O podstatě buněčných  stěn kvasinek Prof. MUDr.  Marie Kopecká, CSc.  Biologický ústav Lékařské fakulty Masarykovy univerzity Kamenice 5, A6, 625 00 Brno mkopecka@med.muni.cz http://www.med.muni.cz/~mkopecka/ tel. 54949 4778 Buněčná stěna kvasinek • 1. Chemická podstata? • 2. Ultrastruktura? • 3. Funkce? • 4. Mechanismus vzniku? • 5. Na jakých modelech zkoumat? • 6. Jakými metodikami ? Modely použité ke studiu podstaty a ultrastruktury buněčné stěny kvasinek • Celé buňky • Protoplasty • Isolované buněčné stěny kvasinek • Purifikované biopolymery buněčné stěny kvasinek in vitro Saccharomyces cerevisiae : Nečas, 1956, 1961, 1965, 1971…; Gabriel 1965,1968,1973, 1984,1992, 1994; Gabriel et al. 1992, 1998, 2000, 2003,2006.. ; Svoboda 1965,1966, 1974,1992, 2005; Eddy a Williamson 1957, 1959; Nečas a Svoboda 1981, 1985. 1. celé buňky 2. nahé protoplasty 3. isolované stěny buněk 4. in vitro assembly Metodické přístupy ke studiu  buněčných stěn kvasinek • Světelná mikroskopie  (fázový kontrast, diferenciální interferenční kontrast) • Fluorescenční mikroskopie • Elektronová mikroskopie transmisní (TEM) • Elektronová mikroskopie skenovací SEM) • Rentgenová difrakční analysa (zahraniční spolupráce) • Purifikované enzymy (zahraniční spolupráce) • Specifické inhibitory  • Mutanty (získané ze zahraniční) • Radioisotopy  • In vitro assembly Ultrastruktura buněčné stěny kvasinkové buňky studovaná transmisní elektronovou mikroskopií • 1. za použití technik freeze-fracturing • a freeze-substituce se jeví buněčná stěnajako bezstrukturní. • 2. použití techniky ultratenkých řezů • ukázalo jen 2 vrstvy stěny: • – vnější vrstva je elektropositivní, • - vnitřní vrstva je elektronegativní. Závěr: Ultrastruktura buněčné stěny kvasinky zůstává nejasná. Dalším modelovým objektem studia buněčných stěn kvasinek se staly protoplasty • „Nahé“ protoplasty (stěna buněk enzymaticky odstraněna) rostou v tekutých médiích. • Na svém povrchu vytvářejí „fibrilární sítě“. • Jaká je jejich podstata? • Jaká je jejich ultrastruktura? • Jakým mechanismem vznikají? Výchozí literatura o stěně kvasinky Saccharomyces cerevisiae v šedesátých letech Chemické složení stěny Phaff HJ (1963) Cell wall of yeasts. Ann Rev Microbiol 17: 15‐30. • β‐1,3‐glukany • β‐1,6‐glukan • mannan • chitin  • proteiny  • lipidy ? Struktura stěny kvasinky: Houwink AL, Kreger DR (1953) Observations on the cell wall of yeasts. An electromicroscope and X‐ray Diffraction study. Antonie van  Leeuwenhoek 19: 1‐24. Nativní stěna kvasinek • v ELM amorfní (nefibrilární) • rtg difrakce: jen difusní difrakční diagramy→ chybí krystalický polymer Stěny po varu 0.5 N HCl 3 hod: • objevily se mikrofibrily z krystalického glukanu (=hydroglukan) • krystalický hydroglukan • krystalický chitin krystalizace hydroglukanu a  chitinu in vitro z uvolněných  lineárních řetězců • 1st ISYP Jena (1965): Kopecká, Čtvrtníček, Nečas: „O podstatě „fibrilárních sítí“, které se tvoří jako první stádium biogenese stěny u protoplastů kvasinky Saccharomyces cerevisiae“ . • PODSTATA FIBRILÁRNÍCH SÍTÍ PROTOPLASTů ? Vlastnosti sítí: • Proteasy • Lipasy • Hlemýždí enzymy + • PAS reakce (mannan) • 30% HCl - (chitin) • 3% NaOH (glukan) + Závěr: „fibrilární sítě“protoplastů jsou z alkali-solubilního glukanu • PODSTATA FIBRILÁRNÍCH SÍTÍ PROTOPLASTů dále studována POMOCÍ RENTGENOVÉ DIFRAKČNÍ ANALYSY ve srovnání s HCl-stěnami (tzv. „HCl-stěny“= „HYDROGLUKAN“ byl ukázán na přednášce - (po 3 hod varu stěn kvasinky Saccharomyces cerevisiae v 0,5 N HCl se stává rozpustný v alkáliích). • Sítě protoplastů po odstranění chitinu dávají vznik diagramu shodnému s lineárním β-1,3-glukanem paramylonem • Závěr: sítě obsahují lineární β-1,3-glukan. Publikace o podstatě fibrilárních sítí protoplastů • Kopecká, M., Čtvrtníček, O., Nečas, O. 1967. Formation and properties of the fibrillar network formed in yeast protoplasts as the first step of biosynthesis of the cell wall. In: “SYMPOSIUM ON YEAST PROTOPLASTS“. Jena 21.- 24.9.1965. R. Müller (ed.). Akademie Verlag Berlin (1967), pp.73-75, 343-344. • Kreger, D. R., Kopecká, M. 1973. On the nature of the fibrillar nets formed by protoplats of Saccharomyces cerevisiae in liquid media. In: “Yeast, Mould and Plant Protoplasts”. J. R. Villanueva, I. Garcia-Acha, S. Gascon, F. Uruburu (eds.). Academic Press London and New York (1973), pp. 117-130. • Kreger, D. R., Kopecká, M. 1976. • Assembly of wall polymers during the regeneration of yeast protoplasts. In: “Microbial and Plant Protoplasts”. J. F. Peberdy, A. H. Rose, H. J. Rogers, E. C. Cocking (eds.). Academic Press London, New York, San Francisco (1976), pp. 237-252. • Kreger, D. R., Kopecká, M. 1976. On the nature and formation of the fibrillar nets produced by protoplasts of Saccharomyces cerevisiae in liquid media: an electronmicroscopic, X-ray diffration and chemical study. J. Gen. Microbiol. 92:207-220. • Kreger, D.R., Kopecká, M. 1978. Nature of the nets produced by protoplasts of Schizosaccharomyces pombe during the first stage of wall regeneration in liquid media. J. Gen. Microbiol. 108: 269-274. • Kreger, D.R., Kopecká, M. 1981. The molecular organization of chitin in normal and regenerated walls of Saccharomyces cerevisiae. A reconsideration of ultrastructural data. In: “Cell walls 1981”. Proceedings of the Second Cell Wall Meeting. Göttingen. D.G. Robinson, H. Quader (eds.). Wissenschaftliche Verlagsgesellschaft mbH Stuttgart (1981), pp. 130-134. Metodický přístup: (i) Učinek purifikované chitinasy na sítě protoplastů (ii) Účinek purifikované endo-β-1,3 glukanasy ze Schizosacch.japonicus na sítě protoplastů Výsledky: Purifikovaná chitinasa nedegraduje mikrofibrily fibrilárních sítí zatím co purifikovaná β-1,3-glukanasa degraduje mikrofibrily. Závěr: mikrofibrily protoplastů S. cerevisiae jsou z β-1,3-glukanu. Z čeho jsou vystavěny mikrofibrily – z glukanu nebo chitinu? MECHANISMUS VZNIKU MIKROFIBRIL? 2 možné mechanismy vzniku mikrofibril β-1,3-glukanu: autoorganisací ? - „enzyme-directed“ assembly? Vlhké vzorky(m) Suché vzorky(d) A. In vitro dialysa C.In vitro neutral. 