Třída Gammaproteobacteria - pokračování


Řád Vibrionales


- charakteristika řádu je shodná s popisem čeledě Vibrionaceae


                                        Čeleď Vibrionaceae

Doména Bacteria, kmen Proteobacteria, třída Gammaproteobacteria, řád Vibrionales.


-         rovné, mírně zakřivené G- tyčky, pohyblivé nebo nepohyblivé

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, vyžadují 2 až 3% NaCl, bioluminiscenční

-         celosvětově rozšířené, osídlují vodní prostředí, vodní živočichy a rostliny; patogenní
(průjmovitá onemocnění, infekce ran, septikemie)

-         validován návrh - čeleď Aeromonadaceae, plesiomonády převedeny do čeledě
Enterobacteriaceae

-         přeřazení validně popsaného rodu „Allomonas“ do rodu Vibrio


Rody: Vibrio, Catenococcus, Enterovibrio, Grimontia, Listonella, Photobacterium, Salinivibrio


Vibrio

-         rovné, zakřivené G-tyčky, pohyblivé, obklopeny pochvou

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, citlivé k 0/129, Na^+ ionty

-         vodní prostředí s širokým rozmezím salinity, některé sladkovodní; patogenní
(gastroenteritidy, infekce ran, extraintestinální infekce)

-         druhově početný rod, v humánním materiálu zhruba deset druhů


V. cholerae – původce cholery, široké rozmezí symptomů; toxinogenní


V. parahaemolyticus – potravinové otravy (ryby, mořské produkty)


V. vulnificus – původce vysoce smrtelných septikemií


V. fluvialis – humánní klinický materiál


Listonella

-         zakřivené G- tyčky, pohyblivé, vyčleněny z rodu Vibrio (5S rRNA)

-         chemoorganotrofní, vyžadují přítomnost NaCl

-         výskyt svázán s mořským prostředím, patogenní pro ryby, úhoře


L. anguillarum – patogenní pro ryby, původně řazena mezi vibria


Photobacterium

-         rovné, buclaté G- tyčky, pohyblivé nebo nepohyblivé

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, poly-b-hydroxybutyrát

-         vyžadují sodné ionty, bioluminiscenční

-         mořské prostředí a živočichové, symbionti, ojediněle klinický materiál


P. phosphoreum – psychrofilní, světélkující orgány ryb


P. damselae subsp. damselae – oportunní patogen, původně vibria, listonely


Řád Aeromonadales


-         rovné, zakřivené G- tyčky, fakultativně i striktně anaerobní

-         pohyblivé i nepohyblivé; mezofilní i psychrofilní, oxidáza pozitivní

-         primárně osídlují vodní prostředí; primárně/oportunně patogenní


                                       Čeleď Aeromonadaceae

Doména Bacteria, kmen Proteobacteria, třída Gammaproteobacteria, řád Aeromonadales.


-         rovné G- tyčky, nesporulující, většinou pohyblivé

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní; oxidáza pozitivní

-         mezofilní, psychrofilní, glukózu využívají oxidativně i fermentativně

-         vodní prostředí (sladká voda, ústí řek, odpadní voda, sedimenty, biofilm, spojitost
s vodními živočichy); druhy parazitické

-         původně řazeny do čeledě Vibrionaceae


Rody: Aeromonas, Oceanimonas, Oceanisphaera, Tolumonas


Aeromonas

-         rovné G- tyčky, až kulovitého tvaru, pohyblivé polárním bičíkem

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, teplota 22-28 °C

-         oxidáza, kataláza pozitivní, hydrolyzují želatinu, Tween 80 a DNA, rezistentní
k vibriostatickému agens 0/129

-         výskyt ve sladkých i odpadních vodách, některé patogenní (průjmové onemocnění,
bakteriemie)

-         druhová diferenciace problematická -„skupina A. hydrophila“


A. hydrophila – voda, patogenní pro studenokrevné živočichy i savce


A. caviae – voda, klinický materiál


A. sobria – voda, ryby


A. veronii biovar Sobria – voda, klinický materiál (fenotyp shodný s A. sobria)


A. veronii biovar Veronii – prostředí, klinický materiál, dekarboxyluje ornithin


A. media – sladká voda, hnědý exopigment


A. salmonicida – voda, patogenní pro lososovité ryby, pět poddruhů








                                     Čeleď Succinivibrionaceae

Doména Bacteria, kmen Proteobacteria, třída Gammaproteobacteria, řád Aeromonadales.


