Inbriding
Koeficient inbridingu - redukce heterozygotů v populaci s inbridingem relativně k populaci s panmixií
H0 = 2pq
H = 2pq(l-F)
Četnosti jednotlivých genotypů:
AA:	P2(l-	- F) + pF =		= p2 +	pqF
Aa:				= 2pq	-2pqF
aa:				= q2 +	pqF
Inbriding
??? Kolikrát je vyšší pravděpodobnost objevení recesivního homozygota při příbuzenském sňatku při zadaném F? (např. F = 1/16, q = 0,01)
q2(l-F) + qF
Výpočet F z rodokmene, pravděpodobnost, že jsou alely identické původem.
F, = Z(1/2)'(1 + FA)
Součet všech možných cest vedoucích v rodokmenu k danému potomkovi.
i - počet jedinců na společné dráze (počet společných předků)
r = koeficient příbuznosti
r = 2F
F = V2 r
Koeficient inbridingu při samooplození
F, = K(1 + FM)
1 - Ft = panmiktický index
Panmiktický index v t-generaci:
1-Ft = (l/2)'(1-F0)
PŘIKLAD 34
V populaci rostlin se smíšeným oplozením platí, že dochází-li k samooplození (samosprášení) v podílu s, zatímco zbývající část rostlin v populaci se rozmnožuje náhodným oplozením (cizosprášením), pak koeficient F velmi rychle dosáhne hodnoty F = s/(2-s) (odvození - viz speciální literatura). U Phlox cuspidata byl stanoven podíl samooplození přibližně <s>=0,78; můžeme tedy vypočítat koeficient inbridingu <F>=0,78/(2-0,78)=0,64. V populaci P. cuspidata v Texasu byly nalezeny dvě alely genu fosfogIukomutázy-2 označované Pgm~2° a Pgm-2b . Ve vzorku 35 rostlin bylo nalezeno 15 Pgm-2a/Pgm-2a, 6 Pgm-2a/Pgm-2b a 14 Pgm-2h/Pgm-2b. Souhlasí tyto údaje s odhadem F=0,64? ( Pamatujte, že zde je pouze jeden stupeň volnosti pro x2, poněvadž z údajů je odhadována pouze alelová četnost; kdyby z těchto údajů bylo odhadováno také F, pak by počet stupňů volnosti byl nula a výpočet by nebyl možný. Zde je F odhadováno nezávisle ze stupně samooplození).
v/JW vpitou/
V    <** a

? Jaké budou počty při F = 0,64 ?


