ANALÝZA BIOLOGICKÝCH A KLINICKÝCH DAT © Institut biostatistiky a analýz IBA ■■ m Molekulární biologie a počítačová chemie Přelomová metoda v molekulární biologii j molekulární biologie a počítačová chemie jsou nejprogresivnější vědní obory dneška J „počítačová chemie" - příprava molekul na míru © Institut biostatistiky a analýz IBA y$J Analýza genomických dat Přelomová metoda v molekulární biologii j microarray technologie - sledování aktivity genů v buňkách J aplikace např. v onkológii - diagnostika, prognóza, základní výzkum J produkce rozsáhlých datových souborů, řada kroků matematické analýzy, složitá metodika hodnocení J dosud nový směr analýz, široké možnosti výzkumu i uplatnění *PROJ_class |PR0J_a11_topNNNg_9c fl_Sno meade by ! 7 meaje by Sno type select train golubnetj select.test goluta netl sample preparation microarray data analysis oligonucleotide array (Affymetrix) rVí1! r1^ tumour tissue v® oligonucleotide array (Rosetta/Agilent) 1 RNA isolation B > generation of (depending on array): cDNA array 1) biotinylated cRNA * hybridization 2) Cy3 and CyS labelled cRNA ■ wash 3) Cy3 and Cy5 labelled cDNA • scan predictive classifier • image analysis * identification of sig nifica nt genes • unsupervised cluster analysis * supervised classification • validation of predictive classifier * analysis of uncharactensed samplesl droptienes H *PROJ_sample merge by Sno PROJ_test_results M31SD rt. JDKtTat LITT3B-3t L1?2TS"3t wwwwww....... Sample © Institut biostatistiky a analýz IBA ■ IUI Analýza genomických dat II Our interest Statistical method Method task Inner data structure Identification of homogeneous groups * ? # Cluster analysis Sample differences Identification of differentially expressed genes lit x *** #* Hypotheses testing Prediction Identification of proper classification rule .. ? Classification procedures © Institut biostatistiky a analýz IBA Fylogenetika a fylogeograťie Modelování evolučních procesu ^ sledování příbuzenských vztahů taxonu J rekonstrukce evoluce druhu nebo genu © Institut biostatistiky a analýz IBA ■ M Aplikovaná analýza dat Analýza biologických a klinických dat j není důležité jaká data modelujete, ale jestli jim a problému rozumíte Projekt CORIS hodnocení kvality léčebné péče v hematoonkologii a onkológii Projekt UIRON aplikace umělé inteligence na analýzu onkologických dat & % % © Institut biostatistiky a analýz IBA ■ IUI Odhad počtu onkologických pacientů Populační prediktivní modely Vkládáno expertní skupinou + > Korigovaný odhad incidence po stadiích Odhad prevalence léčených pacientů po stadiích rimarne léčení paciei Přežívající z předchozích let a zároveň relabující/progredující progrese Scénář 1 (%) Scénář 2 (%) Scénář 3 (%) Scénář 4 (%) Scénář 5 (%) VYPOČET NÁKLADŮ Analýza nejistot © Institut biostatistiky a analýz íba ■' m Epidemiologie Závažná onemocnění, jejich rozložení v populaci a trendy J dlouhodobé rozsáhlé datové soubory - např. Národní onkologický registr J vývoj v minulosti, vliv diagnostiky a léčby na epidemiologické charakteristiky onemocnění J modelování rozšíření onemocnění v budoucnu J otevřený prostor pro vývoj predikčních metod a modelů incidence stádií v letech 1977-199' —-- — - ■ (Sir í»y-."'