Eva Gelnarová
Institut biostatistiky a analýz
MU
IBA
Curriculum vitae
Studium
•       Magisterské studium
Odborná matematika - matematická statistika MFF UK diplomová práce: Bioekvivalence
•       Doktorské studium - obor Onkologie
LFMU
Téma probíhající doktorské práce: Epidemiologie zhoubných nádorů v CR - prognostické modely a analýza rizikových faktorů
Zaměstnání
2004-dosud IBA
Výuka
•     Základy stochastického modelování
•     Analýza dat na PC - programovací jazyk R
(volně šiřitelný, statistický software)
Stochastické modely v chemii - Dose-response křivky
Toxicity chemických látek , buňky typu HELA
Hela type of cells, SL and CHL substance
	Est. ED50	Std. Error
SL	0.46	0.025
CHL	0.84	0.042
1.4
1.2
1.0
cd   0.8
03
O Q_ O)
0.4
0.2
0.0
	Est. SI	Std. Errort	p-value
SL/CHL	0.55	0.04	0.000
~l           I
0       0.02
-^-   SL -^-   CHL
I            I             I
0.05     0.1       0.2
Dose
n        r
0.5        1
Stochastické modely v ekologii - valenční křivky
•      Závislosti pravděpodobnosti výskytu organismu (0 =
nevýskyt,l= výskyt) na parametru prostředí x abundance
•      u je optimum^ je tolerance, a je parametr související s maximální hodnotou p(x)
•      p(x) je pravděpodobnost výskytu organismu za hodnot parametru prostředí x
log
P(x) l-p(x)
= b0 + bxx + b2x   = a -
(x-u)
a=3
Gaussian logit curves, u= 0, t= 1
Stochastické modely v onkológii - př. rakovina prostaty
Pacienti s rakovinou prostaty mají větší hladinu PSA v krvi.
Pravděpodobnost, že pacient bude trpět rakovinou v závislosti na hladině PSA.
PSA
Karcinom prostaty
<
o
Li
-400            -200
0 PSA
200             400
Stochastické modely v epidemiologii
•   Zdroj dat: Onkologické registry
•   Nejsou k dispozici (nebo pouze anonymizovane) individuální záznamy
•   Počet osob v riziku (osoboroky), N
•   Počet nových případů za časové období, 6
•   Pohlaví, region, stadium...
•   Věk diagnosy - (age - a, počet věkových skupin - A)
•   Datum diagnosy (period - p, počet period - P)
•   Datum narození (cohort - c, počet kohort -C = A-1+P)
> Umělá kohorta určená věkem a periodou:
c = p-a
Příklad: C50 - rakovina prsu
Pouze ženy
A=13 věkových skupin (30 let a více)
1977 - 2003, stratifikováno P=27
39kohort(C=P+A-l)

1880               1900
1920               1940               19
Date of birth
1985          1990         1995         2000         2005
Date of diagnosis
50             60            70            80
Age at diagnosis
Age-period-cohort model
ln(E[r..]) = ln(e../N^. ) = lt + ar + ß, + yjfc, E[r..] = 0.. / Ntf = exp(M) X exp(ccř) X exp(ß.) X exp(y,), (Lx - mean effect
ocz. - efekt věkové skupiny   různá rizika odpovídající různým věkovým skupinám ßj - efekt j -té periody
změny v incidenci, které jsou asociované se všemi věkovými skupinami yk - efekt k-té kohorty
Dlouhodobé zvyky
■
Motto
„Medicína se neřídí matematickými pravidly. Na příklad buňky se násobí dělením."