-         krátké, dlouhé, rovné, zakřivené, helikální G- tyčky, nesporulující

-         kataláza negativní, striktně anaerobní, z cukrů - sukcinát a acetát


Rody: Succinivibrio, Anaerobiospirillum, Ruminobacter, Succinimonas


Succinivibrio

-         zakřivené, helikální G- tyčky, zašpičatělé konce, jednotlivě, řetízky

-         striktně anaerobní, pohyblivé, fermentují cukry (kyselina octová, jantarová, formiát,
laktát)

-         bachor krav a ovcí, pravděpodobně nepatogenní; vzácně septikemie



Anaerobiospirillum

-         buňky spirálního tvaru, G-, zakulacené konce, jednotlivě, vlákna, pohyblivé (pohyb
připomíná vývrtku)

-         anaerobní, striktně fermentatorní metabolizmus, chemoorganotrofní

-         karbohydráty fermentovány na kyselinu octovou a jantarovou

-         izolovány z krku, tračníku psů; z průjmových případů či septikemií u člověka; z výkalů
zdravých psů a koček

-         kmeny z klinických případů mohou reprezentovat odlišný druh


A. succiniciproducens – kyselina jantarová, fixace CO[2], slabá b-hemolýza

















Řád Enterobacteriales


-         fakultativně anaerobní G- rovné tyčky, delší vláknité formy

-         volně v prostředí, ve spojení s živočišným nebo rostlinným hostitelem

-         patogenní pro člověka, zvířata, hmyz nebo rostliny


                                     Čeleď Enterobacteriaceae

Doména Bacteria, kmen Proteobacteria, třída Gammaproteobacteria, řád Enterobacteriales.


-         rovné G- tyčky, nepohyblivé nebo pohyblivé, netvoří endospory

-         fakultativně anaerobní, generační doba krátká, chemoorganotrofní, respiratorní i
fermentatorní typ metabolismu

-         okyselují glukózu (plyn), řadu cukrů, oxidáza negativní

-         celosvětově rozšířené v půdě, vodě, ovoci, zelenině, zrnech, kvetoucích rostlinách a
stromech; na živočiších od cizopasných červů a hmyzu až po člověka

-         rozmanitost v ekologii, rozmezí hostitele, či patogenity

-         napadají intestinální trakt (průjmová onemocnění), oportunně patogenní; extraintestinální
infekce (bakteriemie, meningitidy, infekce ran, močových cest, respiračního traktu, nozokomiální
infekce)

-         mnoho nomenklatorickým změn - popsány nové rody a druhy


Rody: Enterobacter, Escherichia, Alterococcus, Arsenophonus, Brenneria, Buchnera, Budvicia,
Buttiauxella, Calymmatobacterium, Cedecea, Citrobacter, Dickeya, Edwardsiella, Erwinia, Ewingella,
Hafnia, Klebsiella, Kluyvera, Leclercia, Leminorella, Moellerella, Morganella, Obesumbacterium,
Pantoea, Pectobacterium, Phlomobacter, Photorhabdus, Plesiomonas, Pragia, Proteus, Providencia,
Rahnella, Raoultella, Saccharobacter, Salmonella, Samsonia, Serratia, Shigella, Sodalis, Tatumella,
Trabulsiella, Wigglesworthia, Xenorhabdus, Yersinia, Yokenella


Enterobacter

-         rovné G- tyčky, pohyblivé (peritrichálními bičíky)

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní (respiratorní, fermentatorní metabolizmus)

-         Voges-Proskauer, Simmons citrát pozitivní; neprodukují H[2]S, DNázu

-         po erwiniích druhově nejpočetnější enterobakterie

-         prostředí - sladká voda, půda, odpadní voda, na rostlinách, zelenině, ve zvířecích
výkalech i lidské stolici

-         více než desítka taxonů, některé oportunně patogenní


E. cloacae – voda, půda, potraviny, klinický materiál


E. aerogenes – voda, půda, potraviny, stolice člověka i zvířat


E. sakazakii – prostředí, potraviny, klinický materiál






                              Čeleď Enterobacteriaceae - pokračování


Escherichia

-         rovné G- tyčky, jednotlivě, dvojice; pouzdra, pohyblivé, nepohyblivé

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, respiratorní, fermentatorní typ metabolizmu

