Plán výuky předmětů Bi5000 Bioinformatika I - nukleové kyseliny, Bi9060 Bioinformatika II - proteiny
a Bi9061 Bioinformatika - cvičení v semestru Podzim 2010
Datum č. Zařazení do 
předmětu
Lekce
23.9. 1 Bi5000 Metody pro analýzu primární struktury DNA, genomové projekty, sekvenování DNA
2010 Bi9061 Cvičení – formáty sekvencí, manipulace se sekvenčními daty
30.9. 2 Bi9060 Bioinformatika –  základní definice, molekulárně biologické databáze
2010 Bi9061 Cvičení ‐ textové vyhledávání v databázích
14.10. 3 Bi5000 Manipulace se sekvenčními daty
2010 Bi9061 Cvičení – restrikční štěpení in silico, návrh primerů
21.10. 4 Bi5000 Posuzování podobnosti sekvencí nukleových kyselin a proteinů 
2010 Bi9061 Cvičení – BLAST a PSI‐BLAST
4.11. 5 Bi9060 Mnohonásobné přiložení sekvencí  a fylogeneze
2010 Bi9061 Cvičení ‐ mnohonásobné přiložení a fylogeneze
11.11. 6 Bi5000 Počítačové vyhledávání genů a srovnávací genomika
2010 Bi9061 Cvičení – hledání prokaryotických genů, práce s programy na Vista‐serveru
18.11. 7 Bi9060 Analýza sekvencí proteinů
2010 Bi9061 Cvičení – analýza sekvencí proteinů
25.11. 8 Bi5000 Připrava anotované sekvence DNA pro zaslání do databáze
2010 Bi9061 Cvičení – zpracování sekvence v programu Sequin
2.12. 9 Bi9060 Strukturní databáze
2010 Bi9061 Cvičení –  strukturní databáze, vizualizace a analýza proteinových struktur v PyMOL
9.12. 10 Bi9060 Predikce struktury proteinů
2010 Bi9061 Cvičení –  predikce struktury proteinů
16.12. 11 Bi5000+Bi9060 Testy k ukončení kolokviem ke každému z předmětů (dle zkušebních termínů)
2010 Bi9061 Cvičení ‐ zápočtový test na PC