EXTRACELULÁRNÍ VEZIKULY V KONTEXTU KARCINOGENEZE RNDr. Vendula Hlaváčková Pospíchalová, Ph.D. pospich@sci.muni.cz Oddělení fyziologie a imunologie živočichů 14. 5. 2024 Úvod k extracelulárním vezikulům (=EV) • EV jsou malé váčky ohraničené dvojitou lipidovou membránou, které jsou uvolňovány ze všech živých buněk do jejich okolního prostředí. • Historicky pojmenovávány různě, což vedlo k chaosu v oboru • 2011 – založení ISEV (International Society for Extracellular Vesicles) – zastřešující termín EV EV v mezibuněčné komunikaci • Důležitá role - přenášejí informace a molekuly mezi buňkami a podílejí se na všech biologických procesech, včetně imunitní odpovědi, regenerace tkání i patologických procesech jako je karcinogeneze • EV obsahují různé druhy bioaktivních molekul • Lipidy (fosfolipidy a cholesterol) • Proteiny (membránové proteiny, enzymy, receptory a signalizačních molekuly) • Nukleové kyseliny (DNA, RNA a mikroRNA) • Sacharidy a další metabolity • Které mohou ovlivňovat chování a funkci cílových buněk Klinický význam EV • Zrcadlo mateřské buňky - EV prostřednictvím svého komplexního složení odrážejí identitu a aktuální stav buňky, ze které vznikly, • EV cirkulují v tělních tekutinách • EV dokáží ovlivňovat funkce a fenotypy ostatních buněk. • Tyto vlastnosti naznačují silný biomarkerový a terapeutický potenciál, což vyvolává široký zájem o studium EV https://doi.org/10.3389/fonc.2020.580874 Historie EV doi: 10.1002/jev2.12144. Definice EV • Současně platné směrnice v oboru: • Minimal information for studies of extracellular vesicles (MISEV2023): from basic to advanced approaches • EV jsou částice uvolňované z buněk, které jsou ohraničeny lipidovou dvojvrstvou a nejsou schopny se samy replikovat www.isev.org https://www.isev.org/misev2023 Typy EV https://doi.org/10.1038/ s41577-022-00763-8 • Exosomy – vznikají z endosomálního kompartmentu, tzv. multivesikulárníc h tělísek (MVB – multivesicular bodies) • Ektozomy (dříve mikrovezikuly, mikropartikule) – vznikají pučením z cytoplasmatické membrány 1.Exosomy - uvolňované exocytózou multivesikulárních těl (MVBs) a amfisomů (ty vznikají fúzí autophagosomů a MVB). 2.Ektosomy: Vznikají pučením a vypouklým odlučováním plazmatické membrány, 1. Malé EV: 2. Mikrovezikuly: Středně velké EV. 3. Apoptotická tělíska: Větší EV uvolňované během apoptózy. 4. Viry: Uvolňované z plazmatické membrány ve formě en bloc jsou podobné MVB 5. Onkosomy: Velké EV produkované nádorovými buňkami. 6. Migrasomy: Uvolňované z migrujících buněk z konce dlouhých retrakčních vláken 7. Midbodies: Uvolňované po cytokinezi dělících se buněk. 8. Ciliární ektosomy: Uvolňované z plazmatické membrány cilií. 9. Apoptopodie: Uvolňují apoptotické buňky. 10.ENDs: Elongated neutriphil-derived structures – zbytky po rolujících neutrofilech v cévách 11.Ikkosomy: Vznikají z folikulárních dendritických buněk 12.TMPs: T-cell microvilli particles – součástí imunologické synapse 13.Exofery: Velké EV visící na konci stopky, obsahující poškozené organelly a proteinové agregáty 14.Sekreční autophagosomy: Uvolňovány buňkami. Cargo EV • Uvnitř, v membráně i na povrchu (tzv. EV corona) • Povrch vs. Objem EV • Typické cargo nabohacené v EV + cargo odrážející buňku původu Cesty exosomů • Biogeneze v MVB (mutivesikulárních tělíscích) z ILV (intraluminální vesikuly) • Uvolnění do extracelulárního prostoru exocytózou • Pobyt v extracelulárním prostoru – např. tělní tekutiny • Interakce s cílovou buňkou • Přenesení informace/obsahu exosomů a důsledek pro cílovou buňku https://doi.org/10.1186/s12964-021-00730-1 