Přihlášení na SDSC Biology Workbench:
login: C9531_student password: student
Výstup ze sekvenátoru obsahuje část sekvence plasmidové cDNA patřící jednomu z Vašich dvou vzorků. Víte, že sekvenace byla provedena za pomocí reverse primeru a že první nukletid na 5' konci osekvenované části cDNA se nachází v pozici 235, kdy na pozici 1 se nachází adenin iniciačního kodonu. Červeně je označen signál flouroforu navázaného na ddTTP, modře na ddCTP, zeleně na ddATP a černě na ddGTP.
1. Určete sekvenci plasmidové cDNA odpovídající výstupu ze sekvenátoru.
5'-TCTTCATCTTGTGTTGCAACTTGAAGGTGGTAGTGGTTCTGGTCATCACCATCACCATCACTCCGC-3'
2. Určete,     které     ze     dvou     uvedených     nukleotidových sekvencí (sekvence_proteinl, sekvence_protein2) tato cDNA náleží.
sekvence_protein2
3. Zjistěte rozdíly mezi nukleotidovou sekvencí (sekvence_proteinl/2) a Vaší cDNA a určete dopady jejího použití při expresi proteinu.
inserce Adeninu, pri translaci zpusobi vznik stop kodonu