Seznam otázek k ústní zkoušce z předmětu Bi6721
1) Izolace nukleových kyselin – základní principy
2) Izolace nukleových kyselin z bakterií
3) Izolace nukleových kyselin z kvasinek
4) Izolace nukleových kyselin z fágů
5) Izolace plasmidové DNA
6) Spektrofotometrická analýzy nukleových kyselin
7) Stanovení koncentrace nukleových kyselin fluorometricky a kolorimetricky
8) Restrikční endonukleázy – definice, dělení, princip reakce
9) Izoschizomery, izokaudamery, relaxovaná specifičnost restriktáz a důsledky metylace DNA na
jejich aktivitu
10) Využití restrikčních endonukleáz v analýze mikroorganismů
11) Elektroforéza nukleových kyselin – principy
12) Typy elektroforéz
13) Využití elektroforézy v analýze DNA a RNA
14) Barvení elektroforetických gelů
15) Pulsní gelová elektroforéza
16) Chromatografie – základní principy, druhy chromatografických metod
17) Absorpční a rozdělovací chromatografie
18) Iontoměničová chromatografie
19) Gelová permeační chromatografie
20) Afinitní chromatografie
21) Využití chromatografie při izolaci nukleových kyselin
22) Využití chromatografie při analýze DNA
23) Maxamovo-Gilbertovo sekvenování
24) Sangerova metoda sekvenování
25) Pyrosekvenování
26) Nové přístupy k sekvenování
27) Sekvenování RNA
28) Sekvenování proteinů
29) Hybridizace – princip, způsoby provedení
30) Hybridizace v roztoku
31) Příprava značených sond
32) Hybridizace na pevném povrchu
33) Southernův přenos
34) Fluorescentní in situ hybridizace
35) Metoda polymerázové řetězové reakce – popis principu reakce
36) Navrhování primerů pro PCR
37) Technické provedení PCR
38) Fyzikální faktory ovlivňující PCR
39) Chemické faktory ovlivňující PCR
40) Obecné principy diagnostiky s využitím metody PCR
41) Diagnostické varianty PCR
42) Nested PCR
43) Inverzní PCR
44) Princip real-time PCR
45) Metody analýzy proteinů – metody separace, metody identifikace
46) Izoelektrická fokusace
47) Dvourozměrná elektroforéza
48) Plynová chromatografie v mikrobiologii
49) Hmotnostní spektrometrie
50) Protilátky jako základní detekční a identifikační nástroj
51) Western blotting
52) Imunoprecipitace a její aplikace v mikrobiologii
53) Imunocytochemie a imunohistochemie v mikrobiologii
54) Průtoková cytometrie
55) Základní informace o využití internetových zdrojů při studiu mikroorganismů
56) Principy posuzování podobnosti sekvencí nukleových kyselin a proteinů