Adobe Systems
1
Petra Vašíčková
pvasickova@sci.muni.cz
Molekulární epidemiologie ve virologii potravin
http://jeromekahn123.tripod.com/sitebuildercontent/sitebuilderpictures/h5n1-virus.jpg 090620098687

Adobe Systems
Molekulární epidemiologie
2
•Snaha o dosledování vehikula/zdroje kontaminace
•Potvrzení/vyvrácení epidemiologických souvislostí
•Porovnání sekvencí genomu virových agens prokázaných u lidí × prostředí × potravin
•NoroNet × referenční sekvence
Ø
Here's How Norovirus Takes Hold in Your Gut — and Doesn't Let Go | Live Science

Adobe Systems
Molekulární epidemiologie
ØDosledování zdroje kontaminací, vehikula
ØPorovnání sekvencí specifických oblastí genomu prokázaných agens → potvrzení × vyvrácení zdroje
3

Adobe Systems
4
Molekulární epidemiologie
•Celogenomové sekvenování – klinický materiál (vysoká virová nálož)
•Sekvenace specifických oblastí genomu - vzorky prostředí (nízké koncentrace virů)
•
•https://www.rivm.nl/en/hevnet
•https://ictv.global/sg_wiki/hepeviridae/orthohepevirus
Tamura K, Stecher G, and Kumar S (2021) MEGA11: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version
11. Molecular Biology and Evolution 38:3022-3027.

Adobe Systems
Molekulární epidemiologie
5
Here's How Norovirus Takes Hold in Your Gut — and Doesn't Let Go | Live Science
•Dominance NoV GII
•
Ø
NoV GI
NoV GII

Adobe Systems C:\Users\MZ\Desktop\vse.png
G1
G2
G4
G3
•Lidské izoláty
•
•
•Prase domácí
▲Prase divoké, volnost
▀ Prase divoké, obory
Molekulární epidemiologie

Adobe Systems



Adobe Systems