Praktikum z molekulární biologie prokaryot - Bi7311
úterý: 10:00 - 13:50; čtvrtek: 08:00 - 09:50
I. skupina
Datum č.
18.9.2018 Bezpečnost práce a rozdělení studentů do skupin, informace k cvičení pro všechny zaregistrované
25.9.2018 I. Úloha: Izolace spontánních mutant metodou gradientních ploten
27.9.2018 I. Úloha: Izolace spontánních mutant metodou gradientních ploten - pokračování, II.Úloha: HGT: GTA - příprava a teorie
2.10.2018 I. Úloha: Izolace spontánních mutant metodou gradientních ploten - přečárkování sp. mutant; II.Úloha: HGT - transdukce phiJB, GTA - přenos do recipienta
4.10.2018 II.Úloha: HGT - transdukce phiJB, GTA - vyhodnocení, I. Úloha: Izolace spontánních mutant metodou gradientních ploten - vyhodnocení
9.10.2018 III. Úloha: Konjugace; IV. Úloha: PFGE - příprava bločků z transduktant a polylysogenních lab. kmenů
11.10.2018 III. Úloha: Konjugace vyhodnocení frekvence; IV. Úloha: PFGE - instrukce k vlastnímu přístroji
16.10.2018 IV. Úloha: PFGE - štěpení bločků; V. Úloha: Konformace plazmidové DNA (pDNA bude k dispozici, dělají ELFO), PCR na geny rezistence na plazmidech; VI. Úloha: Sestřih fágového endolyzinu: Izolace RNA Trizolem
18.10.2018 IV. Úloha:PFGE - nanášení na gel
23.10.2018 VI. Úloha: Sestřih fágového endolyzinu - přepis RNA do cDNA, PCR
25.10.2018 VI. Úloha: Sestřih fágového endolyzinu - ELFO; V. Úloha: PCR na geny rezistence - ELFO
30.10.2018 VII. Úloha: Stanovení počtu plazmidů pomocí qPCR v donorových a recipientních kmenech z úlohy č. II
1.11.2018 VII. Úloha: Stanovení počtu plazmidů pomocí qPCR v donorových a recipientních kmenech - vyhodnocení
II. skupina
Datum č. Úloha
6.11.2018 I. Úloha: Izolace spontánních mutant metodou gradientních ploten
8.11.2018 I. Úloha: Izolace spontánních mutant metodou gradientních ploten - pokračování, II.Úloha: HGT: GTA - příprava a teorie
13.11.2018 I. Úloha: Izolace spontánních mutant metodou gradientních ploten - přečárkování sp. mutant; II.Úloha: HGT - transdukce phiJB, GTA - přenos do recipienta
15.11.2018 II.Úloha: HGT - transdukce phiJB, GTA - vyhodnocení, I. Úloha: Izolace spontánních mutant metodou gradientních ploten - vyhodnocení
20.11.2018 III. Úloha: Konjugace; IV. Úloha: PFGE - příprava bločků z transduktant a polylysogenních lab. kmenů
22.11.2018 III. Úloha: Konjugace vyhodnocení frekvence; IV. Úloha: PFGE - instrukce k vlastnímu přístroji
27.11.2018 IV. Úloha: PFGE - štěpení bločků; V. Úloha: Konformace plazmidové DNA (pDNA bude k dispozici, dělají ELFO), PCR na geny rezistence na plazmidech; VI. Úloha: Sestřih fágového endolyzinu: Izolace RNA Trizolem
30.11.2018 IV. Úloha:PFGE - nanášení na gel
4.12.2018 VI. Úloha: Sestřih fágového endolyzinu - přepis RNA do cDNA, PCR
6.12.2018 VI. Úloha: Sestřih fágového endolyzinu - ELFO; V. Úloha: PCR na geny rezistence - ELFO
11.12.2018 VII. Úloha: Stanovení počtu plazmidů pomocí qPCR v donorových a recipientních kmenech z úlohy č. II
13.12.2018 VII. Úloha: Stanovení počtu plazmidů pomocí qPCR v donorových a recipientních kmenech - vyhodnocení
Seznám úloh plánovaných na podzim 2018:
1. Izolace spontánních mutant metodou gradientních ploten
2. HGT - transdukce phiJB, GTA - nové
3. Konjugace
4. PFGE
5. Konformace plazmidové DNA
6. Sestřih fágového endolyzinu (metoda izolace RNA Trizolem, přepis do cDNA, PCR) - nové
7. Stanovení počtu plazmidů pomocí qPCR
6
6
Úloha
1
2
3
4
5
1
2
3
4
5