4°C B. In vitro neutralisace 69°C D.Nativní sítě protopl. Výsledky studia mechanismu vzniku mikrofibril jsou v publikaci: Kopecká, M., Kreger, D.R. 1986. Assembly of microfibrils in vivo and in vitro from 1,3-β-D-glucan synthesized by protoplasts of Saccharomyces cerevisiae. Arch. Microbiol. 143:387-395. Šířky triple-helixů z rtg analysy in vivo a in vitro vzorků mikrofibril ověřovány v ELM při zvětš. 300 000x In vivo: triple-helix 15.3 nm, v ELM 1.6 nm In vitro: triple helix 17.2 nm, v ELM 1.7 nm In vivo vytvořené mikrofibrily jsou z triple-helixů šířky 15. 3 nm, v ELM se jeví jako elementární fibrily šířky 1. 6 nm. In vitro vytvořené mikrofibrily jsou z triple-helixů šířky 17. 2 nm, V ELM se jeví jako elementární fibrily šířky 1. 7 nm. [Kopecká a Kreger (1986) Arch Microbiol 143:387-395] Nativní mikrofibrily vznikají mechanismem „enzyme-directed assembly“ • In vivo vytvořené mikrofibrily jsou z triplehelixů šířky 15. 3 nm, které se v ELM se jeví jako elementární fibrily šířky 1. 6 nm. Průkaz elementárních fibril elektronovou mikroskopií je v publikaci: • Kopecká, M., Gabriel, M. 1992. The influence of Congo red on the cell wall and 1,3-ß-D-glucan microfibril biogenesis in Saccharomyces cerevisiae. http://www.springerlink.com/content/n2n66763n 7213404/ Jsou mikrofibrily také v buněčné stně kvasinek? Purifikované enzymy užité k selektivní degradaci biopolymerů stěny kvasinek Saccharomyces cerevisiae (poskytnuté H. J. Phaffem) Účinkem pronasy došlo k částečnému odstranění vnější amorfní stěnové komponenty -mannoproteinové vrstvy- pod ní je jemná fibrilární textura, zatmelená amorfními glukany (viz dále) Purifikovaná bakteriální endoendo--ββ--1,61,6--glukanasglukanasaa aa endoendo--ββ--1,31,3 glukanasglukanasaa z Bacillus circulans odstraňují ze stěn kvasinky Sacch.cerevisiae amorfní komponentu, ale mikrofibrilární skelet stěny („exoskelet“) není degradován a dál uchovává původní tvar buňky Purifikovaná endo-β-1,3-glukanasa ze Schizosaccharomyces japonicus degradovala mikrofibrily stěny i amorfní glukan, resistentní byly jen jizvy po pučení a agregáty amorfního mannoproteinu. [Kopecká, Phaff a Fleet (1974) J. Cell Biol. 62, 66-76]. MikrofibrilyMikrofibrily jsou i ve stěně celých buněkjsou i ve stěně celých buněk kvasinkových mutantkvasinkových mutant 1. [Kopecká, Gabriel et al. (1991) J.Gen. Mcrobiol. 137: 1263-1270; 2. Gabriel a Kopecká (1995), Microbiology 141,891-899 ] i po účinku Konžské červeni [Kopecká a Gabriel (1992) Arch Microbiol. 158:115-126] Ultrastruktura buněčných stěn kvasinky Schizosaccharomyces pombe byla také studována po účinku purifikovaných enzymů elektronovou mikroskopií: • Purifikovaná endo-β-1,3-glukanasa z Bacillus circulans odstranila amorfní komponentu z buněčné stěny Schizosaccharomyces pombe a obnažila mikrofibrily uvnitř stěny, které byly resistentní k účinku enzymu. Podobný účinek měla i endo-β-1,6-glukanasa. • Purifikovaná endo-β-1,3-glukanasa kvasinky Schizosaccharomyces japonicus odstranila longitudinálně orientované mikrofibrily ze stěn, ale ve stěnách zůstává fibrosní textura s příčnou orientací. Amorfní materiál přetrvával v oblasti jizev. • Stěny byly ztráveny až kombinovaným účinkem