Myš • savec • z toho plyne, že embryonální vývoj je ze všech modelů nejpodobnější člověku • genom sekvenován • jedinečný díky možnostem genetických manipulací (transgenní myši) Myš je velmi relevantní model pro studium lidské embryologie Myš - nevýhody • relativně dlouhý generační čas • embrya obtížně přístupná experimentální manipulaci – pouze v děloze matky • finančně náročný model Transgenní myš Příprava myších kmenových buněk Transgenní myš – state of the art: • knock-in myši – umožňují záměny genů, vnesení bodových mutací atd. • kondicionální knock-out/in myši založené na Cre-recombinázovém systému a) pouze v určité tkáni/typu buněk b) pouze po vnější stimulaci (tzv. inducibilní Cre), tj. v experimentálně určeném čase c) náhodně – v určitém procentu buněk, využití pro lineage tracing Kondiciovaná genová exprese • Změna genomu – „zapnutí/vypnutí“ genu • Transaktivace transkripce, rekombinace DNA • Řada biologických procesů Binární transgenní systém • Dříve – krátké sekvence transgenu s ovlivnitelným promotorem – Ovlivnění: těžké kovy, teplotní šoky, interferony, steroidy • Krátké sekvence: pleiotropní efekty, vysoká bazální aktivita bez přítomnosti induktoru Binární transgenní systém • Binární systém – efektor + transgen Místně specifická rekombinace DNA Princip místně specifické rekombinace • Umlčení nebo aktivace genové exprese • Exprese Cre nebo Flp rekombinázy (které katalyzují rekombinaci mezi příslušnými rozpoznávacími místy) • Odstranění fragmentů DNA, které jsou obklopeny přímými repeticemi (loxP nebo FRT) Tkáňově specifické vypínání genů (knockout) • Výhodou je, že můžeme obejít letální fenotyp a také podrobně zkoumat biologické procesy • Postup: – Produkce myší, u kterých je gen zájmu obklopen místy loxP – Linie myší, které exprimují Cre jen v určitých tkáních – Křížením vznikne potomstvo, kde je gen našeho zájmu inaktivován jen v buňkách, které exprimují Cre – Ke správné interpretaci fenotypu je třeba vědět, ve kterých buňkách došlo k rekombinaci- užití reportéru • Hypomorfní alela Aktivace genů katalyzovaná Cre • K aktivaci dojde – Odstraněním STOP DNA (která zabraňovala transkripci daného genu – Obnovením ORF (který byl přerušen nějakou sekvencí) Časová regulace exprese Cre Závěr • Kontrola exprese dvou a více genů ve stejné myši • Změna ne jen na úrovni DNA a RNA, ale i na úrovni proteinu