CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Lékařská a Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita <**"*/> Biostatistický seminář Valence a nika / Biostatistický seminář VI. Valence taxonů ♦ Odráží výskyt organismu v závislosti na prostředí ♦ Snažíme se získat průběh přítomnosti nebo abundance druhu na parametru/parametrech prostředí, tzv. křivku odpovědi druhu na prostředí (species response curve) ♦ Dvěma klasickými modely popisujícím závislost organismu na parametru prostředí jsou lineární model a jednovrcholová křivka závislosti (unimodal response curve). ♦ Základem výpočtu je získání parametrů rozložení z hodnot přítomnosti nebo abundance organismů ve vzorcích, výpočty vychází ze dvou základních zdrojů -výsledky regresní analýzy nebo výpočet založený na průměrování hodnot vzorků (tzv. weighted averaging). mu VÝUKA Ar CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Biostatistický seminář VI Unimodal response curve x7. očekávaná abundance druhu k ve vzorku i hodnota parametru prostředí pro vzorek i maximum křivky pro druh k optimum druhu k tolerance druhu, měřítko šířky křivky a ekologické amplitud Eyik = ck exP r v (*/ - uk) 2tl 2\ J Parametr prostředí (x) VÝUKA CBA CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Biostatistický seminář VI Weighted averaging 2> x. ii ^ *■ *.WA *=i Optimum U =----- kde y. je hodnota environmentálního parametru na lokalitě i x, je buď abundance nebo prezence/absence taxonu Tolerance tWÄ = 2>,(*,-Os i=\ n z^ i=\ VYUKA CßA CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Biostatistický seminář VI Logistická regrese I Rovnice závislosti (gaussian logit curve, v případě linear logit curve neobsahují rovnice kvadratický člen) výskytu taxonu na parametru prostředí má tvar log P(x) 1 - p(x) VAx-uy = bc + hx + b^x2 = a-——------ b0,bl9b2 jsou koeficienty vypočítané algoritmem logistické regrese, u optimum, t tolerance a je spjato s maximální hodnotou P, tj. Anax exp(60 +hx + b7x2) Po úpravě rovnice získáme tvar p =-------^7----------------^1 1 + exp(Z>0 + bxx + b2x j P je pravděpodobnost nálezu taxonu pro hodnotu x parametru prostředí a který umožní vykreslit graf závislosti výskytu taxonu na parametru prostředí. VÝUKA CBA CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Biostatistický seminář VI Logistická regrese II - Unimodal response curve Optimum u = -- t = 2b2 1 Tolerance f^~2 Maximální pravděpodobnost p =-------1—l------------, výskytu max i + exp(-*o-V-V2J Tyto vzorce předpokládají, že hodnota b2<0, jinak má křivka namísto maxima minimum. Problémy při nalezení optima nastávají, pokud optimum leží u hranice nebo dokonce za hranicí analyzovaných hodnot, v tomto případě by člen b2 měl být nastaven na 0 - místo gaussian logit curve získáme sigmoidní křivku neboli linear logit curve. VÝUKA »r CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ Biostatistický seminář VI Nika - velikost, překryv Levinova šíře niky B = m) p j proporce jedinců v sektoru j j Renkonens niche - překryv nik 1- / i ± ia y ja Pia proporce jedinců druhu i v sektoru a pia proporce jedinců druhu j v sektoru a VÝUKA CBA CENTRUM BIOSTATISTIKY A ANALÝZ