C2115 Praktický úvod do superpočítání -1-
C2115
Praktický úvod do
superpočítání
Petr Kulhánek, Jakub Štepán
kulhanek@chemi.muni.cz
Národní centrum pro výzkum biomolekul, Přírodovědecká fakulta,
Masarykova univerzita, Kotlářská 2, CZ-61137 Brno
organizace
C2115 Praktický úvod do superpočítání -2-
Obsah
 Organizace výuky
harmonogram, bloková výuka, zakončení předmětu
 Klastr WOLF
struktura, pravidla používání, správci, učebna 1.18
 Prerekvizity
účty, pracovní skupiny
C2115 Praktický úvod do superpočítání -3Organizace
výuky
C2115 Praktický úvod do superpočítání -4Harmonogram
semestru
Období pro zápis předmětů:
Výuka: 17. září 2012 - 21. prosince 2012
Období prázdnin: 22. prosince 2012 - 1. ledna 2013
Zkouškové období: 2. ledna 2013 - 13. února 2013
Celkový počet odpřednášených hodin: 14 x 2 hodiny = 28 hodin
Zakončení: kolokvium (2 kredity)
Celková hodinová zátěž předmětu: 2 kredity -> 2x 26 hodin = 52 hodin (viz ECTS Label)
C2115 Praktický úvod do superpočítání -5Bloková
výuka
Pondělí – Středa: výuka
začátek v 9:00, konec v 16:00
oběd a přestávky dle probírané látky
Čtvrtek: dopoledne exkurze MetaCentrum, CERIT-SC
výuka 13:00 – 16:00
Pátek: výuka
začátek v 9:00, konec v 10:00
závěrečný test: začátek v 10:00
Zakončení:
- finální test (1 hodina, 50 otázek) 50 bodů
- souhrnný protokol z dílčích cvičení, uvést všechny
odpovědi na otázky včetně jejich zadání
=======================================================
Celkem: 50 bodů
Uspěl: >= 30 bodů
C2115 Praktický úvod do superpočítání -6Klastr
WOLF
C2115 Praktický úvod do superpočítání -7Struktura
klastru WOLF
univerzitní síť
wolf.ncbr.muni.cz
místní síť
wolf.wolf.inet
wolf
switch
wolf03 wolf04 wolf05wolf02wolf01
wolf06 wolf07 wolf08 wolf23
server pracovní stanice (výpočetní uzly)
veřejně nedostupná doména:
wolf.inet
Operační systém: Ubuntu 12.04 (Precise) LTS
http://www.ubuntu.com/
C2115 Praktický úvod do superpočítání -8Pravidla
používání
Klastr WOLF je určen výhradně pro účely výuky či pro vědeckou práci v rámci
Národního centra pro výzkum biomolekul.
Dodržují se pravidla užívání počítačové sítě Masarykovy univerzity:
https://is.muni.cz/auth/do/rect/normy/smernicerektora/Smernice_MU_6-2011.pdf
Klastr WOLF Je vysloveně zakázáno používat pro:
 stahování nelegálního obsahu (autorsky chráněná díla apod.)
 rozesílání virů, spamů, nevyžádané pošty a podobných materiálů
 prolomení ochrany jiných počítačů
 čtení, mazaní či změnu nechráněného obsahu souborů jiných uživatelů
Přihlašovací jméno a heslo tvoří identitu uživatele a proto ji zásadně
nesdělujeme třetím osobám, neukládáme či zasíláme (např. e-mailem) v
nešifrované formě!
C2115 Praktický úvod do superpočítání -9Správci
klastru
Hlavní správce klastru WOLF:
Jakub Štěpán (xstepan3@chemi.muni.cz)
 zakládání nových účtů
 změna zapomenutých hesel
 správa hardware
 správa systému a systémových aplikací
Správce aplikací pro vědecko-technické výpočty (moduly):
Petr Kulhánek (kulhanek@chemi.muni.cz)
Než kontaktujete správce, prodiskutujte svůj problém s vaším kolegou, vyučujícím nebo
školitelem.
C2115 Praktický úvod do superpočítání -10Učebna
1.18
Učebna s 20 PC
3D vizualizace
Uspořádaní do
výpočetního klastru
Učebna je volně přístupná studentům, kteří jsou členové LCC skupiny a dále
studentům, kterým v daném semestru v učebně probíhá výuka.
Bezpečnost práce!
C2115 Praktický úvod do superpočítání -11-
Prerekvizity
C2115 Praktický úvod do superpočítání -12-
Prerekvizity
Přístup do pavilonu A4 a přes přepážku (ISIC)
Rozdělení do skupin (skupina A, B, C, D)
Studijní materiály
/home/kulhanek/Data/C2110
/home/kulhanek/Data/C2115
Přihlášení na klastr SOKAR
$ ssh sokar.ncbr.muni.cz
Přihláška do MetaCentra
http://metavo.metacentrum.cz