C2115 Praktický úvod do superpočítání IV. lekce -1-
C2115
Praktický úvod do
superpočítání
IV. lekce
Petr Kulhánek
kulhanek@chemi.muni.cz
Národní centrum pro výzkum biomolekul, Přírodovědecká fakulta
Masarykova univerzita, Kamenice 5, CZ-62500 Brno
C2115 Praktický úvod do superpočítání IV. lekce -2Ubuntu
16.04
(code name: xenial)
http://www.ubuntu.com/
➢ Instalace Ubuntu Server
VirtualBox, přístup přes ssh, instalace aplikací
C2115 Praktický úvod do superpočítání IV. lekce -3Virtualizace
- Hypervisor
Hardware
Hostitelský OS
Hypervisor
OS
1
OS
2
OS
3
Virtualizace jsou postupy a techniky, které umožňují k dostupným zdrojům přistupovat
jiným způsobem, než jakým fyzicky existují. Virtualizovat lze na různých úrovních, od
celého počítače (tzv. virtuální stroj), po jeho jednotlivé hardwarové komponenty (např.
virtuální procesory, virtuální paměť atd.), případně pouze softwarové prostředí
(virtualizace operačního systému).
zdroj: www.wikipedia.org
Hypervisor – správce virtuálního strojů
Hostující OS (ve virtuálním stroji)
VirtualBox
www.virtualbox.org
Podporovaný hostitelský OS:
MS Windows, Mac OS X, Linux
Licence: freeware + proprietární rozšíření pro
nekomerční použití
C2115 Praktický úvod do superpočítání IV. lekce -4POZORNĚ
ČTĚTE NÁSLEDUJÍCÍ ZADÁNÍ
Instalaci nelze provést na uzlech, ne kterých je CPU bez HW podpory
virtualizace (stav k leden 2018):
wolf17, wolf18, wolf19
C2115 Praktický úvod do superpočítání IV. lekce -5Cvičení
1
Nainstalujte Ubuntu Server 16.04 do virtuálního prostředí VirtualBox.
1. Stáhněte instalační obraz (ISO) pro Ubuntu Server 16.04.3 LTS (64 bit verzi). Instalační
obraz stahujte do vašeho scratch adresáře (/scratch/login_name) [cestu pro ukládání
lze změnit v nastavení Firefoxu].
2. Nastavení VirtualBoxu (File -> Preferences)
1. Default Machine Folder: změňte na podadresář (dle vaší volby) ve vašem scratch
adresáři (/scratch/login_name)
3. Vytvoření virtuálního stroje
1. Název stroje podle vašeho uvážení, Linux, Ubuntu 64 bit, další nastavení ponechte
na výchozích hodnotách.
2. Ověřte, že se vám virtuální disk vytvořil ve vašem scratch adresáři (Nastavení:
Storage, označit virtuální disk ze seznamu, ověřit cestu uvedenou v položce
"Location")
C2115 Praktický úvod do superpočítání IV. lekce -6Cvičení
1, pokračování
4. Nastavení virtuálního stroje
1. Network -> Attached to: NAT
2. Network -> Advanced -> Port Forwarding
1. Host Port: 2222
2. Guest Port: 22
3. Zbytek ponechat nezměněn
5. Spuštění virtuálního stroje
1. Volba instalačního media, zvolit instalační ISO obraz.
2. Při instalaci následujte pokyny na další straně.
C2115 Praktický úvod do superpočítání IV. lekce -7Stručné
pokyny pro instalaci
1. teritorium – Czech Republic (v Others -> Europe)
2. anglická klávesnice (US) – nepoužívejte autodetekci
3. jméno stroje - libovolný název (pouze písmena, bez diakritiky)
4. Vytvoření uživatele:
1. jméno uživatele – libovolné
2. přihlašovací jméno – STEJNÉ* jako na klastru WOLF
3. heslo – nejlépe stejné jako na klastru WOLF (není podmínkou), pro zadávání hesla
nepoužívejte numerickou část klávesnice
5. nešifrujte domovský adresář
6. použijte celý disk bez LVM
7. nainstalujte OpenSSH server (volba se označuje klávesou Space), pokud se zapomene
zvolit, je možné později doinstalovat pomocí:
8. Grub instalovat do MBR (Master Boot Record) zařízení /dev/sda
Poznámka: grafické rozhraní je možné zprovoznit instalací balíčku ubuntu-desktop
(neděláme, je časově náročné a zvyšuje paměťové nároky virtuálního stroje)
$ sudo apt-get install openssh-server
* jinak si velmi zkomplikujete život
C2115 Praktický úvod do superpočítání IV. lekce -8Virtuální
síť
ssh vzdálený term. #2
(konsole)
ssh vzdálený term. #3
(konsole)
port 2222
ssh server
port 22
VirtualBox
NAT
Hostitelský stroj (wolfXX)
Obrazovka
lokální term. #1
Ubuntu server
virtuální stroj (ubuntu)
ID: ubuntu
ID: wolfXX
port
forwarding
ssh vzdálený term. #4
(konsole)
virtuální stroj může přistupovat
k venkovní síti přes NAT
k virtuálnímu stroji není
možné přistupovat přímo z
venkovní sítě
ssh server
port 22
ssh vzdálený term. #1
(konsole)
C2115 Praktický úvod do superpočítání IV. lekce -9Cvičení
2
1. Přihlaste se do běžící instance virtuálního stroje přes grafické rozhraní virtualizačního
prostředí.
2. Přihlaste se do běžící instance virtuálního stroje pomocí programu ssh z hostitelského
počítače. Otevřete několik nezávislých sezení.
3. Příkazem w (nebo who) vypište seznam aktuálních sezení na virtuálním stroji.
4. Přihlaste se do běžící instance vašeho virtuálního stroje pomocí programu ssh z uzlu
wolf01.
ssh -p 2222 server_login@wolfXX
nebo
ssh -p 2222 server_login@localhost
verze s „localhost“ se musí spouštět
ze stroje, na kterém běží váš virtuální
stroj
část „server_login@“ se použije,
pokud jste si při instalaci vytvořili
účet s jiným přihlašovacím jménem
(„server_login“ se nahradí vašim
přihlašovacím jménem ve virtuálním
stroji)
C2115 Praktický úvod do superpočítání IV. lekce -10Cvičení
3
1. Nainstalujte program mc : $ sudo apt-get install mc
2. K čemu slouží program mc?
3. Vypněte server: $ sudo poweroff
4. Zapněte server.
5. Vytvořte snapshot virtuálního stroje (Machine->Take Snasphot ...)
6. Přihlaste se interaktivně jako superuživatel ($ sudo su -)
7. Co je to NAT?
8. Nainstalujte balíček „pi“. K čemu slouží?
instalace balíčku (aplikace) s názvem mc
Přehled balíčků: https://packages.ubuntu.com/