Biokatalyzátory
•Globulární bílkoviny – enzymy
•
•RNA - ribozymy



















table 5-2 part 1



table 5-2 part 2















table 6-2









table 6-1 part 1



table 6-1 part 2



table 6-1 part 3



table 6-1 part 4












Warburgův optický test

























































„Lock and key“ model
figure 5-09


figure 5-10
„Induced fit“ model


„Transition state“ model
figure 5-11


Aktivní místo
•Efekt přiblížení – překryv orbitalů
•Specifické mikroprostředí – pH, I, hydrofobita atd
•Dehydratace
•Koncentrační efekt - 105
•Vhodná orientace
•
•

Aktivační energie
•
•
•
•Uvolněna při vazbě substrátu na enzym

Mechanismus katalýzy
•Acidobazická
•Kovalentní
•Kovovými ionty
•Elektrostatická interakce
•Proximitní a orientační
•Přednostní vazbu přechodného komplexu

Acidobazická



Kovalentní



Kovovými ionty



Elektrostatickou interakcí



Proximitní a orientační



Přednostní vazbu přechodného komplexu



Lysozym
+


Lysozym



Lysozym









Lysozym
lysozyme























figure 5-05



Ustálený stav
E + S    ES ↔ EP    E + P
ssgraph

[USEMAP] figure 5-04









Stanovení Km a Vmax
figure 5-03


unnumbered figure pg 142



table 5-3



table 5-4















figure 5-15b






figure 5-15c






figure 5-15d



table 5-5



figure 5-18






figure 5-06






figure 5-07






Regulace koncentrací enzymu



Operonový model









Allosterie
allosteric2


Allosterie
allosteric


figure 6-02
Allosterie


Allosterický aktivátor
an-allo-activator


Allosterický inhibitor
an-allo-inhibitor


Symetrický model
figure 6-05


Sekvenční model
figure 6-06


Allosterie hemoglobinu



Myoglobin



Hem



Vazba O2 na Hb



Vazba O2 na Hb



Hb versus Mb



Solné můstky



Solné můstky



Solné můstky



Bohrův effekt – vliv H+ a CO2



Bohrův effekt – vliv H+ a CO2



Bohrův effekt – vliv H+ a CO2



Bohrův effekt – vliv H+ a CO2



pro05-04



Vliv BPG



Vliv BPG a nadmořská výška



Vliv BPG a nadmořská výška



Fetální versus normální Hb



Fetální versus normální Hb



figure 6-07
Regulace kovalentní modifikací
glykogenfosforylasa

Regulace kovalentní modifikací
glykogenfosforylasa
P
P
P
P




Regulace kovalentní modifikací
figure 6-08


Regulace zpětnou vazbou



Regulace









Abzymy
figure 6-11


Ribozymy – katalytická RNA
1989 Nobelova cena
•
•Altman (Yale University) ribonukleasa P
•
•Cech (University of Colorado) mRNA

Ribonukleasa P
figure 6-12


Autokatalytická mRNA
Tetrahymena thermophila
figure 6-13