Molekulární ekologie_ JS 2014					
Datum	Kdo	Téma			
2/20/2014	J. Bryja	Přednáška odpadá			
2/27/2014	J. Bryja	"Co je a co není molekulární ekologie?
Vymezení oboru, překryv s jinými obory, stručná historie
Genetická variabilita v přírodních populacích, hlavní používané terénní a laboratorní metody 
Sběr a uchování vzorků, metody zjišťování genetického polymorfismu u volně žijících živočichů, genetické markery
Genetická identifikace - kryptické druhy a hybridizace, identifikace jedince a pohlaví molekulárními metodami 
DNA barcoding, fixovaný polymorfismus, genetický fingerprinting, CHD geny u ptáků,  chromosom Y  u savců"			
3/6/2014	J. Bryja	"Aplikace molekulárních metod v behaviorální ekologii. Analýzy potravy. Určení otce, matky nebo obou dvou. Minimální počet rodičů vrhu nebo snůšky. Stanovení příbuznosti jedinců. 
Analýzy příbuzenských vztahů a párovacích systémů,  jednoduché vyloučení, categorical x fractional likelihood, přehled dostupných programů. Genetická identifikace disperze a migrace, sex-biased dispersal, assignment test. "			
3/13/2014	M. Macholán	"Rekonstrukce fylogeneze I.
Základní fylogenetické principy a programy pro analýzu DNA sekvencí. "			
3/20/2014	M. Macholán	"Rekonstrukce fylogeneze II.
Fylogenetické kontrasty a komparativní metody. Likelihood, Bayesiánské metody, koalescenční přístup."			
3/27/2014	M. Macholán	"Fylogeografie: genetická historie rozšíření druhu. 
Výhody mitochondriální DNA a její alternativy (Y chromosom), refugia a kolonizační cesty, genetický drift vs. tok genů, fylogeografie a koevoluce"			
4/3/2014	M. Macholán	"Hybridizace v přírodě, hybridní zóny 
Konstrukce kliny, selekce proti hybridům, rozdíly v introgresi různých částí genomu. "			
4/10/2014	J. Bryja	"Geny a jejich biologická funkce - příklady funkčních genů a jejich význam v ekologii
Adaptivní variabilita, imunogenetika, geny a komunikace (MHC, MUPs, ABP), analýza selekce na molekulární a populační úrovni, transkriptomika v ekologii"			
4/17/2014	J. Bryja	"Populační genetika I: genetická diversita, příbuznost, inbreeding 
Důsledky Hardy-Weinbergova pravidla, změny alelických frekvencí (mutace, migrace, selekce, velikost populace, genetický drift), příklady s využitím dostupných programů"			
4/24/2014	J. Bryja	"Populační genetika II: populační struktura, analýzy toku genů 
Klasická populační genetika (F-indexy atd.), AMOVA. Bayesiánské klastrování (STRUCTURE), Landscape genetics"			
5/1/2014	Státní svátek				
5/8/2014	Státní svátek				
5/15/2014	J. Bryja	"Ochranářská genetika 
Neinvazivní genetické metody, probability of identity, odhady Ne, bottleneck, důsledky fragmentace populací, lokální adaptace, inbrední a outbrední deprese.  "			
					
Přednášející:	"Doc. Mgr. et Mgr. Josef Bryja, Ph.D. (bryja@brno.cas.cz)"				
	"Prof. RNDr. Miloš Macholán, CSc. (macholan@iach.cz)"