Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 1 prof. RNDr. Renata Veselská, Ph.D., M.Sc. RNDr. Jakub Neradil, Ph.D. Ústav experimentální biologie Přírodovědecká fakulta MU STUDIUM BUNĚK V PODMÍNKÁCH IN VITRO Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 2  vývoj kultivací živočišných buněk v podmínkách in vitro  podmínky kultivace savčích/lidských buněk in vitro  kultivační postupy  typy kultivací (terminologie)  vlastnosti normálních a transformovaných buněčných linií  praktické aplikace  archivace, sbírková pracoviště Program přednášky: Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 3 VÝVOJ KULTIVACÍ ŽIVOČIŠNÝCH BUNĚK V PODMÍNKÁCH IN VITRO Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 4  1907: kultivace nervových vláken izolovaných z žabích embryí (Harrison)  1912: explantáty kuřecí pojivové tkáně a srdeční svaloviny (Carrel; Burrows)  1916: trypsinizace a pasážování (Rous & Jones)  1943: stabilizace první buněčné linie - myší fibroblasty: L-cells (Earle et al.)  1948: první buněčný klon: L929 (Sanford et al.)  1952: stabilizace první lidské linie - karcinom děložního krčku: HeLa (Gey et al.) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 5 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 6 1952 - stabilizace první lidské linie HeLa (Gey et al.)  karcinom děložního krčku  Henrietta Lacks (1920-1951)  Johns Hopkins University Hospital (Baltimore, USA) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 7 Linie HeLa: Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 8 mikrotubuly (anti-Tu) mikrofilamenta (phalloidin) jádra (DAPI) Linie HeLa: Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 9 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 10 PODMÍNKY KULTIVACE SAVČÍCH / LIDSKÝCH BUNĚK IN VITRO Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 11 Kultivační podmínky pro savčí a lidské buňky  co nejpodobnější podmínkám v původním organismu:  teplota 37oC,  maximální vlhkost vzduchu, 5% CO2  neutrální pH (6,8 až 7,2)  živiny  sterilní prostředí Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 12 STABILNÍ PROSTŘEDÍ PRO KULTIVACE CO2 inkubátory  definovaná stabilní teplota (37oC)  maximální vlhkost vzduchu  definovaný stabilní obsah CO2 (5%), příp. i O2 (řízená hypoxie)  vodní nebo vzduchový plášť  vnitřní povrch: měď nebo nerez  připojení tlakových lahví přes redukční ventily Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 13 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 14 Bazální médium  tekuté nebo práškové  soli, aminokyseliny, vitamíny, lipidy, zdroj energie, indikátor pH + krevní sérum / růstové faktory Kompletní médium ŽIVNÉ MÉDIUM Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 15 Voda pro tkáňové kultury:  ultrapure type I - resistivita < 18 MΩ/cm  TOC (total organic carbon) < 10 ppb (parts per bilion) Úprava vody pro tkáňové kultury:  reverzní osmóza  absorbce na aktivní uhlík  iontoměniče  elektrodeionizace  UV záření Složení bazálního média Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 16 Vyvážené solné roztoky = BSS (balanced salt solutions):  udržování pH a osmolality  udržování membránového potenciálu buněk  kofaktory enzymů  tvorba fokálních adhezí (růst na pevném substrátu)  ionty: Na+, K+, Mg2+, Ca2+, Cl-, SO4 2-, PO4 3-, HCO3  stopové prvky: Fe, Zn, Cu, Se … Hlavní typy BSS: DPBS (Dulbecco's phosphate-buffered saline) HBSS (Hank's balanced salt solution) EBSS (Earle's balanced salt solution) ESSS (Eagle's spinner salt solution) Složení bazálního média Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 17 Pufrovací systém:  NaHCO3, HEPES (N-2-hydroxyethylpiperazine-N’-2-ethanesulphonic acid) Aminokyseliny:  esenciální, resp. vzácné (člověk, myš): arginin, histidin, isoleucin, leucin, lysin, methionin, fenylalanin, threonin, tryptofan, valin  in vivo syntetizované ve specifických orgánech (játra, resp. ledviny): cystein, glutamin, tyrosin  lze nahradit hydrolyzátem z proteinů (krátké peptidy) Složení bazálního média Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 18  voda  anorganické sloučeniny (ionty, stopové prvky)  aminokyseliny ----------------------------------------------------------------  vitamíny (zejména skupina B)  lipidy (esenciální mastné kyseliny, cholesterol…)  hormony (inzulín, hydrokortizol)  glukóza (zdroj energie)  fenolová červeň (indikátor pH)  antibiotika (penicilin + streptomycin) Složení bazálního média Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 19 Many modifications of Eagle’s Medium have been developed since the original formulation appeared in the literature. Among the most widely used of these modifications is Dulbecco’s Modified Eagle’s Medium (DMEM). DMEM is a modification of Basal Medium Eagle (BME) that contains a 4-fold higher concentration of amino acids and vitamins, as well as additional supplementary components. The original DMEM formula, first reported for culturing embryonic mouse cells, contained 1,000 mg/L of glucose. An alteration with 4,500 mg/L glucose is optimal in cultivating certain cell types. Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 20 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 21 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 22 Krevní sérum  fetální telecí/hovězí - FCS/FBS, koňské, lidské...  