-         běžné půdy, biochemická aktivita je značná

-         flóra střevního traktu živočichů; enterotoxin - průjmová onemocnění

-         původce infekcí močových cest, nozokomiálních infekcí, septikemií, meningitid; oportunně
patogenní (infekce ran)

-         charakterizovány sérologicky dle somatických (O), kapsulárních (K) a bičíkových (H)
antigenů


E. coli – střevní mikroflóra obratlovců (komenzál), i patogenní


E. fergusonii – humánní klinický materiál


E. hermannii – humánní klinický materiál


E. vulneris  – humánní klinický materiál



Brenneria

-         G- buňky se zakulacenými konci, jednotlivě, ve dvojicích, pohyblivé

-         fakultativně anaerobní, růstová teplota 27 - 30 °C, růžově pigmentující

-         zřetelně odlišná fylogenetická skupina enterobakterií

-         onemocnění listnatých stromů a ořešáků

-         fenotypová diferenciace problematická, nutno použít genotypizaci


B. salicis – původně řazena k erwiniím
















                              Čeleď Enterobacteriaceae - pokračování


Budvicia

-         rovné G- tyčky; většinou pohyblivé (peritrichální bičíky)

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní

-         okyseluje glukózu, cukry, produkuje H[2]S (atypické citrobaktery)

-         převážně sladká voda, vzácně izolovány z lidské stolice i z živočichů

-         zatím jeden druh


B. aquatica – popsána českými mikrobiology, pravděpodobně nepatogenní


Buttiauxella

-         malé G- tyčky, pohyblivé peritrichálními bičíky

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní

-         fenotypově podobné kluyverám - okyselují glukózu s tvorbou plynu

-         izolovány z měkkýšů, sladké vody, půdy, humánního materiálu


B. agrestis – klinický význam nevyjasněn


Calymmatobacterium

-         pleomorfní G- tyčky, zakulacené konce, jednotlivě, ve shlucích, nepohyblivé, tvoří
pouzdra

-         kultivačně náročné, in vivo kultivovány ve žloutkovém vaku kuřecích embryí nebo in vitro
na speciálních médiích obsahujících lecitin

-         žádný kmen není k dispozici ve sbírkách kultur

-         patogenní pro člověka - „donovanóza (zánět tříselních uzlin)“


C. granulomatis – intracelulární parazit


Cedecea

-         G- tyčky, pohyblivé peritrichálními bičíky

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní,
růstová teplota 37 °C

-         okyselují glukózu, hydrolyzují Tween 80, nehydrolyzují želatinu, DNA

-         humánní klinický materiál (respirační trakt), oportunní patogeny


C. davisae – humánní klinický materiál










                              Čeleď Enterobacteriaceae - pokračování


Citrobacter

-         rovné G- tyčky, jednotlivě, po dvou, obvykle pohyblivé

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní,
růstová teplota 37 °C

-         okyselují glukózu s tvorbou plynu, řada H[2]S pozitivních druhů

-         stolice člověka, zvířat, běžný obyvatel intestinálního prostředí; v klinickém materiálu
jako oportunní patogen; prokázány v půdě, vodě, potravinách, odpadní vodě

-         dříve nesprávně klasifikovány jako „Levinea“


C. freundii – H[2]S pozitivní, často izolován


C. diversus – neonatální meningitidy


Edwardsiella

-         malé rovné G- tyčky, pohyblivé (pohyblivost je lepší při 25 °C)

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní (typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní),
optimální teplota je 37 °C nebo nižší

-         méně aktivní než jiné rody čeledě Enterobacteriaceae (biochemicky podobné escherichiím,
shigelám a salmonelám)

-         střevní trakt studenokrevných živočichů a jejich prostředí (sladká voda); patogenní
(úhoři, jiné ryby, živočichové - ekonomické ztráty)

-         zjištěny u teplokrevných živočichů, člověka; oportunně patogenní


E. tarda – rozšíření u živočichů, stolice zdravých lidí; oportunně patogenní


Erwinia

-         rovné G- tyčky, jednotlivě, po dvou, v řetízcích, pohyblivé

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní,
optimální teplota je 27 - 30 °C

-         spojitost s rostlinami (patogeny, saprofyty, součást epifytické flóry); vzácně izolovány
z člověka či zvířat


