HL‐60: • lidská myeloidní leukémie • spontánní diferenciace: • lidská myeloidní leukémie • spontánní diferenciace:• spontánní diferenciace: asi 10 % buněk populace • spontánní diferenciace: asi 10 % buněk populace • induktory granulocytární diferenciace: kyselina all trans retinová (ATRA) • induktory granulocytární diferenciace: kyselina all trans retinová (ATRA)kyselina all‐trans retinová (ATRA) dimethylsulfoxid (DMSO) • induktory monocyto/makrofágové diferenciace: kyselina all‐trans retinová (ATRA) dimethylsulfoxid (DMSO) • induktory monocyto/makrofágové diferenciace:• induktory monocyto/makrofágové diferenciace: phorbolmyristyl acetát (PMA) 1 25‐dihydroxyvitamin D • induktory monocyto/makrofágové diferenciace: phorbolmyristyl acetát (PMA) 1 25‐dihydroxyvitamin D Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 1,25‐dihydroxyvitamin D31,25‐dihydroxyvitamin D3 57 Diferenciace linie HL‐60 do stádia granulocytů:Diferenciace linie HL‐60 do stádia granulocytů: Induktor: 1mM kyselina all‐trans retinová Marker: CD‐66b (CD‐67) Induktor: 1mM kyselina all‐trans retinová Marker: CD‐66b (CD‐67)( ) Detekce: anti‐CD66b, SwAM‐FITC ( ) Detekce: anti‐CD66b, SwAM‐FITC Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 58 Granulocytární diferenciace HL‐60: flow cytometrie / CD66bGranulocytární diferenciace HL‐60: flow cytometrie / CD66b 18,26% 33,25% 33,28% 1mM ATRA1mM ATRA 1mM ATRA + 13mM CA1mM ATRA + 13mM CA 1mM ATRA + 52mM CA1mM ATRA + 52mM CA 59 Diferenciace linie HL‐60 do stádia makrofágů:Diferenciace linie HL‐60 do stádia makrofágů: Induktor: 1,6 nM phorbolmyristyl acetát (PMA) M k CD 14 Induktor: 1,6 nM phorbolmyristyl acetát (PMA) M k CD 14Marker: CD‐14 Detekce:Detekce: antianti‐‐CD14, SwAMCD14, SwAM‐‐FITCFITC Marker: CD‐14 Detekce:Detekce: antianti‐‐CD14, SwAMCD14, SwAM‐‐FITCFITC Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 60 Linie P19:Linie P19:Linie P19:Linie P19: • myší embryonální karcinom • myší embryonální karcinom  • 7denní embryo do testes • „embryoid bodies“ (EB) • 7denní embryo do testes • „embryoid bodies“ (EB) • induktory mesodermální diferenciace:• induktory mesodermální diferenciace:• induktory mesodermální diferenciace: kyselina all‐trans retinová (ATRA) dimethylsulfoxid (DMSO) • induktory mesodermální diferenciace: kyselina all‐trans retinová (ATRA) dimethylsulfoxid (DMSO)dimethylsulfoxid (DMSO) • induktor neuronální diferenciace: kyselina all‐trans retinová (ATRA) dimethylsulfoxid (DMSO) • induktor neuronální diferenciace: kyselina all‐trans retinová (ATRA) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. kyselina all‐trans retinová (ATRA)kyselina all‐trans retinová (ATRA) 61 Schéma diferenciace buněk P19Schéma diferenciace buněk P19 metoda kultivace na  bakteriologických miskách metoda kultivace na  bakteriologických miskách metoda „visících kapek“ (hanging drops) metoda „visících kapek“ (hanging drops) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 62 Mesodermální diferenciace buněk P19:Mesodermální diferenciace buněk P19: Induktor: 0,8% DMSO Marker: myosin II Induktor: 0,8% DMSO Marker: myosin IIMarker: myosin II Detekce:Detekce: antianti‐‐skeletal myosin, SwAMskeletal myosin, SwAM‐‐FITCFITC Marker: myosin II Detekce:Detekce: antianti‐‐skeletal myosin, SwAMskeletal myosin, SwAM‐‐FITCFITC 63 ATRA – 1.denATRA – 1.den DMSO – 2.den DMSO – 2.den  50 mm 100 mm ATRA – 4.denATRA – 4.den DMSO – 4.denDMSO – 4.den 160 mm 50 mm 64 Neuronální diferenciace buněk P19:Neuronální diferenciace buněk P19: Induktor: 1mM kyselina all‐trans retinová (ATRA) Marker: neurofilamin Induktor: 1mM kyselina all‐trans retinová (ATRA) Marker: neurofilamin Detekce:Detekce: antianti‐‐neurofilament 160, SwAMneurofilament 160, SwAM‐‐FITCFITCDetekce:Detekce: antianti‐‐neurofilament 160, SwAMneurofilament 160, SwAM‐‐FITCFITC 65 Praktické využití indukované diferenciace: • základní výzkum Praktické využití indukované diferenciace: • základní výzkum • diferenciační terapie v onkologii → hematologické malignity (APL AML) • diferenciační terapie v onkologii → hematologické malignity (APL AML)→ hematologické malignity (APL, AML) → vybrané typy solidních nádorů (neuroblastom) • diferenciační terapie v dermatologii → hematologické malignity (APL, AML) → vybrané typy solidních nádorů (neuroblastom) • diferenciační terapie v dermatologii• diferenciační terapie v dermatologii → akné ří b ěč ý h d i átů i it • diferenciační terapie v dermatologii → akné ří b ěč ý h d i átů i it• příprava buněčných derivátů in vitro• příprava buněčných derivátů in vitro Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 66 Retinoidy jako induktory diferenciace v klinické praxi:Retinoidy jako induktory diferenciace v klinické praxi: Roaccutane (isotretinoin, 13‐cis‐RA) Roaccutane (isotretinoin, 13‐cis‐RA) Vesanoid  (tretinoin, all‐trans‐RA) • akné, neuroblastom• akné, neuroblastom • akutní leukemie Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 67 COMBAT léčba solidních nádorů (meduloblastom , neuroblastom, sarkomy...)( , , y ) celecoxib inhibitor cyclooxygenázy antiangiogenní účinek etoposid inhibitor topomerázy II zástava b. cyklu temozolomid alkylační činidlo apoptóza kys. retinová  diferenciační činidlo diferenciace/apoptóza  Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4. 68 Teoretické modely diferenciční terapieTeoretické modely diferenciční terapie • přímá diferenciace nádorové buňky • oprava onkogenního mechanismu vede k původní diferenciaci • přesměrování“ na prekurzor  jiná diferenciační dráha • přímá diferenciace nádorové buňky • oprava onkogenního mechanismu vede k původní diferenciaci • přesměrování“ na prekurzor  jiná diferenciační dráha• „přesměrování  na prekurzor   jiná diferenciační dráha• „přesměrování  na prekurzor   jiná diferenciační dráha Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie ‐ jaro 2013 ‐ 07 / 3.4.