nedefinovaná směs růstových faktorů a dalších složek  obsah v médiu 5 - 20% podle typu buněk  bezsérová média pro speciální aplikace (definovaná směs růstových faktorů - tzv. serum replacement) Nejdůležitější látky obsažené v séru:  růstové faktory  albumin  transferrin  anti-proteázy (antitrypsin, macroglobulin)  attachment factors (fibronectin, laminin) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 23 Výhody použití séra:  směs nejdůležitějších faktorů pro přežívání a proliferaci buněk  univerzální použití pro kultivaci většiny buněčných typů  ochrana buněčné kultury před výkyvy prostředí a toxickými vlivy (změny pH, ionty těžkých kovů, endotoxiny, proteolytické enzymy) Nevýhody použití séra:  potíže s reprodukovatelností (původ zvířat, krmení, roční doba…)  riziko kontaminace  dostupnost a cena  vliv na produkci proteinů do média Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 24 Typy médií pro savčí buňky:  Eagleovo médium (BME) a jeho modifikace (např. EMEM, AMEM, DMEM, GMEM, JMEM)  RPMI média (např. RPMI 1629, RPMI 1630, RPMI 1640)  další média užívaná se sérem (např. Fischerovo, Williamsovo)  média užívaná bez séra (TC199, MCDB) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 25  práce v tzv. laminárních boxech (HEPA filtry) typ podle úrovně Biosafety Level (BSL)  jednorázový plastik (sterilizováno radiací)  sterilní sklo, nástroje a roztoky (horkovzdušná sterilizace, autoklávování)  antibiotika (běžně směs Pen/Str, případně gentamycin, amphotericin, nystatin) STERILNÍ PROSTŘEDÍ Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 26 BSL-1  mikroorganismy, které nezpůsobují onemocnění u zdravých dospělých; standardizované lidské a živočišné buněčné linie BSL-2  běžné patogeny středního rizika, mohou způsobovat různě závažná onemocnění, která lze dobře léčit (HBV, Salmonella, Toxoplasma, klinický materiál - krev, tělní tekutiny, tkáně; některé sbírkové linie - např. HeLa) ÚROVNĚ BIOLOGICKÉHO RIZIKA = BIOSAFETY LEVELS (BSLs) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 27 Laminární box - biohazard třída I horizontální vertikální Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 28 HEPA filtry (částice > 0,3 mm) Laminární box - biohazard třída II Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 29 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 30 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 31 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 32 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 33 BSL-3  lokální nebo exotické patogeny vysokého rizika, respiračně přenosné, způsobují závažná a potenciálně letální onemocnění, která jsou obtížně léčitelná  Mycobacterium tuberculosis, virus encefalitidy St. Louis, antrax BSL-4  extrémně rizikové patogeny, respiračně přenosné, způsobují letální onemocnění, proti nimž neexistuje léčba ani vakcinace  hemorrhagické viry (Ebola, Marburg) ÚROVNĚ BIOLOGICKÉHO RIZIKA = BIOSAFETY LEVELS (BSLs) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 34 BIOSAFETY LEVEL 3 (BSL-3) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 35 BIOSAFETY LEVEL 4 (BSL-4) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 36 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 37 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 38 (Treated for cell culture) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 39 Cell factories Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 40 Typy kontaminací  mykoplazmata  viry  bakterie, plísně, kvasinky  kontaminace jinou buněčnou linií (cross-contamination) – autentizace linií (!!!) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 41 Kontaminace – mykoplazmata Detekce mykoplazmat: a) fluorescenční mikroskopie (značení DNA) b) PCR – specifické primery Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 42 Autentizace linií Profil STR (short tandem repeats): • srovnání se sbírkou nebo jiným vzorkem Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 43 KULTIVAČNÍ POSTUPY Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 44 invertovaný mikroskop Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 45 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 46 Typy buněčných kultur:  adherované: rostou přichycené na pevném podkladu  suspenzní: rostou volně v médiu Kultivace na živné vrstvě (feeder-layer):  obvykle inaktivované myší buňky (fibroblasty, peritoneální makrofágy)  hybridomy, embryonální kmenové buňky Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 47 Suspenzní kultury  odstranění starého média centrifugací  naředění buněk v čerstvém médiu  přenesení do nové kultivační lahvičky/misky s čerstvým médiem Adherované buňky  odstranění starého média, oplach v pufru  uvolnění buněk z podkladu proteolýzou fokálních adhezí (trypsin / EDTA/ accutase)  inaktivace trypsinu přidáním séra  alternativa: mechanické uvolnění (škrabky)  centrifugace, naředění buněk v čerstvém médiu  přenesení do nové kultivační lahvičky/misky s čerstvým médiem SUBKULTIVACE (PASÁŽOVÁNÍ) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 48 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 49 TYPY KULTIVACÍ (TERMINOLOGIE) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 50 TKÁŇOVÉ KULTURY / CELL CULTURES  orgánová/tkáňová kultura (organ/tissue culture) trojrozměrná kultura nerozvolněné tkáně, která si uchovává histologické znaky a vlastnosti původní tkáně v prostředí in vivo  buněčná kultura (cell culture) kultura odvozená z jednotlivých