Biogeneze exosomů 1) Internalizace carga endocytotózou z extracelulárního prostoru 2) sorting do časných endosomů 3) Vznik intraluminálních vesikulů (ILV) a sorting carga do nich 4) Maturace do pozdních endosomů/multivesilukárních tělísek (MVB) 5) Transport MVB k cytoplasmatické membráně 6) Tzv. dokování MVB a jejich fúze s cytoplasmatickou membránou 7) Uvolnění exosomů do extracelulárního prostoru exocytózou https://doi.org/10.1186/s12964-021-00730-1 Vznikají z ILV = intraluminální vesikuly ILV se tvoří invaginací membrány v MVB • 3 různé mechanismy – • ESCRT dráha • Syndecan-syntenin-ALIX dráha • Ceramidová dráha Selekce carga exosomů • ovliňují selekci carga exosomů https://do i.org/10.1 038/ s12276- 024- 01209-y Interakce s cílovou buňkou • Tzv. uptake exosomů • Hlavní mechanismy přenos informace: 1) Interakce ligandreceptor (přímá signalizace) 2) Membránová fúze (uvolnění carga do cytosolu) 3) Endocytóza a následný únik z endosomů/lysozo mů DOI: 10.5772/61186 DOI 10.15252/embj.2021109288 Role EV v kontextu karcinogeneze • Exosomální sekrece je klíčová pro rozvoj nádorových onemocnění • Inhibice produkce exosomů rakovinnými a buňkami nádorového stromatu vede k redukovanému růstu nádoru a snížené schopnosti metastázovat • Zapojení EV do všech aspektů karcinogeneze, od interakce mezi hostitelem a mikrobiotou, až po systémové účinky nádorů Zvýšená sekrece EV během karcinogeneze Vlivem na MVB např: • Hypoxie • Sníženého pH • Invaze • Chemoterapie Nádorové buňky: • SRC – stimulace Alix dráhy ILV • Rab31 – stimulace ceramidové dráhy • ARF6 – stimulace vzniku ektosomů DOI 10.15252/embj.2021109288 Změněné cargo EV během karcinogeneze DOI 10.15252/embj.2021109288 • Selektivní balení integrinů – role v tvorbě premetastatické niky - α6β4 a α6β1 - tropismus k plicím - αvβ5 - tropismus k játrům • onkoprotein EGFR – wt i mutovaný umožňuje parakrinní přenos aktivovaného EGFR na méně agresivní nádorové buňky a na endotelové buňky (pozitivní zpětná vazba s Rab31) • onkoprotein MET – podporuje metastáze EV podporují karcinogenezi mnoha způsoby • Pokračování na dalším snímku DOI 10.15252/embj.2021109288 EV - Organotropismus a premetastická niky (pmn) • Vliv povrchových receptorů jako jsou integriny a CEMIP na EV EV ve formování pmn • Přijetí EV stromálními a imunitními buňkami indukuje vytvoření pmn, která jsou silně přívětivá pro usazování a růst nádorových buněk • Hlavní změny spojené s tvorbou pmn: proliferace endotelových a lymfatických buněk, vaskulární permeabilita, rekruitment imunitních buněk, aktivace rezidentních imunitních buněk, remodelace ECM a metabolické reprogramování CAF a TAM • EV uvolněné primárním nádorem po chemoterapii a radioterapii se také podílejí na tvorbě pnm Využití EV v onkologii: 1. EV jsou ve všech tělních tekutinách a jejich cargo, které reaguje na karcinogenezi i terapii, může být rezervoárem biomarkerů využitelných k predikci typu rakoviny v raných stádiích a terapeutickým odpovědím 2. Přirozeně nízká toxicita a široké rozšíření EV v tkáních je činí žádoucími a autologními nosiči chemoterapeutik, genetického materiálu nebo zobrazovacích činidel (např. radiokontrastní látky), jsou slibnější než liposomy 3. EV jako terapeutický cíl - cílená produkce a uptake EV pro management nádorových onemocnění EV jsou slibnými nanonástroji v onkologii Next generation technology: A world in which cancer diagnosis is possible from a simple blood draw. (Credit: Exosomics Siena S.p.A. via www.exosomics.it/technology) Biomarkery EV definují různé lidské nádory • Hoshino et al., 2020, Cell 182, 1044–1061 • Proteomické profily EV ze 426 lidských vzorků • Identifikace univerzálních markerů EV • Charakterizace markerů EV odvozených z nádorů v lidských tkáních a plazmě • Proteiny EV mohou být užitečné pro detekci rakoviny a určení jejího typu • Další studie identifikovaly specifické proteiny EV, které mohou mít prognostickou a prediktivní hodnotu pro detekci nádoru, progrese a terapeutickou odpověď Tekuté biopsie • Využití EV z tělních tekutin jako prediktivních markerů, typu nádorového onemocnění a stadia nemoci je zvláště důležité v případě absencí tkáňových biopsií • Také pro screenování populace ve velkém měřítku Výhody a nevýhody EV v tekutých biopsií • Nutnost izolace čisté populace EV • Časová i finanční náročnost izolace, separace a charakterizace EV • Značná inkonzistence výsledků vlivem různých metod • Nedostatečná znalost biologie EV Výhody Nevýhody • EV obsahují nabohacené biomarkery v krvi v podstatně vyšších koncentracích a dříve během karcinogeneze než cirkulující nádorové buňky (CTC) nebo nádorové antigeny • Vývoj mikrofluidních zařízení představuje slibnou alternativu - není nutná izolace EV www.biotium.org Non-vesicular extracellular particles (NVEP) • Nevesikulární extracelulární partikule • Multimolekulární sestavy, které jsou uvolňovány z buněk a nemají lipidovou dvojvrstvu: lipoproteinové částice (LPP), ribonukleoproteinové částice (RNP), viry nebo exomery a supermery. • NVEP a EV často mají překrývající se fyzikálně-chemické vlastnosti, a NVEP bývá v biologických matricích mnohem více než EV • Kolik je ve krvi EVs? 10^6 – 10^12/ml • Snahy o standardizaci • Směrnice MISEV2023 Veerman RE et al., Journal of Extracellular Vesicles, 2021 UC SEC Studium EV Mnoho výzev díky: • Malá velikost a velká heterogenita - EV se liší velikostí, obsahem a vlastnostmi v závislosti na biogenezi, původu a funkci. • Nedostatek standardizovaných metod pro izolaci a charakterizaci - různé izolační protokoly v závislosti na analýze nákladu. + Super-resolution microscopy Nomenklatura v praxi: EV ≠ exosom • MISEV2023 doporučuje používat obecný termín „extracelulární vezikuly“, případně jeho operační rozšíření (např. malé EV, CD63+ EV), které jsou odvozené od metody izolace/nabohacení EV • namísto nekonzistentně definovaných a někdy zavádějících termínů, jako jsou „exosomy“ a „ektosomy“, které jsou spojeny s cestami biogeneze a ex post (v komplexním vzorku jako je plasma, ale i kondiciované médium) je obtížné je stanovit, protože neznáme specifické markery pro subtypy EV Ukázka experimentu s EV Validace EV A) Kryo-elektronová mikroskopie - tvar a kontaminanty B) Dynamický rozptyl světla (MADLS) - velikost, polydispersita, koncentrace C) Western blot (WB) - markery EV + "negativní marker" D) Barvení celkových proteinů EV jako nosiče léčiv • Můžeme je například upravit tak, aby nesly specifické molekuly, jako jsou cytostatika či terapeutické miRNA, a efektivně je dopravily do cílových buněk. Tento přístup otevírá dveře pro další možnosti cílené terapie • Dietární EV (z mléka, ze zeleniny a ovoce a džusů) https://doi.org/10.1016/j.apsb.2022.05.002 https://doi.org/10.1016/j.ejpb.2017.07.010 Od základního výzkumu ke klinickým aplikacím • Základní výzkum týkající se izolace, standardizace a charakterizace EV přinese naplnění translačního potenciálu pro diagnostiku a terapii https://doi.org/10.1002/wnan.1835 Česká společnost pro extracelulární vezikuly zech ociety or E tracellular Vesicles @czesev.czsci.muni.cz/czesev czesev@sci.muni.czCzesev@CzeSEVCzesev