Využití a zpracování literatury Belma Skender, Iva Jelínková, Zuzana Pernicová Seminář oddělení Fyziologie živočichů a imunologie, září 2010 ØZdroje informací: Ø - knihovny MU (http://aleph.muni.cz/F) Ø - internetové databáze Ø - další (osobní žádost o odborný článek) ØTypy informací: Ø - současný stav dané problematiky Ø - statistické údaje Ø - grafické podklady ØTypy pro vyhledávání: Ø Ø Buďte přesní - používejte více klíčových slov - konkrétní stránky Ø Přečtěte si instrukce - každý vyhledávač má vlastní syntaxi Ø Používejte Boolean - některé vyhledávače vám umožní vkládat dotazy s pomocí booleanovské logiky ( matematické operátory: AND, OR, NEAR) Ø Buďte pokročilí - mnoho serverů nabídne možnost pokročilého vyhledávání s více hesly a kategoriemi Ø Pokud neuspějete napoprvé - zkuste jiný vyhledávač Ø Uložte si stránky - jakmile najdete stránky, které hledáte, zase je neztraťte ØPrincipy vyhledávání: Ø Boolean: Ø AND – termíny uvedené na obou stranách operandu se musejí vyskytovat současně někde v dokumentu - musí být splněn požadavek současného výskytu všech Ø OR – v dokumentu se musí vyskytovat aspoň jeden z uvedených termínů Ø AND NOT – dokument, který obsahuje termín uvedený na pravé straně operandu, je vyloučen z výsledku Ø NEAR – má podobný význam jako AND. ale oba termíny se musejí vyskytovat v určité vzdálenosti (obvykle měřeno ve slovech) od sebe Ø BEFORE, AFTER a použití závorek – stejný přístup jak při vyhodnocování v algebraické matematice ØSearch Engine Math l+,-,““ l l V Internetu existuje obrovské množství vyhledávacích služeb. Při zpracování rešeršního požadavku je potřeba se zamyslet nad tím, která služba je pro řešení ta nejvhodnější ØTématické portály: Ø V současné době existuje množství portálů - které jsou zaměřeny na určitou skupinu uživatelů a jsou orientovány tematicky: Ø ØPříklady: ØChemWeb - poskytuje přístup k informacím z oblasti chemie a příbuzných oborů. Jedná se o snadný přístup k abstraktů, zprávám z konferencí, newslettrům, knihám. Je možné se zdarma registrovat. ØMedscape – informace z oblasti lékařství, přehledové články, recenze knih, sloupky expertů, vzdělávání pacientů atd. Registrace zdarma. ØPSIgate, Physical Sciences Information Gateway ØZdroje informací: Ø Co nabízí univerzita MU: Ø https://aleph.muni.cz/F Ø http://library.muni.cz/ezdroje/ ØPřístup ke zdrojům MU: Ø ØOdborné informační servery: Ø Pubmed Ø Web of science (web of knowledge) Ø ScienceDirect (Největší světová sbírka plnotextových a bibliografických informací v oblasti vědy, technologie a zdravotnictví) Ø SpringerLink (Databáze časopisů a knih z oblasti přírodních, lékařských a společenských věd z produkce nakladatelství Springer (Kluwer). Ø Wiley InterScience Ø Academic Search Premier Ø Scirus Ø Scholar.google ØSoučasný stav dané problematiky: Ø PubMed - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi l Ø PubMed – levá lišta Ø Ø přehled databází, základní informace o databázích a principu vyhledávání Ø seznam časopisů (zvlášť fulltexty) Ø převod běžné mluvy na odborné termíny Ø dohledávání konkrétních citací podle autora apod. Ø vyhledávání podle vědního oboru Ø NCIB účet – uložení předešlého vyhledávání Ø Ø Ø linky na další spřízněné databáze a aplikace Ø projít možnosti, pak otevřít pubmed, prakticky vše ukázat,co se dá dělat s tou levou lištou pak nechat je at vymýšlí hesla a hromadně ukázat, jak správně zadávat a hledat a co se s tím dá i udělat (i endnote a jiné databázové programy) ØStatistické údaje: Ø Epidemiologie zhoubných nádorů v ČR: www.svod.cz Ø Ø Ústav zdravotnických informací a statistiky: www.uzis.cz Ø Ø World Health Organisation: http://www.who.int/research/en/ Ø Ø ØGrafické podklady: Ø ØSigma obrázky Øhttp://www.sigmaaldrich.com Ø ØPathway maps Øhttp://escience.invitrogen.com/ipath Ø ØCell signalling technology Øhttp://www.cellsignallingbiology.org Ø ØProteinLounge Øhttp://www.proteinlounge.com Ø ØReactome Øhttp://www.reactome.org Důvěryhodnost informací na internetu: Ø Vnímání důvěryhodnosti zvyšuje následujících pět kritérií: Ø pocit skutečnosti => jsou zde uvedeny fyzické adresy organizací atd. Ø snadnost použití => na stránkách je dostupný archiv staršího Ø obsahu; stránky vypadají profesionálně; jsou logicky upořádány Ø atd. Ø odbornost => stránka patří organizaci, která je uznávaná mimo Ø Internet; jsou zde uvedeny autorovy tituly; citace a odkazy; na Ø stránkách je uvedeno, že se jedná o stránky pro dané téma Ø oficiální atd. Ø spolehlivost => na stránku je odkazováno stránkou, které věříte; Ø odkazuje na vnější zdroje; jsou zde uvedeny odkazy na stránky Ø konkurence; byly vám doporučeny vyučujícím Ø přizpůsobení => vybírá novinky podle vašich preferencí; ØNejdůležitějším kritériem pro hodnocení důvěryhodnosti se stal pocit skutečnosti. Díky uvedeným kontaktním adresám získávají lidé pocit, že se mohou kdykoliv na autora obrátit s problémem ohledně daného tématu Při každém psaní odborného textu je nutné uvádět všechny použité zdroje, ze kterých autor čerpal – dáno zákonem i součást citační etiky Proč? • citování výsledků nebo tvrzení jiných autorů potvrzujeme a podporujeme naše vlastní výsledky a tvrzení • nebo naopak citujeme autory, s jejichž myšlenkami, výsledky nesouhlasíme, polemizujeme s nimi Necitují se: • všeobecně známé poznatky (=to, co najdu v učebnicích) • učebnice a skripta • abstrakty z konferencí • bakalářské a magisterské práce předchůdců, disertační práce výjimečně Pozor na plagiátorství!!! Citace Primární x sekundární citace ØPrimární citace Ø - citujeme články, které máme tzv. „v ruce“, články, které jsme si celé Ø přečetly Ø - nikdy necitujeme pouze abstrakt, vždy si dohledáme a přečteme Ø celý článek Ø - téměř vždy Ø Sekundární citace – tzv. citace v citaci - nemůžeme se dostat k původnímu článku(A), ale přesto informaci v něm obsaženou potřebuji použít a tedy citovat - mohu citovat článek (B), ve kterém jsem se o tomto článku (A), ke kterému se nemohu dostat, dozvěděla, článek, ve kterém je výsledek nebo myšlenka článku A již citována - jen výjimečně Vždy se snažíme dohledat a přečíst si původní článek, nespoléháme na převzaté (sekundární) citace, může to vést k chybám! 2 formy citací v odborných pracích (BP, DP) a) citace v textu – zkrácená citace b) citace v přehledu literatury – úplná citace A) Citace v textu ØA) harvardský způsob Ø - v textu uvést v závorce jméno autora bez křestního jména a rok vydání Ø publikace) Ø Ø Ø Ø Ø Ø Ø Ø- celá podrobná citace, včetně jmen všech autorů, celého názvu článku a časopisu uvedena až v seznamu (přehledu) literatury Ø A)Jeden autor B) B) B) B)Dva autoři - spojky a, et, and A) A) A) A) C) Tři a více autorů - a kol., et al., aj., a spol. Pokud zároveň citovány 2 a více prací – oddělit středníkem Pokud citováno více prací od stejného autora, které byly vydané ve stejný rok – odlišit písmenem za rokem B) vancouverský způsob - v textu je uvedeno v závorce pouze číslo citace - celá citace uvedena v seznamu použité literatury V DP a BP je preferován harvardský způsob, vancouverský se nepoužívá! B) Citace v seznamu literatury • jména všech autorů • rok vydání • celý název článku • název (zkratka) časopisu • číslo svazku • první a