-". ' ■_. © Institut biostatistiky a analýz iBA ■ IUI www.svod.cz ISSN 18Ü2-8861 Publikace, zprávy »WWW odkazy Kalendář odborných akcí jpk » Onkologické časopisy q JK Služby pro novináře > Varování před dezinformací ► Vaše dotazy Správce portálu Další související projekty Epidemiologické analýzy^ INCIDENCE A MORTALITA n srovnaní se zahraničím Novinky na portálu regionální přehledy souhrnná prezentace VĚK PACIENTŮ Další analýzy k.± 04.01.2008 Aktualizace dat NOR za rok 2005 V epidemiologických analýzách jsou nyní k dispozici data NOR za obdobM977-2005. Webow portál epidemiologie zhubných nádorou u Slovenskej republike www.nor-sk.org B J Zpravodajství z portálu Harodni oroaram mamoarafickeho Tisková zpráva ke studii EUROCARE-4 24.08.2007- Vedení České onkologické společnosti se zásadné ohrazuje proti © Institut biostatistiky a analýz íba ■' m Analýza tvaru Specifický případ vícerozměrné analýzy J aplikace v antropologii, kriminalistice, medicíně i zoologii J řada výpočetně náročných postupů J oblast otevřená dalšímu vývoji matematických metod J dosud nový směr analýz, široké možnosti výzkumu i uplatnění iÉĹ v'V-1 k> ■ í © Institut biostatistiky a analýz JfiA ■ IUI zdravotnícka informatika © Institut biostatistiky a analýz IBA ■■ m Klinické studie a registry Testování nových preparátu - klinické studie J plánování, organizace a hodnocení klinických studií ■■ klinické hodnocení léčiv J nezbytná statistická podpora testování nových léčiv Klinické registry J registrace a průběžné sledování pacientů s vážným onemocněním ^ vědecky i klinicky významné závěry pro léčbu onemocnění » Pní-rl iltTHttmTmívli prarm-ta' pooiirajirirhi iciftvrm- MnSf 36 » Pnřrl akinultniwiýrli pianniU' pouS^jŕirh] [lalnnv nunlrl \tnSr ä © Institut biostatistiky a analýz JfiA ■ IUI Klinické registry Onkologie J Herceptin -■ karcinom prsu J Eva 35 - karcinom prsu J Avastin - kolorektální karcinom J Renis - renální karcinom ů reGISTer - gastrointestinální stromální tumor J Hardrock - nádory hlavy a krku d Uranos - karcinom varlat... Registr HERCEPTIN Registr AVASTIN us in " Renal Ca re t noma Infarma About tu* projed ■ "rtJh»)—^' ti i-.i,.Jiv.4..,Ti„ o-, E9££§ ^""wk . . . STANDARD testwuU UACE A »JPIVKUJALCACÉ (jECBV RMC H GERHIľJALNICH I4ADORU SB IJP-Í -: 1 a ^ ^^ „^ yKrtlC^ rwgww ľ.TZr.TS ■^-^..NMItpHHl^»»^*.«......., W, I- «=S: i3 Národní onkologický registr ČR £ Národní onkologický registr SR saiia " ^j^wU Vfl.1 '•■^r^n-iíi-^-i--l -r J r i >' i j i imJ^jJ^j ^J-jj ř 1 -*« 45 -,-,.- iH/r^is^ - ^ĽHuuJlMMfBlft^ 1 .«U/ -*:j 1 1 mll-MfM.*Mlb&H* 1 ' ! 1 láJ^l^rl^H © Institut biostatistiky a analýz IBA \QJ 02 Klinické registry Hematologie a hemato-onkologie j Hemis - hemofílie J Hemorec - hemofílie J Camelia - chronická myeloidní leukémie J Alert - akutní leukémie ů Uniseven - krvácivé epizody PROJECT CAMELtA CHRONIC MYELOID LEUKEMIA iäl ^^_ PROJECT ALERT LERT ACUTE LEUKAEMIA - CLtNICAL REGISTRY HemoRec ■ Zcnv <»nl Hexiblc däU riKirhi<]CFiH!iit lyMan » Eliattive JiHd m inlyvi And rcitHM-cli poi^biliiiri . [ndiipwiHimcc, d.it.t u^atritv .in.l iinu.n.v (Lml.trik . Intf-rruifiünnl .id v i miry bo.ird gu.irvmtf:*-* the-, r-hpr-rr m«p>r dV* 1*1 dvfi^nod far it/Uy UptvMf Of É t*e*d «n+f nf dar*, rclmjrvj drtr«^*ph* itifarmtliuiv ir4d£4l hipľcry, ■ I, «Kl AIlCKl IrfJtls^VI prK >■?