Peptidy

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

    Přírodní peptidy:

   Di        -          karnosin

                           anserin

   

   Tri        -          glutathion GSH

   

   

   

   

   Peptidové hormóny      -                      oxytocin

                                                              vasopresin

                                                              inzulin

                                                              glukagon

   

   Peptidové neuromodulátory     -          enkefaliny

                                                                                     endorfiny

   

   Peptidová  antibiotika              -          penicilín

                                                                          gramicidin

                                                                          valinomicin

                                                                          aktinomycin

                                                                        

   Peptidové fyto a zootoxiny                   -          neurotoxiny hadů štírů a včel

                                                                                     mikrocystiny

                                                                                     falloidin

                                                                                     amanitin

   Polypetidy                    -          protaminy       

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   INSULIN      

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   Struktura peptidové vazby

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   


   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   


   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   


   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   ANIMACE otáčení roviny peptidových vazeb

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

                  Ramachandranův diagram stability sekundárních struktur bílkovin

   

   


   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   D. Řetězec musí umožňovat maximální počet  vodíkových vazeb mezi peptidickými vazbami

   

   

   

    Typy sekundárních struktur :

   A. Pravidelné  - helikální struktury - a helix (-56, -47)

      - b struktury - skládaný list - paralelní (-139, +135)  a
                                                                antiparalelní (-119, +113)

   B. Ohybové - b ohyb

   C. Nepravidelné

   

   

   

   

   

   

   

   


   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   


   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   b-skládaný list – antiparalelní a paralelní

   

   


   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   Modely a-šroubovice

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   Schematická znázornění struktur skládaného listu a šroubovice

   

   

   

   

   

   

   

   

  

   

   

   

  

  

   

   

  

  

  

  

  

  

  

  

  

  Terciární struktura

   

   1.   Iontové interakce

   2.   Dipolové interakce

   3.   Vodíkové  můstky

   4.   Hydrofobní interakce

   5.   Bisulfidické můstky

   

   Strukturní motivy - domény

   

   


   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

  Kvarterní struktura

   

   Podjednotkové složení - nekovalentní spojení - vodíkové můstky

   -         kovalentní spojení - bisulfidické můstky

   

   

   

   KONFORMACE

   

   Skládání řetězce, principiální úloha primární struktury, vliv prostředí, změny konformace.

   

   Bílkovina v roztoku, chování, denaturace.

   Denaturace                -   fyzikální faktory - T, záření, tlak,

   - chemické faktory - pH, organická rozpouštědla,  detergenty, těžké kovy, močovina,

   

   reverzibilní - renaturace

   Denaturace

   ireverzibilní

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   Metody studia bílkovin:

   

   -         Isolace – metody dle smyslu (čisté nativní bílkoviny pro studium vlastností event.
   farmakologii, hrubé isolace pro průmysl apod.)

   

   -         Analýza – elfo, spektrální, RTG, NMR aj.

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   


   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   Funkce bílkovin a příklady:

   

   - strukturní

   - katalytická

   - transportní

   - signální

   - obranné

   

   

   

   

   

   Fibrilární bílkoviny (strukturní funkce):

   

   

   

   Skupina kolagenu:

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   Imunoglobulin G - prostorový model (A) a plošné schema (B).

   

   

   Antigen x Imunogen

   

   Funkce in vivo – přirozený systém

   

   -         část složitého mechanismu, funkce spíše signální, aglutinace (erytrocyty)

   -         indukovaná syntéza, energetická náročnost, regulace

   -         rozpoznávací schopnost, specificita

   -         kapacita

   -         poruchy

   

   

   Funkce aplikovaná

   

   -         imunoanalytické metody

   -         imunoseparace

   -         příprava protilátek – polyklonální, monoklonální

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   HEMOGLOBIN