E. amylovora – fytopatogenní


Ewingella

-         rovné G- tyčky, pohyblivé peritrichálními bičíky

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní,
optimální teplota 37 °C

-         vlastnostmi připomíná rod Cedecea

-         klinický materiál, nečastý patogen, bakteriemie, nozokomiální infekce


E. americana – humánní klinický materiál, prostředí



                              Čeleď Enterobacteriaceae - pokračování


Hafnia

-         rovné G- tyčky pohyblivé (peritrichální bičíky) i nepohyblivé

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní,
optimální teplota 30 - 37 °C

-         biochemicky podobné enterobakterům a seráciím

-         stolice člověka, živočichů, voda, půda, potraviny; jsou poměrně hojné

-         oportunně patogenní pro člověka (infekce krve, močových cest, ran)



H. alvei – prostředí, klinický materiál


Klebsiella

-         rovné G- tyčky, jednotlivě, po dvou, řetízky, opouzdřené, nepohyblivé

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní,
teplota 37 °C; nevyžadují růstové faktory

-          okyselují řadu cukrů, citrát a glukóza - výhradní zdroj uhlíku

-         problém odlišení od rodu Enterobacter; některé nyní v Raoultella

-         stolice člověka, klinický materiál, půda, voda, rostliny

-         oportunně patogenní (bakteriemie, pneumonie, nozokomiální infekce)


K. pneumoniae subsp. pneumoniae – infekce u člověka, mastitidy u zvířat


K. pneumoniae subsp. ozaenae – klinický materiál


K. pneumoniae subsp. rhinoscleromatis – klinický materiál


K. oxytoca – střevní trakt, klinický materiál, rostliny, vodní prostředí


Kluyvera

-         malé rovné G- tyčky, pohyblivé (peritrichální)

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní,
optimální teplota 37 °C

-         biochemicky aktivní, glukózu okyselují s tvorbou plynu, indol pozitivní

-         potraviny, půda, odpadní voda, humánní klinický materiál



K. ascorbata – klinický materiál (oportunní), voda, potraviny odpadní voda


K. cryocrescens – klinický materiál (oportunní), voda, půda, odpadní vody, nemocniční prostředí


Leclercia

-         rovné G- tyčky, pohyblivé (původně Escherichia adecarboxylata)

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní;
růstová teplota je 37 °C

-         glukózu okyselují s tvorbou plynu, žlutý pigment

-         humánní klinický materiál, potraviny, voda, prostředí (oportunní)


L. adecarboxylata


                              Čeleď Enterobacteriaceae - pokračování


Leminorella

-         rovné G- tyčky, nepohyblivé

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní;
optimální teplota 37 °C

-         glukózu, cukry okyselují, produkují H[2]S (biochemicky málo aktivní)

-         lidská stolice, moč, klinický význam neznámý


L. grimontii – lidská stolice, vzácně v klinickém materiálu


Moellerella

-         rovné G- tyčky, nepohyblivé

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní;
optimální teplota 37 °C

-         glukózu, cukry okyselují, biochemicky málo aktivní, připomínají E. coli

-         stolice člověka, vody, potraviny; oportunně patogenní


M. wisconsensis – humánní klinický materiál, zvířata, voda, potraviny


Morganella

-         rovné G- tyčky, pohyblivé (peritrichální)

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní;
optimální teplota 37 °C

-         okyseluje jen glukózu a manózu; nutno odlišit od proteů a providencií

-         stolice člověka, savců, plazů; oportunní původce druhotných infekcí


M. morgani subsp. morganii – původně řazena k proteům


Obesumbacterium

-         pleomorfní G-tyčky (krátké, tlusté, dlouhé), nepohyblivé

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní;
optimální teplota 32 °C, rostou pomalu

-         biochemicky méně aktivní než ostatní zástupci této čeledě

-         kontaminace v pivovarech, pouze jeden druh


O. proteus – nepatogenní, má dva biotypy


Pantoea

-         rovné G- tyčky pohyblivé (peritrichální), většinou žlutý pigment

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní;
optimální teplota 30 °C

-         povrch rostlin, semen, půda, voda, klinický materiál (oportunní patogeny); fytopatogenní;
původně patřili k enterobakterům, erwiniím