buněk, které už nejsou spojeny do struktury tkáně  primokultura / primární kultura (primary culture) buňky v kultuře jsou získány přímo z původní tkáně nebo fragmentu orgánu primární buňky, primární linie Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 51primokultura multiformního glioblastomu - 5. den Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 52primokultura multiformního glioblastomu - 12. den Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 53primokultura multiformního glioblastomu - 12. den Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 54 Buněčná linie  populace buněk odvozená z primokultury při první pasáži a dále udržovaná v podmínkách in vitro (pasáž = přenos buněk z jedné kultivační nádobky do nádobky nové)  diploidní (normální nenádorové buňky)  stabilizovaná (nádorově transformované buňky)  charakterizace buněčné linie: označení (název), druh organismu, pohlaví, věk, výchozí orgán, typ kultury, počet pasáží, růstové parametry, morfologie, karyotyp, markery Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 55 Buněčný kmen  buněčná populace, získaná subkultivací z původní linie - vyselektována na základě exprese určitého znaku Buněčný klon  buněčná populace, vzniklá pomnožením jediné buňky, izolované z původní linie  všechny buňky v buněčném klonu teoreticky identické, avšak v praxi určitý stupeň heterogenity Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 56 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 57 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 58 NORMÁLNÍ A TRANSFORMOVANÉ BUNĚČNÉ LINIE Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 59 Růstové parametry buněčných linií:  generační doba období mezi dvěma mitózami = délka buněčného cyklu  population doubling time (PDT) čas, potřebný ke zdvojnásobení počtu buněk v populaci  lifespan (délka života) geneticky naprogramovaný počet dělení buňky  kontaktní inhibice zástava proliferace po dosažení určité limitní saturační density Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 60 Kontaktní inhibice Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 61 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 62 Diploidní buněčné linie:  normální nenádorové buňky  omezená délka života in vitro  standardní karyotyp (diploidní)  obvykle anchorage-dependent (vyžadují podklad k přichycení = náhrada ECM)  schopnost kontaktní inhibice  tzv. "stárnutí kultury" = změna morfologie a růstových parametrů se vzrůstající dobou v podmínkách in vitro  LEP (lidské embryonální plíce) HPLC (lidské lymfocyty periferní krve) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 63 Stabilizované buněčné linie:  nádorově transformované buňky  neomezený generační potenciál = nesmrtelnost v podmínkách in vitro  kratší PDT, redukovaná závislost na podkladu  obvykle heteroploidní, resp. aneuploidní  často bez schopnosti kontaktní inhibice  lidské adherované: HeLa, A431, MCF-7, Saos-2… lidské suspenzní: HL-60, Jurkat, HeLa-S… L929, 3T3 (myší fibroblasty), CHO (chinese hamster ovary) MDCK (Madine-Darby canine kidney) VERO (African green monkey kidney) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 64 Rozdíl v počtu chromosomů během kultivace normální buňky (gliové buňky) transformované buňky (maligní melanom) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 65 PRAKTICKÉ APLIKACE Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 66  základní výzkum (buněčná biologie, cytogenetika, onkologie, imunologie, biochemie, molekulární biologie, virologie…)  prenatální diagnostika  toxikologie (testy léčiv, kosmetických přípravků, implantátů  reprodukční medicína (IVF)  klinická onkologie (typizace nádorů, testování multidrug resistance, hodnocení markerů)  výroba očkovacích látek (virové vakcíny)  průmyslová výroba specifických buněčných produktů (transgenní linie)  regenerativní medicína (příprava buněčných a tkáňových derivátů) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 67 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 68 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 69 Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 70 KRYOKONZERVACE, ARCHIVACE, SBÍRKOVÁ PRACOVIŠTĚ Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 71 Kryokonzervace živočišných buněk  kultura v exponenciální fázi růstu  po trypsinizaci resuspendování v zamražovací směsi: 90% sérum (FCS) + 10% kryoprotektivum (DMSO, glycerol)  dvoustupňové zamražování: "pomalý krok" (optimální pokles o 1oC za minutu) "rychlý krok" (přemístění kryoampulí z -80oC do - 150oC (hlubokomrazící boxy) nebo do -196oC (kontejnery s tekutým dusíkem)  rozmražování: nejprve rychlé ohřátí (rozmražení směsi), pak pomalé přidávání vychlazeného média (cca 1ml za minutu) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 72 Příklady kryoprotektiv: glyceroldimethylsulfoxid (DMSO) Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 73 Vliv rychlosti zamražování na přežití buněk: Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 74 American Type Culture Collection (ATCC) https://www.lgcstandards-atcc.org/Products/All/CCL-2.aspx Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 75 European Collection of Authenticated Cell Cultures (ECACC) https://www.phe-culturecollections.org.uk/products/celllines/generalcell/detail.jsp?refId=93021013&collection=ecacc_gc Bi8120 Aplikovaná buněčná biologie / 01 / 20.2.2017 76