■ «r rha main^uť cintra © Institut biostatistiky a analýz IBA ■ IUI Klinické registry Revmatologie a genetika j ATTRA - revmatoidní artritída J DMD - svalové dystrofie.. KnUTMBHA Registr České revmatologické společnosti pro biologickou léčbu zánětlivých revmatických onemocnění K! Kardiologie a chirurgie d Ahead - akutní srdeční selhání d Úrazový registr $ AHEAD Acute Heart Failure Database f r i n (letkou KDcItrnťKi prn S vftxft ImdlDur blĹKiillsIliv j imtyT, Hacír/knuA u 11 Mih I prwnci i*ik»ifr;ri n>aí& tjbfakró ip-jlgpricg k^í f Nímocka jK>c2i-jtn* cckjsujŕ, ic lír l.irlo ipGfnbtin mtxtmt gbrwjki skupiny dat. kláti máji rujiwralhtlngu ťlu awggmoiau TMumiwqjülr. llnrf ninHy* g d rgkg JCOi * jif nabíral jÄlí TOOK) pnpadO ^4«)iných ppa nn pntlll 1nkh ktniky r Rriľwfk«. £vjŕc«ft#. Btiffl » Holandska Jíjíiu inimy njYnJ* p Kanadfi. USA. I lanci. Vh**Un:ani Pftftladaftia Vírt laut« t+Sůu fiajthl canlFÜniha ÚrUariha mgaipu CR fÚRÍRli J* ft hOrtykläf pfipwfvnvj ■n _-o:j , .-o:-: .r b ünqmn» nwf rJi uihurialu byl« lihijh» ni pňfcmi 1(1 ÍCťH 4 ÍĎOS, r«li44{nttEHnl m*ttdkůu li rok/ 30ČĎ i Itlu * (iůHM*Jmf m bi Od i kou t rota IBB. dMabau i* mfirf dakanEana, vr t k (ujasni 1 iírjrHi ľruwrinl dnpH SůuEiřn* dúha ja íbflr iAWhasii' indwiduiWhu pifckpĽ . ui>. j ĽUUfk'M SbCi Wiulu Ii büita t*J ílívljitrth Háuťnjtůfflůr C«. JWÄrtlIňť Mhtft rt1í| fAthfA* liHf 4 urtii S tftiŕ dálíibiil *yuíwí ilulab ÚRCR < 4wty WCB ľCB in polar beat* iľrojit Íí\ sjmplo IVM-1 W.ll CI CI l_ **i* fti flttnnn Biomonitoring Praktická aplikace rozsáhlé analýzy dat j hodnocení kvality životního prostředí J rozsáhlé databáze kombinující chemické a hydrologické parametry s daty biologických společenstev j komplexní vícerozměrná analýza biologických a abiotických dat d prostor v oblasti vývoje metod i praktického využití 1 OK sMotest copncchofl orali oblete In * rafonincw group ^minimal «pinning Ir««} © Institut biostatistiky a analýz IBA ■ IUI Projekt INCHEMBIOL INterakce mezi CHEMickými látkami, prostředím a BIOLogickými systémy a jejich důsledky na globální, regionální a lokální úrovni d vliv rychlostních komunikací na biologické společenstva c vliv herbicidních preparátů na biometrické parametry modelových druhů ryb £ distribuce rtuti v tkáních ryb £ mikrobiální degradace chirálních sloučenin v půdě © Institut biostatistiky a analýz IBA * Biomonitoring fytoplanktonu Sledování vodních květu sinic j chemotypy a morfotypy rodu Microcystis J diverzita a struktura společenstev fytoplanktonu pod vlivem vodních květů sinic J struktura společenstev fytoplanktonu a vodních květů sinic v závislosti od klimatických podmínek \y z'r © Institut biostatistiky a analýz iBA ■ IUI Projekt ARROW MyArPOUJ fôp™th) ^^^^ Assessment and Reference reports of Water Monitoring Hodnocení stavu vod J Hodnocení chemického a ekologického stavu vodních útvarů dle požadavků WFD ES, zapojení do mezinárodních aktivit WFD ES J Portál hodnocení stavu vodních útvarů v ČR 2 kategorie Chemický stavu stav 5 kategorií stavu Normy Ekologický stav — Makrozoobentos — Ryby — Makrofyta --- Fytobentos — Podpůrné parametry - Hydromorfologie _ Chemické a fyzikálně chemické