P. agglomerans – rostliny, klinický materiál; „Enterobacter agglomerans“


P. dispersa – povrch rostlin, člověk, prostředí


                              Čeleď Enterobacteriaceae - pokračování


Pectobacterium

-         rovné G- tyčky, zakulacené konce, jednotlivě, ve dvojicích; pohyblivé

-         fakultativně anaerobní, fermentující, optimální teplota 27 - 30 °C

-         tvoří kyselinu z N-acetyl glukósaminu a dalších cukrů

-         fylogeneticky odlišitelná skupina, původně mezi erwiniemi

-         způsobují rozmanitá onemocnění rostlin – pektinázy, lyázy


P. carotovorum – fytopatogenní (hniloba), pět poddruhů


Photorhabdus

-         G- tyčky, vlákna, nesporulující, pohyblivé (peritrichální)

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní;
optimální teplota 28 °C

-         pigmentované, bioluminiscenční, nepříliš aktivní biochemicky

-         střevní trakt entomopatogenních hlístovek, hmyz; oportunně patogenní pro člověka
(vyčlenění z rodu Xenorhabdus)


P. luminescens – tři poddruhy


Plesiomonas

-         rovné G- tyčky se zakulacenými konci, pohyblivé (lofotricha)

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní;
optimální teplota 37 °C

-         oxidáza pozitivní (původně řazen do čeledě Vibrionaceae), dekarboxylují lysin a ornithin,
tvoří kyselinu z inositolu

-         ryby, vodní živočichové, savci; průjmová onemocnění, oportunní


P. shigelloides – průjmy


Pragia

-         rovné G- tyčky, pohyblivé (peritrichální)

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní;
optimální teplota 37 °C

-         glukózu okyselují (bez tvorby plynu), produkují H[2]S

-         pitná voda, lidská stolice; rod popsán českými mikrobiology roku 1988


P. fontium








                              Čeleď Enterobacteriaceae - pokračování


Proteus

-         rovné G- tyčky, pohyblivé (kruhové zóny – tvar vln nebo jednotný film)

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní;
optimální teplota 37 °C

-         glukózu okyselují s tvorbou plynu, deaminují fenylalanin a tryptofan

-         střevní trakt člověka, zvířat; v hnoji, půdě a znečištěných vodách

-         patogeny člověka, infekce močových cest; druhotné infekce


P. mirabilis – nejčastější proteus v klinickém materiálu



P. vulgaris – klinický materiál, méně častý



Providencia

-         rovné G- tyčky, pohyblivé (peritrichální)

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní;
optimální teplota 37 °C

-         glukózu okyselují, oxidativně deaminují fenylalanin a tryptofan

-         patogeny člověka (stolice při průjmech, infekce močových cest, ran, popálenin a
z bakteriemií); nutno odlišit od proteů a morganel


P. alcalifaciens – často izolovaná, průjmy


P. stuartii – infekce močových cest, nozokomiální infekce, zřídka ze stolice



Rahnella

-         malé rovné G- tyčky, nepohyblivé při 36 °C, pohyblivé při 25 °C

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní;
optimální teplota 25 - 37 °C

-         glukózu a jiné cukry okyselují (s tvorbou plynu), fenylalanin pozitivní

-         sladké vody, půda; příležitostně humánní klinický materiál


R. aquatilis – půda, voda, klinický materiál


Raoultella

-         aerobní, nepohyblivé G- tyčky, pouzdra; původně klebsiely

-         fakultativně anaerobní, respiratorní i fermentatorní typ metabolismu

-         charakteristickým znakem je schopnost růstu při 10 °C, acetoin pozitivní, glukózu
fermentují za tvorby kyseliny a plynu

-         voda, půda, rostliny, příležitostně klinický materiál


R. ornithinolytica – dekarboxyluje ornithin, prostředí, klinický materiál


R. planticola – podobná K. pneumoniae subsp. pneumoniae, prostředí





                              Čeleď Enterobacteriaceae - pokračování


Salmonella

-         rovné G- tyčky, většinou pohyblivé; fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ
metabolizmu respiratorní i fermentatorní

-         teplota 37 °C, glukózu okyselují (s tvorbou plynu), produkují H[2]S

-         člověk, teplokrevní i studenokrevní živočichové, potraviny, prostředí

-         patogenní pro člověka, zvířata; infekční agens tyfu, střevních horeček, gastroenteritid a
septikemií