Hodnoty X pro pravděpodobnost P - 0,95 až 0,001 pro N = 1 až 30
N	0,95	0,90	0,80	0,70     0,50     0,30     0,10	0,05	0,02	0,01	0,001
í	0,004	0,016	0,064	0,15    0,46     1,07    2,71	3,84	5,41	6,64	10,83
2	0,1O3	0,21	0,45	0,71     1,39    2,41     4,61	5,99	7,82	9,21	13,82
3	0,35	0,58	1 ,01	1,42    2,37    3,67    6,25	7,82	9,84	11,34	16,27
4	0,71	" 1 ,06	1,65	2,20    3,36     4,88    7,78	9,49	11,67	13,28	18,47
5	1,15	* 1,61	2,34	3,00    4,35     6,06-   9,24	11,07	13,39	15,09	20,52
6	1,63	2,20	3,07	3,83    5,35    7,23 10,65	12,59	15,03	16,81	22,46
7	2..1?	2,83	3,82	4,67    6,35    8,38  12,02	14,07	16,62	18,48	24,32
8	2,73	3,49	4,59	5,53    7,34    9,52  13,36	15,51	18,17	20,09	26,13
9	3,32	4,17	5,38	6,39.   8,34  10,66  14,68	16,92	19,68	21,67	27,88
10	3,94	4,87	6,18	7,27    9,34  11,78  15,99	18,31	21,16	23,21	29,59
11	4,57	5,58	6,99	8,15  10,34   12,90  17,28	19,68	22,62	24,73	31 ,26
12	5,23	6,30	7,81	9,03  11,34  14,01   18,55	21 ,03	24,05	26,22	32,91
13	5,89	7,04	8,63	9,93  12,34  15,12   19,81	22,36 25,36		27,69	34,53.
H	6,5?	7,79	9,47	10,82 Í3,34  16,22 21,06	23,69	26,87	29,14	36,12
15	7,26	8,55	10,31	11,72  14,34   17,32  22,31	25,00	28,26	30,58	37,70
16	7,96	9,31	11,15	12,62  15,34   18,42 23,54	26,30	29,63	32,00	39,25
17	8,67	10,09	12,00	13,53  16,34 19,51   24,77	27,59	31 ,00	33,41	40,79
18	9,39	10,87	12,86	14,44  17,34 20,6.0  25,99	28,87	32,35	34,81	42,31
19	10,12 .	11,65	13,72	15,35  18,34  21,69 27,20	30,14	33,69	36,19	43,82
20	10,85	12,44	14,58	16,27  19,34   22,78 28,41	31,41	35,02	37, vr	45,32:
?il -~ Q/del> f ot tuh t 0/oo"f i - °£jj_
Inbriding
PRÍKLAD 35
V určité populaci Phlox cuspidata je F=0,64, Vypočtěte očekávané gcnotypové četnosti pro gen Adh za použití údajů z příkladu 17.




PŘIKLAD 17
V určité populaci Phlox cuspidata byly nalezeny čtyři alely genu pro alkoholdehydrogenazu označené Adh-1, Adh-2, Adh-3 a Adh-4 v četnostech 0,11; 0,84; 0,01 a 0,04. Jaké jsou očekávané Hardyho -Weinbergovy genotypové četnosti?
1 OcWfe   G&M»n/' erhoff) ^c &** 'i^h     Z 4ilfb(
MW k\h1

4= 9l$(it0ío4+o}oL?
{o. "I V ft, Mjfqrffa i i) - Mil!
*    L
2''tyf'-J//í *   fcW   -»ni
/- 0/9
*L+ty--W?ŕ/
7 ohťJt,   $4%*fy: knrofD ddh -1 = 6 fy
ddk-1 -4/í
-3  - fyôf
y   3
í
ŕ
4-- M-* ~ ^^
2-3
3 3
V £
i   ^
> 4
^l-ŕ jty>
H
Inbríding
${(3t9öf
PŘÍKLAD 36
Vypočtěte relativní riziko narození recesivně homozygotnich potomků ze sňatku bratrance se sestremcí z druhého kolena (F=l/64), jestliže četnost recesivní alely q =0,01, relativně k riziku při náhodném oplození.
ŕ    *—^—
t fit*'* t 4,n-<hrs         t   y
r------------------------- * JSĹf
tycoon                     f    '
?) fáufr fa ^r> \M$ jú-fm /Átrioví, ófyfro/íio
Inbriding
PŘIKLAD 37
Nakreslete rodokmen křížení bratr x sestra opakujícího se po dvě generace (CxD a ExG) a vypočtěte koeficient inbidingu jejich potomka I, za předpokladu, že žádný ze společných předků (A a B) není inbrední.
Žádný z předků není inbrední —► FA = 0
f\     I
11X11 ;x
C       h
íl X ff -'
e     c-
\ /
T «
F, = I(1/2)'(1+FA)
6 cest přenosu se 4 společnými předky
F! = I (1/2? (1+Fa)		
CröZ	(ý/l (%	f
£ D fl C ŕ	{m js	
C^wte	ŕ<Pi/£	
ŕ7)/Q^e-	ŕ^A	
fctjm	f^A	

F = 2(l/2)3 + 4(l/2)5 = 3/8   tj. 0,375
Inbríding