endo-β-1,3glukanasy ze Schiz. japonicus + α-1,3-glukanasy z Bacillus circulans. Nalezeny pouze zbytky neztrávených stěn (jizvy) [Kopecká, Fleet a Phaff (1995) J. Ultrastruct Res 114:140-152 ] • Buněčné stěny kvasinky • Schizosaccharomyces pombe • obsahují mikrofibrily • z beta-1,3-glukanu • a z alfa-1,3-glukanu • Jakým mechanismem vzniká • buněčná stěna kvasinek? • Zkoumání mechanismu autoorganisace stěnových polymerů in vitro β-1,3-glukanové mikrofibrily vznikají mechanismem self-assembly in vitro z purifikovaného β-1,3-glukanu sítí protoplastů In vitro assembly purifikovaných stěnových polymerů: Purifikovaný mannan a purifikovaný β-1,6-glukan mají amorfní charakter. Purifikovaný β-1,3-glukan sítí protoplastů + mannan + β-1,6-glukan stěn mohou vytvářet nadmolekulární komplexy in vitro. Purifik.β-1,3 glukan sítí protopl.+ mannan + β-1,6-glukan stěn+ β-1,3 glukan stěn kvasinek mohou vytvářet nadmolekulární komplexy in vitro. Purifik. β-1,3 glukan sítí protopl. + mannan + β-1,6-glukan stěn + β-1,3 glukan stěn kvasinek A2 + glykogen mohou vytvářet nadmolekulární komplexy in vitro. Závěr: Při vzniku buněčné stěny kvasinek se může uplatňovat autoorganisace stěnových polymerů do nadmolekulárních struktur Závěry ad protoplasty Saccharomyces cerevisiae 1• Sítě syntetizované protoplasty Saccharomyces cerevisiae v tekutých médiích jsou z nerozpustných polysacharidů β-1,3-glukanu a chitinu (90% glukanu a 10% chitinu); mikrofibrily sítě jsou z β-1,3-glukanu. 2• Protoplasty Saccharomyces cerevisiae syntetizují v tekutých médiích lineární řetězce β-1,3-glukanu. β-1,3 glukan „větvící“ enzym, který „přiháčkovává“ ve stěně kvasinek k lineárním řetězcům boční větve, zřejmě u rostoucích protoplastů v tekutém mediu chybí (byl tekutým médiem z protoplastů odstraněn). 3• Sítě protoplastů nejsou zatmeleny, protože polymery amorfní matrix jsou rozpustné ve vodě. 4• Rozdíly v šířce triple-helixů zjištěné rtg difrakcí a ELM svědčí pro to, že nativní mikrofibrily in vivo nevznikají self-assembly, ale „ enzymedirected assembly“. 5• Základní stavební jednotkou nativních mikrofibril sítí protoplastů je elementární fibrila šířky 1.6 nm; její podstatou je triple-helix šířky 1.53 nm (d) a 1.58 nm (m). Závěry ad stěna Saccharomyces cerevisiae: 1•V nativní buněčné stěně kvasinky Saccharomyces cerevisiae jsou mikrofibrily β-1,3-glukanu, které tvoří „exoskeleton“ stěny. 2• Tyto mikrofibrily jsou ve stěně zatmeleny amorfními glukany s β- 1,3- a β-1,6 vazbami, na které se váží vnější mannoproteiny stěny. 3• Při vzniku stěny kvasinek se může uplatňovat autoorganisace biopolymerů stěny. Závěry ad protoplasty a stěna Schizosaccharomyces pombe 1• Mikrofibrily sítí protoplastů Schizosaccharom. pombe obsahují β-1,3-glukan a α-1,3-glukan. V sítích po reagregaci in vitro jsou 2 typy mikrofibril. 