poslední číslo stránky - Existuje mnoho modifikací – každý časopis má vlastní požadavky na styl Harvardský způsob citování – abecední seznam v přehledu literatury Vancouverský způsob – seřazeno v přehledu literatury podle pořadí výskytu ve vlastním textu Citování odborných knih Kniha, sborník: - jména autorů, rok vydání, název knihy, vydán, nakladatel, místo vydání - Kapitola z knihy, článek ze sborníku: - jména autorů, název kapitoly, první a poslední stránka kapitoly a plná citace knihy (viz výše) Citování internetových zdrojů • Elektronická databáze, monografie, počítačový program Autor, spoluautor. Název (druh nosiče). Vydání. Místo vydání: vydavatel, datum vydání, datum aktualizace, datum citování. Edice. Dostupnost a přístup. • Článek v elektronickém časopise Autor, spoluautoři. Název. Název časopisu. [druh nosiče]. Vydání. Označení čísla. Datum aktualizace/revize. Datum citování. Dostupnost. • za text uvést URL • za seznam literatury uvést seznam internetových zdrojů • necitovat zásadní informace, ty musí být podloženy tištěnou literaturou Zaměření a zpracování bakalářské práce, P.Lízal, Ph.D. Speciální případy • citování publikace, která je v přípravě – in prep. (v přípravě) – spíše necitovat, obsah i název se ještě mohou změnit • citování publikace, která je v tisku, již prošla recenzentním řízením – in press / v tisku • citování toho, co nám někdo sdělil ústní formou – personal communication / ústní sdělení • citace abstraktu ze sborníku abstraktů - Autor (autoři) – Název článku – In – Název sborníku – Nakladatelské údaje (místo, nakladatel) – rok – rozsah stran – ISBN (ISSN, není povinné) Zaměření a zpracování bakalářské práce, P.Lízal, Ph.D. Obrázky a tabulky Økaždý vložený obrázek nebo tabulka musí mít hlavičku a číselné označení, které se používá při odkazování v textu Øtabulky a obrázky se číslují odděleně Øčíslo a hlavičku je dobré doplnit o legendu – popisuje, co obrázek nebo tabulka znázorňuje, pomáhá čtenáři pochopit obsah tabulky nebo sdělení obrázku, aniž by to čtenář musel dohledávat ve vlastním textu Øpokud vytvoříme vlastní obrázek nebo tabulku, není nutná žádná citace Øpokud převezmeme tabulku nebo obrázek, případně jej i upravíme, je nutné uvést citaci publikace, odkud byly obrázky nebo tabulky přejaty – tato citace potom musí být uvedena i v seznamu literatury Øpřevzaté obrázky a tabulky by v BP a DP měly být přeloženy do češtiny Kde vzít seznam zkratek časopisů? ØVyhledávání zkrácených názvů časopisů Ø •názvy časopisů se v přehledu literatury udávají ve zkrácené podobě, •bývají doplněny ISSN (International Standard Serial Number, mezinárodní standardní číslo seriálové publikace) je jednoznačný osmiciferný identifikátor periodické publikace (noviny, časopisy, včetně těch vycházejících online). Ø l lWeb of Knowledge - seznam všech časopisů sledovaných v databázích WoK (16 521 titulů k 29.6.2010) •u každého titulu je uvedeno, ve které(ých) z databází(ch) v rámci Web of Knowledge je titul sledován •seznam lze prohlížet nebo vyhledávat konkrétní titul •nebo zvolit dílčí seznamy dle databáze (SCIE, SSCI, Current Contents, Biosis atd.) ljsou uvedeny samostatně také časopisy, u kterých došlo v posledních 12-ti měsících ke změně (např. byly do databáze přidány) l lhttp://apps.isiknowledge.com/additional_resources.do?highlighted_tab=additional_resources&product= WOS&SID=X1B7jEMNPa9c1nI1AAA&cacheurl=no l lzkratky časopisů sledovaných ve Web of Science •ve WoS jsou sledovány pouze impaktované časopisy - viz citační rejtříky a impakt faktor - dostupný v databázi Journal Citation Reports pozor: nově