Fyzikálně-chemické základy NMR C5320 Kamenice, pavilon A5, místnost A5-1.14, 15.9. – 19.12.2014 Středa 15.00 – 16.50 přednáška Středa 17.00 – 17.50 cvičení Vladimír Sklenář (podzimní semestr 2014/2015, 2 + 1 hod./týden) Radovan Fiala Pavel Srb (cvičení) Národní centrum pro výzkum biomolekul a Ústav chemie, Masarykova univerzita v Brně. Kampus Bohunice, pavilon A4, místnost 1.22, tel. 549 497 022 e-mail:vladimir.sklenar@ceitec.muni.cz http://www.ncbr.chemi.muni.cz/ http://www.chemi.muni.cz/nmr/vs.html 1. Úvod: Historie NMR spektroskopie a současné trendy - využití NMR to ke studiu molekulární struktury v kapalné a pevné fázi, NMR tomografie a NMR zobrazování, pohledy do budoucna. 2. Základní principy: magnetický dipól, rezonanční podmínka, NMR spektrometr, Fourierova spektroskopie, ´klasický popis´ - Blochovy rovnice, relaxační procesy – spinmřížková a spin-spinová relaxace, Fourierova transformace, citlivost měření. 3. Dynamika spinových systémů: základní vlastnosti nukleárního spinového systému, teorie matic hustoty, maticové representace, operátory, spinový Hamiltonián v Hilbertově representaci, teorie průměrného Hamiltoniánu. 4. Součinový operátorový formalismus: základní principy, názvosloví, vývoj součinových operátorů, Hamiltonián v součinové bázi, složené rotace, pozorovatelné veličiny. 5. 1D Fourierova spektroskopie: excitační sekvence, principy spinového echa, měření relaxačních časů, přenos polarizace – metody INEPT a DEPT, složené pulzy, homo- a hetero-nukleární decoupling, pulzní gradienty 6. 2D Fourierova spektroskopie: základní principy a formální teorie detekce NMR ve dvou frekvenčních dimenzích, koherenční stezky. 7. Základní metody 2D spektroskopie: korelace chemických posunů - COSY, J-rozlišená spektroskopie – měření spin-spinových skalárních interakcí, korelace dipól-dipólových interakcí – NOESY, fázové cykly, varianty pro měření homo- a hetero-nukleárních spinových systémů, editace spekter. 8. Aplikace NMR ve strukturní analýze biomolekul: proteiny a peptidy, nukleové kyseliny, získávání strukturních parametrů: měření vzdáleností vodíkových atomů, určování dihedrálních úhlů, matematická rekonstrukce prostorové struktury makromolekul. Studijní materiál: Understanding NMR Spectroscopy, James Keeler, University of Cambridge, ISBN: 0470017872 Publisher: John Wiley & Sons, Published: 1. 11. 2005. Další literatura: 1. R.R.Ernst, G. Bodenhausen and A.Wokaun: Principles of NMR in One and Two Dimensions, Clarendon Press, Oxford, 1987. 2. N.Chandrakumar, S.Subramanian: Modern Techniques in High Resolution FT NMR, Springer Verlag, New York 1986. 3. A.E.Derome: Modern NMR Techniques for Chemistry Research, Pergamon Press, Oxford, 1987. 4. A. Bax: Two-dimensional NMR in Liquids, Delft University Press, Dodrecht, 1982. 5. Methods in Enzymology, vol. 176, 177 and 239: NMR, Eds. N.J.Oppenheimer, T.L. James, Academic Press, San Diego, 1987, 1994. 6. Frank J.M. van de Ven: Multidimensional NMR in Liquids, VCH Publishers, Inc., New York 1995. 7. D. Canet: Nuclear Magnetic Resonance – Concepts and Methods., J.Wiley & Sons, Chichester, 1996. 8. R. Freeman: Spin Choreography – Basic Steps in High Resolution NMR, Spektrum Academic Publishers, Oxford 1997. 9. S. Braun, H.-O.Kalinowski, S. Berger: 100 and More Basic NMR Experiments. VCH, 1996. 10. J.Schraml: Dvourozměrná NMR spektroskopie, Academia Praha, 1987. 11. Malcolm H. Levitt: Spin Dynamics. Basics of NMR. John Wiley&Sons, Chichester, 2001. 12. Francois Sauriol: Animated NMR Course (electronic version avilable at http://www.chem.queensu.ca/facilities/NMR/nmr/webcourse/index1.htm Navazující kurzy na PřF MU: • C6770 NMR Spectroscopy of Biomolecules • C7995 Advanced Methods of Biomolecular NMR • C8950 NMR - Strukturní analýza