-         vnitrodruhová diferenciace - sérovary dle (O), (Vi), (H) antigenů

-         děleny také na základě biochemických testů (epidemiologický význam)

-         dvě druhová jména, S. bongori, S. enterica, 6 poddruhů, 2500 sérovarů

-         rutinní diagnostické laboratoře - povoleno používat označení sérovarů


S. enterica subsp. enterica sv. Typhimurium – nejčastější, gastroenteritidy


S. enterica subsp. enterica sv. Typhi – patogenní, voda, potraviny



S. enterica subsp. enterica sv. Enteritidis – častý výskyt


S. enterica subsp. enterica sv. Choleraesuis – patogenní


Samsonia

-         tyčky, G-, zakulacené konce, pohyblivé (peritrichální)

-         glukózu fermentují bez tvorby plynu, hydrolyzují eskulin, ne želatinu

-         izolovány z nemocných stromů


S. erythrinae – fytopatogenní





















                              Čeleď Enterobacteriaceae - pokračování


Serratia

-         rovné G- tyčky, obvykle pohyblivé

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní;
optimální teplota 30-37 °C, pigment

-         cukry okyselují, hydrolyzují DNA, Tween 80, želatinu

-         mezidruhová identifikace problematická - „skupina S. liquefaciens“

-         humánní klinický materiál, obecně v prostředí, střevní trakt

-         oportunní patogeny, septikemie, infekce , bakteriemie; mastitidy


S. marcescens – prostředí, humánní klinický materiál


S. liquefaciens – prostředí, zřídka klinický materiál


S. plymuthica – sladká voda, vzácně sputum


S. odorifera – vůně po lilkovitých, rostliny, potraviny, zřídka patogenní


Shigella

-         rovné G- tyčky, nepohyblivé

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní;
optimální teplota 37 °C

-         glukózu a další cukry okyselují, biochemicky obtížné odlišení shigel

-         střevní patogeny člověka, primátů, bacilární dysenterie

-         se salmonelami a yersiniemi reprezentují nejčastější patogeny čeledě

-         potvrzení identifikace shigel - typizace somatických (O) antigenů


S. dysenteriae      (podskupina A)


S. flexneri                        (podskupina B)


S. boydii               (podskupina C)


S. sonnei              (podskupina D)



Tatumella

-         malé, rovné G- tyčky, nepohyblivé při 36 °C (25 °C - pohyblivé)

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní;
optimální teplota 25-37 °C

-         metabolicky aktivní při 25 °C; cukry okyselují, fenylalanin pozitivní

-          humánní klinický materiál, zvířata (oportunní patogeny)


T. ptyseos – respirační trakt člověka








                              Čeleď Enterobacteriaceae - pokračování


Trabulsiella

-         rovné G- tyčky, pohyblivé

-         fakultativně anaerobní, produkují H[2]S, hydrolyzují eskulin, ONPG

-         vzorky z prostředí, stolice při průjmech; vzácně izolovaná

-         může být chybně identifikována jako salmonela


T. guamensis – H[2]S pozitivní, sacharóza negativní


Xenorhabdus

-         G- tyčky, vlákna, krystalické inkluze, sféroplasty, pohyblivé

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní;
optimální teplota 25 °C

-         reakce jsou obvykle slabé a opožděné, kataláza negativní, biochemicky odlišné od
Enterobacteriaceae, pigmenty

-         střevní trakt entomopatogenních hlístic, tělní dutiny hmyzu, ojediněle humánní klinický
materiál


X. nematophilus


Yersinia

-         rovné G- tyčky, kokovitý tvar, pohyblivost: 30 °C x 37 °C

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní;
optimální teplota 28 až 30 °C

-         cukry okyseluje, dekarboxylují ornithin, hydrolyzují ureu

-         při nižší teplotě (25 až 28 °C) je vyšší metabolická aktivita

-         člověk, zvířata, půda, voda, potraviny; striktně patogenní, oportunně patogenní,
nepatogenní


Y. pestis – dýmějový mor, onemocnění hlodavců (přenos blechami)


Y. pseudotuberculosis – patogenní, příležitostně člověk


Y. enterocolitica – infekce zvířat, člověka, prostředí


Y. ruckeri – patogenní pro ryby


Yokenella

-         rovné G- tyčky, pohyblivé (peritrichální)