zařazené (12 měs. zpět) časopisy v JCR nefigurují - nemají ještě IF • •http://portal.isiknowledge.com/portal.cgi?DestApp=JCR&Func=Frame • Ø WoK Ø WoS •O každém časopisu jsou sledovány tyto údaje: –ISSN –Impact Factor –Immediacy Index –Total Cites: celková citovanost časopisu. –Articles: počet publikovaných článku v časopisu v daném roce. –Cited Half-life: po kolika letech (ve vztahu k aktuálnímu roku) se objeví 50% všech citací na články daného časopisu v citačních rejstřících. Napomáhá při hodnocení stáří citovaných článků. Uvádí se pouze u časopisů, které byly alespoň 100 a vícekrát citovány. –Citing Half-life: napomáhá při hodnocení stáří většiny článků, jež cituje daný časopis. Uvádí se pouze u časopisů, které citují 100 nebo více dokumentů. –Source Data: informace o počtu tzv. "non review" a "review" článků, o počtu citací v těchto článcích a o průměrném počtu citací připadajících na jeden článek časopisu. –Cited Journal: abecední přehled časopisů, které citovaly vyhledaný titul. –Citing Journal: abecední přehled časopisů, které citoval vyhledaný titul. • Sestavení seznamu publikací ØPublikace indexované ve Web of Knowledge ØPublikace indexované ve Web of Science ØPublikace již evidované v EndNote - EndNote® Web lEndNote Web je (bezplatný) volně dostupný citační program pro sběr a správu bibliografických citací a webových referencí. lAplikace EndNote Web je sdružena s citační databází Web of Science, ale dá se využívat i nezávisle na ni. lObjem dat je omezen na 10 000 záznamů a data jsou uložena na serveru ISI a dostupná prostřednictvím internetu. l ØUživatelé MU mají možnost zdarma využívat webovou aplikaci EndNote Web pro správu osobních bibliografických a webových referencí od firmy Thomson (producent databáze Web of Science). Ø ØPro získání přístupu je třeba se zaregistrovat na stránce http://www.myendnoteweb.com ØTutoriál k aplikaci EndNote Web je k dispozici na http://scientific.thomson.com/support/recorded-training/endnoteweb/ ØPři práci s Web of Science lze ukládat odkazy na vyhledané webové zdroje do svého EndNote Managera. C:\Users\User\Pictures\EndNoteKM_clip_image002_0005.jpg Ø C:\Users\User\Pictures\EndNoteKM_clip_image002_0019.jpg C:\Users\User\Pictures\EndNoteKM_clip_image002_0021.jpg ØUdává „kvalitu“ vědeckého časopisu Økolikrát je článek uveřejněný v tomto časopise v průměru citován (tedy na základě citačního indexu) Ø Ø počet citací článků, které vyšly Ø „Impact factor“ za rok X = v daném časopise v letech (X-1) a (X-2) Ø počet článků vyšlých v daném Ø časopise v letech (X-1) a (X-2) 1. 1.Pro zjišťování impakt faktoru je určen nástroj Journal Citation Reports. 2. 2.Je nutno si vybrat řadu (edici): lJCR Science Edition: přírodní a užité vědy lJCR Social Sciences Edition: společenské vědy 3. 3.Je možné si zvolit mezi několika způsoby vyhledávání: lView a group of journals by: vyhledávání podle předmětové kategorie, vydavatele nebo země lSearch for a specific journal: vyhledání konkrétního titulu časopisu (podle úplného názvu, slov z názvu, ISSN) lView all journals: prohlížení celého seznamu impaktovaných časopisů 4. l 4. IF IMPAKTFAKTOR a citovanost ØObjektivita IF: Ø Ørozdíly v hodnotě IF mezi různými obory ØRegionální časopisy (zbytek světa x USA) Ødoba hodnocení IF – Bezprostřední index (I.I.) – v daném roce (citační poločas) Øperiodicita – výhodu mají týdeníky – Nature, Science Ø Øpráce v časopise s malým IF = práce je „málo“ kvalitní Citovanost autorů ØPro zjišťování citovanosti autorů je určena databáze Web of Science (Cited Ref Search) ØCitace se vyhledávají podle jména autora a pro