k
Tomáš Pavlík
pavlik@iba.muni.cz
-/
7x J

'9.
iß
-v       ,
$>
\
Úvod do matematické biologie
MU
IBA
fg
■ --

-■




&
N
Magisterské studium
2.ročník absolventů oboru Matematická biologie absolvent staré formy studia
Vy budete absolventi NOVE formy studia
vyvážená kombinace matematiky, biologie a informatiky
IBA
Wt
•


DNA mikročipy
ControSCnli
Experimental Cell
Microarray preparation
<«        ^	4 -x	-^S                 mRNA exlracteo) from cell l Reverse transcription, fluDrescenlly labeled witti Cy3 (Green) andCyS(Rad)
		
^^B		
^^H		
r		
/		^^^^^^^^^^^^M
tí-		.      Combine eqjHl amount and rybridiľe onto micrcanay í       ____k
		Í              ^"^
cDNA mlcfOörrey	K^	Scan
Technologie DNA mikročipů Výhody
-   Zkoumáme odlišnosti v dění v buňkách různého původu
-   Rychlý experiment
-   Tisíce genů zároveň
Nevýhody
-   Vícekrokový experiment
-   Nepřesnosti v datech data
£B,
IBA

^
Analýza dat z DNA mikročipu
Analýza dat z microarrays:
-  identifikace                       \} zajímavých genů
-  klasifikace shluková analýza
-  propojení expresních + klinických dat
Spojení s databázemi - vyhledávání informací o genech, jejich spojení a možných vlivech na chod buňky
IBA

Analýza přežití
Klasická analýza přežití
- studujeme čas předcházející události, která nás zajímá (úmrtí, progrese nemoci, ...); nechceme pouze počty událostí
IBA
!
^
!^; Analýza přežití - uplatnění v praxi
*-''4h. ■'h
Klinické studie -jedna z fází vývoje nového léku
f     v
Pne-Onical
ID of
molecular        Ta^etr           Bi°cnemical_> Screening  -+ Leads
target           validation        ^y
Animal models Drug metabolism Safety assessment Pharmacy Process chemistry
Analýza přežití v registrech pacientů s vážným onemocněním -vyhodnocování léčby pacientů s těžkými chorobami
Možnosti pro matematický rozvoj - vícestavová analýza přežití („pacienti se mohou vracet mezi živé")
IBA

^
K   Analýza přežití v epidemiologii
■A
Epidemiologie nádorů v CR - Projekt SVOD
- Celkové přežití - přežívání
LČR celkově
- Relativní přežití - přežívání pacientu vztažené na přežívání celé populace ČR
- Hodnocení trendů v populaci - ? zlepšení nebo zhoršení ?
- Vliv preventivních opatření