2• Stěna kvasinky Schizosaccharomyces pombe obsahuje mikrofibrilární kostru (exoskelet), která je z β-1,3-glukanových a z α-1,3-glukanových mikrofibril.Fibrilární skelet je maskován amorfními glukany s β-1,3- a β-1,6-vazbami. Lipke a Ovale (2002) J. Bacteriol 180: 3735-3740. (Saccharomyces cerevisiae) Souhrn přednášky I. STRUKTURA BUNĚČNÉ STĚNY KVASINEK • 1. Buněčná stěna kvasinek je lokalizovaná na povrchu buněk. • 2. Je vystavěna z biopolymerů: z polysacharidů a z glykoproteinů. • 3. Biopolymery zahrnují β‐1,3‐glukany, β‐1,6‐glukan,  mannoproteiny a chitin. • 4. Chitin je akumulován v jizvách po pučení, ale část molekul  chitinu je také dispergována v laterální stěně, kde asociuje s  dalšími biopolymery.  • 5. β‐1,3‐glukan asociuje do mikrofibril. Mikrofibrily tvoří rigidní  skelet buněčné stěny. Ostatní biopolymery tvoří amorfní matrix,  která zatmeluje mikrofibrilární glukanovou komponentu. II. PROTOPLASTY KVASINEK JAKO MODELY KE STUDIU  BIOGENESE NOVÉ BUNĚČNÉ STĚNY 1. Protoplasty Saccharomyces cerevisiae vytvářejí v tekutém živném  médiu tzv. „fibrilární sítě“. Jsou vystavěny z mikrofibril β‐1,3‐glukanu (90%) a obsahují také chitin (10%). 2. „Fibrilární sítě protoplastů „obsahují lineární β‐1,3‐glukan, rozpustný  v NaOH, jehož rentgenový difrakční diagram odpovídá lineárnímu  polysacharidu paramylonu (zásobní polymer Euglenophyt). 3. „Fibrilární sítě protoplastů „obsahují také rozvětvený β‐1,3‐glukan, jehož rentgenový difrakční diagram odpovídá rozvětvenému  glukanu buněčných stěn kvasinek, který je v komplexu s chitinem, a  tento komplex je nerozpustný v alkáliích. 4. Protoplasty kvasinek, které vytvoří v tekutém médiu jen „fibrilární  sítě“, nejsou schopné se dělit, a přežívají asi 24 hod. 5. Protoplasty kvasinek jsou však schopné sporulovat. Spory jsou  životaschopné a schopné přežívat a dát vznik vegetativním buňkám. III. FUNKCE BUNĚČNÉ STĚNY KVASINEK • 1. Buněčná stěna kvasinek je lokalizovaná na povrchu buněk,  a proto poskytuje kvasinkové buňce mechanickou ochranu. • 2. Buněčná stěna kvasinek je nezbytná pro vývoj geneticky  podmíněného tvaru buňky (cylindrického, ovoidního atp.). • 3. Buňky, které jsou zbaveny buněčné stěny, zaujímají tvar  koule („protoplasty“). • 4. Buňky zbavené buněčné stěny („protoplasty“) nejsou  schopné se dělit – nemohou realisovat cytokinesi, ale jaderné  dělení (mitosa) probíhat může; tak může vzniknout  vícejaderný kvasinkový útvar, který však není schopen bez  buněčné stěny přežívat ani se dělit, a časem umírá. • 5. Buněčná stěna je nutná ke konjugaci kvasinek. • 6. Buněčná stěna obsahuje enzymy a antigeny.  IV. BIOGENESE BUNĚČNÉ STĚNY KVASINEK • 1. β‐1,3‐glukan po rozpuštění může asociovat do  nadmolekulárních komplexů in vitro na principu  autoorganisace. • 2. β‐1,3‐glukan asociuje in vitro autoorganisací do   mikrofibril. • 3. Biopolymery stěny mohou asociovat do nadmolekulárních komplexů na principu autoorganisace molekul in vitro bez  účasti enzymů, bez dodání energie, bez přítomnosti  templátových struktur.  • 4. Tyto nadmolekulární komplexy stěnových biopolymerů vzniklé in vitro na principu autoorganisace molekul obsahují  mikrofibrily i amorfní matrix a připomínají texturu buněčné  stěny.  Děkuji za pozornost. Seznam publikací, týkajících se výzkumu buněčné  stěny kvasinek v období 1965 – 2011 lze nalézt na adrese: http://www.med.muni.cz/~mkopecka/