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní;
optimální teplota 37 °C

-         cukry okyseluje s produkcí plynu, dekarboxyluje lysin i ornithin

-         původně hafnie; biochemicky podobné citrobakterům, escherichiím

-         humánní klinický materiál, voda, střevním traktu hmyzu


Y. regensburgei – synonymem je „K. trabulsii“



Řád Pasteurellales


-         sekvencování 16S rDNA

-         G- tyčky, kokotyčky, rovné, zakřivené, většinou nepohyblivé

-         prostředí, parazitické pro člověka, živočichy

-         charakteristika řádu shodná s popisem čeledě


                                       Čeleď Pasteurellaceae

Doména Bacteria, kmen Proteobacteria, třída Gammaproteobacteria, řád Pasteurellales.


-         G- tyčky kokoidního tvaru, pleomorfní, nepohyblivé

-         aerobní - mikroaerofilie, fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní

-         nutričně náročné (speciální základ média pro konvenční testy)

-         anaerogenní, oxidáza, kataláza a alkalická fosfatáza pozitivní

-         obligátní paraziti obratlovců (savců a ptáků; sliznice trávicího, pohlavního nebo
respiračního traktu)


Rody: Pasteurella, Actinobacillus, Avibacterium, Gallibacterium, Haemophilus, Lonepinella,
Mannheimia, Nicoletella, Phocoenobacter, Volucribacter


Pasteurella

-         sférické, ovoidní, tyčkovité, jednotlivě, v párech, řetízcích, nepohyblivé

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní;
optimální teplota 37 °C

-         cukry okyselují, oxidáza, kataláza pozitivní, nitráty redukují na nitrity

-         parazité, komenzálové (sliznice respiračního a  trávicího traktu)


P. multocida – hemorrhagické septikemie, drůbeží cholera, pneumonie


P. pneumotropica – infekce zvířat, vzácně i člověka


Actinobacillus

-         sférické, oválné, tyčkovité G- buňky, nepohyblivé; „Morseový kód“

-         primokultury - velká přilnavost k agaru, mají nízkou viabilitu

-         fakultativně anaerobní, chemoorganotrofní, typ metabolizmu respiratorní i fermentatorní;
optimální teplota 37 °C

-         glukózu okyselují, b-galaktosidáza i ureáza pozitivní, indol negativní

-         parazité, komenzálové člověka, savců, ptáků v trávicím, dýchacím a pohlavním traktu
(oportunně patogenní)


A. lignieresii – patogenní pro skot, ovce, vzácně i jiní živočichové či člověk









                                 Čeleď Pasteurellaceae pokračování


Gallibacterium

-         G-, nesporulující, nepohyblivé tyčky, pleomorfní, jednotlivě, v párech

-         nepigmentující, b-hemolytické, mezofilní, fakultativně anaerobní, mikroaerofilní

-         kataláza, oxidáza a fosfatáza pozitivní, tvoří kyselinu z řady cukrů

-         vyčlenění tzv. ptačích pasteurel; obsahuje jeden druh a genomospecies

-         izolovány z kuřat, kačen, hus, dobytka, dalších domestikovaných zvířat


G. anatis – léze na sliznicích zvířat, dva poddruhy


Haemophilus

-         drobné, středně velké, kulaté, oválné, tyčkovité G- buňky, nepohyblivé

-         fakultativně anaerobní, vyžadují růstové faktory (X a/nebo V faktor)

-         ne všechny druhy x některé aktinobacily, pasteurely vyžadují NAD

-         chemoorganotrofní, respiratorní i fermentatorní typ metabolizmu

-         obligátní paraziti, komenzálové člověka, rozmanitých živočichů


H. influenzae – klinický materiál (meningitidy, septikemie, otitidy, sinusitidy, chřipková
onemocnění - chronické bronchitidy); biovary


H. ducreyi – infekční agens pohlavní choroby měkký vřed


H. pleuropneumoniae – klinický materiálu od domestikovaných zvířat

Mannheimia

-         nepohyblivé tyčky, kokotyčky, G-, nesporulující, bipolární barvení

-         mezofilní, fakultativně anaerobní, mikroaerofilní, nevyžadují faktory

-         oxidáza, alkalická fosfatáza pozitivní, redukují nitráty, b-hemolýza

-         nejrůznější veterinární klinický materiál, příbuzné aktinobacilům



M. haemolytica – pneumonie, horečnaté onemocnění zvířat; mastitidy