Přihlášení na SDSC Biology Workbench:
login: C9531_student
password: student
Výstup ze sekvenátoru obsahuje část sekvence plasmidové cDNA patřící jednomu
z Vašich dvou vzorků. Víte, že sekvenace byla provedena za pomocí reverse
primeru a že první nukletid na 5' konci osekvenované části cDNA se nachází v
pozici 235, kdy na pozici 1 se nachazí adenin iniciačního kodonu. Červeně je
označen signál flouroforu navázaného na ddTTP, modře na ddCTP, zeleně na
ddATP a černě na ddGTP.
1. Určete sekvenci plasmidové cDNA odpovídající výstupu ze sekvenátoru.
2. Určete, které ze dvou uvedených nukleotidových sekvencí
(sekvence_protein1, sekvence_protein2) tato cDNA náleží.
3. Zjistěte rozdíly mezi nukleotidovou sekvencí (sekvence_protein1/2) a Vaší
cDNA a určete dopady jejího použití při expresi proteinu.