C4182
Biochemie II
06-Katabolismus bílkovin a aminokyselin
FRVŠ 1647/2012
2/8/2013
1
Petr Zbořil

Obsah
•Odbourávání bílkovin a aminokyselin.
•Rozdělení a význam proteas, specifita proteas.
•Trávení
•Ubikvitinový proces
2/8/2013
Petr Zbořil
2

Katabolismus bílkovin
•Metabolismus bílkovin – význam a průběh
odegradace a syntéza, poločas života (HSA 20-25 dní)
orovnováha – dusíková bilance + 0 -
onadbytečné bílkoviny se neukládají, není speciální zásobní forma (ale lze některé takto využít)
• Katabolismus
oHydrolýza peptidové vazby
oHydrolasy - peptidasy, proteasy
•
•X-NH-CH-CO-NH-CH-CO-Y  + H2O  =  X-NH-CH-COOH  +  NH2-CH-CO-Y
•
•          Ra               Rb                     Ra                           Rb
•
2/8/2013
Petr Zbořil
3

Katabolismus bílkovin
•Enzymy
•– C-N hydrolázy, peptidázy
•Místo hydrolýzy
oendopeptidázy (pepsin, trypsin, chymotrypsin, kathepsin) – peptidy
oexopeptidázy (karboxy-, amino-, di-) – štěpí peptidy
osekvence endo- pak exopeptidázy
•Pojem substrátové specificity
ookolí štěpené vazby, později i další
oaromatické Aacyly – pepsin, chymotrypsin
obazické Aacyly – trypsin
•Lepší hydrolýza denaturovaných bílkovin (trávení)
•Mechanismus
ospecificita
okonstrukce aktivního centra
•Serinové proteázy
•-SH proteázy
•Metaloproteázy
•Kyselé proteázy
•
2/8/2013
Petr Zbořil
4

Katabolismus bílkovin
•
•Místo výskytu
oIntracelulární
oextracelulární
•Význam hydrolýzy bílkovin
otrávení – trávicí trakt
ořízená úprava syntesovaných bílkovin do funkční formy - maturace
ořízená degradace nepotřebných bílkovin v buňce – proteasom
•
2/8/2013
Petr Zbořil
5

Katabolismus bílkovin
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•Trávení bílkovin v trávicím traktu
2/8/2013
Petr Zbořil
6

Katabolismus bílkovin
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•Značení (ubikvitace) a degradace bílkovin v proteasomu
2/8/2013
Petr Zbořil
7

Katabolismus bílkovin
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•Řízená degradace bílkovin v ubikvitinové dráze - model proteasomu
2/8/2013
Petr Zbořil
8

Katabolismus bílkovin
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•
•Ubiquitinylace bílkoviny určené k degradaci v proteasomu, koncový Gly-COOH se váže na Lys
izopeptidovou vazbou.
2/8/2013
Petr Zbořil
9