přesnější vymezení lze omezit vyhledávání na citace pocházející z určitého časopisu, nebo z určitého časového období (případně obojí). lTimes Cited: počet citací lCited Author lCited Work: časopis, ve kterém byl publikován citovaný článek. lYear, Volume, Page: další upřesňující údaje o článku. lView Record: zobrazení úplného záznamu o citovaném článku včetně odkazu na články, v nichž byl daný článek citován. Ø Citační Index Øjak lze měřit a porovnávat výsledky vědecké práce jednotlivců nebo vědeckých institucí Øhodnocení ohlasu dané publikace – kolikrát byl článek citován jinými autory Ø ØObjektivita: lcitovány jen publikace v hodnocených časopisech („známých“časopisech) lzahrnuty i citace typu: „Tvrzení uveřejněné v práci xy evidentně neplatí a i začátečník zde objeví v důkazu několik závažných chyb.“ lochota citovat konkurenci lčasto se citují 2 různé skupiny pracující na okrajovém tématu - mají vysoký CI lVýzkumné ústavy x univerzity lprůběh citovanosti závisí na oboru - v molekulární biologii je 2-5 let x ekologie více než8 let Nature – dělení na obory l ØChemistry lChemistry lDrug discovery lBiotechnology lMaterials lMethods and Protocols ØClinical Practice & Research lCancer lCardiovascular medicine lDentistry lEndocrinology lGastroenterology and hepatology lMethods and Protocols lPathology and pathobiology lUrology ØEarth & Environment lEarth sciences lEvolution & ecology ØLife Sciences lBiotechnology lCancer lDevelopment lDrug discovery lEvolution & ecology lGenetics lImmunology lMedical research lMicrobiology lMolecular cell biology lNeuroscience lPharmacology lMethods and Protocols lScitable Genetics lSystems biology ØPhysics lPhysics lMaterials Ø Rozdělení časopisu Ø20 August, 2010 Volume 142, Issue 4 pp. 497-648 Ø ØLeading Edge ØEssay ØPreviews ØReview ØArticles ØResource ØSnapShot Ø C:\Users\User\Pictures\0016cd65_medium.jpg PRACOVNÍK ØPublikační činnost lMU, IF, CI, pracoviště… Ø ØŽádost o výjezd do zahraničí lStudijní pobyt, pracovní stáž l ØHledání zaměstnání lÚP, aktivní hledání, akreditace, motivační dopis… Ø l Ø Ø Žádost o grant •Grantové prostředky lze získat jen na konkrétní grantový projekt •GAČR, IGA MZ, studentské… Ø ØŽádost o grant musí obsahovat všechny informace nezbytné k tomu, aby její posuzovatel byl schopen utvořit si jasnou představu navrhovaného vědeckého projektu. ØPosuzovateli jsou zkušení vědci s bohatými zkušenostmi s řešením vědeckých problémů a hlubokými znalostmi v příslušné vědecké oblasti. ØOriginální, Inovující, Realizovatelný a publikovatelný Ø lÚvod, obsahující krátkou diskusi k relevantním pracím provedeným na příslušném poli lCíl studie lPracovní hypotéza lOčekávané výsledky lVýznam pro základní a aplikovaný výzkum a pro praxi lMetody, způsob získávání dat, hodnocení lDiskuse lNáklady Ø Použité zdroje ØPřednášky: ØMetodika vědecké práce – A. Vaculová, Ph.D., J. Procházková, Ph.D Ø - Bi5353 Ø ØZaměření a zpracování bakalářské a diplomové práce – P.Lízala, Ph.D. Ø - Bi2401, Bi7401 Ø ØMedková M., Informace a Internet, Ústav informačních studií a knihovnictví, Ø Univerzita Karlova Ø ØNěmcová H., Hodnocení důvěryhodnosti informací získaných na Internetu, Filozofická fakulta Masarykovy Univerzity, 2007 • Metodika tvorby bibliografických citací - J. Kratochvíl, P.Sejk, V. Anthová, M. Stehlík - vydaly Knihovna univerzitního kampusu MU a Ústřední knihovna PřF MU ve spolupráci se servisním střediskem MU v roce 2010 - dostupné online http://is.muni.cz/do/rect/el/estud/lf/js10/metodika/web/ebook_citace.html Další možné zdroje Zaměření a zpracování bakalářské práce, P.Lízal, Ph.D