Aktuální poznání fylogeneze eukaryot a mnohobuněčných živočichů (Metazoa) Sylabus 2018; 21.11. odpadá 1. Aktuální fylogeneze superskupin eukaryot a báze živočichů (přednáška) 2. Volně žijící jednobuněčná eukaryota: prohloubení znalostí o jednotlivých taxonech (přednáška) 3. Volně žijící jednobuněčná eukaryota: naši zástupci (cvičení) 4. Porifera: naši zástupci a jejich determinace (přednáška a cvičení) 5. Aktuální fylogeneze živočichů: Eumetazoa a kořen Bilateria (přednáška) 6. Hydrozoa: naši zástupci a jejich determinace (přednáška a cvičení) 7. Aktuální fylogeneze živočichů: novinky a vybrané skupiny prvoústých (přednáška) 8. Ectoprocta: naši zástupci a jejich determinace (přednáška a cvičení) 9. Evoluce orgánových soustav: nervová, dýchací, trávicí a pohlavní soustava (studentské referáty) 10. Evoluce orgánových soustav: tělní dutina, vylučovací a oběhová soustava (studentské referáty) Vývoj systematických koncepcí I. • Aristoteles (384-322 BC): dělení známých živočichů (ca 500) na "s krví" (Amniota) a "bez krve" (zbytek) • C. von Linné (1707-1778): tři říše – Lapides ("kameny"), Vegetabile, a Animalia – ty dělil na šest tříd: Mammalia, Aves, Amphibia, Pisces, Insecta (hmyz a stonožkovci), Vermes ("červi", měkkýši a ostatní bezobratlí) • J.B. Lamarck (1744-1829): zavedl názvy bezobratlí a obratlovci (nahradil tak označení s krví a bez krve); bezobratlé pak dělil do deseti tříd • H.M.D. de Blainville (r. 1825) zavedl pojem "kmen" jako nejvyšší taxonomickou jednotku PROKARYOTA EUKARYOTA (bakterie, archea, sinice) Buněčné organismy – dva základní typy 1 500 000 spp.12 000 spp. Vznik eukaryotické buňky • Teorie endosymbiózy (L. Margulis 1970 a 1996): eukaryota vznikla z archeí, která po zdokonalení cytoskeletu získala schopnost fagocytovat jiná archea resp. sinice, ze kterých vznikly mitochondrie resp. chloroplasty; asi před 3(1,9) až 0,9(1,4) miliardami let • Archaea jsou eukaryotům fylogeneticky bližší • nejistota kořene – je mezi pravými bakteriemi a zbytkem organismů nebo někde uvnitř bakterií • Archaea – možné parafylum, jen část je blízce příbuzná eukaryotům • jedná se spíše o grády • tři domény: Eubacteria Archaea Eukaryota 90 léta: prokaryota jsou pravděpodobně parafylum A) Tři domény B) Hypotéza eocyta C) Eukaryota jako první D) Symbiogeneze Tři domény a jejich příbuzenské vztahy • Eukaryota nejsou blízcí příbuzní Archaea • jsou genoví hybridi Archaea a Eubacteria • možný amitochodriální eukaryotický předek - vzniklý spojením archebakterie a eubakterie /asi spirochéty/ • pozdější vznik mitochondrie (Mi) • plastid (Ps) vzniká ještě později Aktuální pohled (Hedges 2002: Nature) Cy: sinice Ap: α-proteobakterie Ps: plastid Mi: mitochondrie Eu: eubakterie Am: amitochondriální linie An: živočichové Fu: houby PI: rostliny • její vznik znamená nejzásadnější evoluční událost od vzniku života a je spojen s těmito znaky: – úplná změna topologie (uspořádání) buněčných membrán – reorganizace genetického materiálu – vznik buněčné kostry = cytoskeletu (spíše zdokonalení) • výsledkem je složitý komplex různých typů organismů hostitelské buňky a symbiotických bakteriálních mitochondrií • efektivní metabolismus uvnitř buňky v mitochondriích / choloroplastech; u prokaryot na povrchu buňky Eukaryotická buňka a její vznik bílkoviny savčí buňky a geny s nimi spojené jsou z 23 % totožné se všemi organismy, z dalších 29 % jsou spojeny se vznikem eukaryotické buňky a 27 % se vznikem mnohobuněčnosti EUBACTERIA ARCHEA Genová příbuznost eukaryot k prokaryotům Jednobuněčná eukaryota – historie • A. von Leeuwenhoek (r. 1675): zveřejnil svá pozorování drobných "bytostí" v kapce vody vlastnoručně vyrobenou lupou • tyto bytosti byly nazývány jako animacula (zvířátka); až později Infusoria (nálevníci), když se zjistilo, že jsou hojné zejména v nálevech z trávy nebo půdy • považována za raná vývojová stádia či zárodky vodních živočichů – Jaubleau jim kreslil oči a ozubenou tlamu • Linné (r. 1767) všechny jednobuněčné organismy zařadil do rodu Chaos • R.A. von Koelliker a C.T.E. von Siebold (pol. 19 st.): Protista – definice prvoků jako jednobuněčných organizmů (odlišení od volných buňek, např. krvinky) • R.H. Whittaker (r. 1959): systém pěti říší, (Monera = "prvoci" bez jádra) • T. Cavalier-Smith (r. 1981): zavedl Chromista • Protista: popsal E. Haeckel (1866), zrušil J.O. Corliss (1994), rozpad na několik skupin (Protozoa, Chromista, atd.; dnes Excavata, SAR, atd.). Vývoj systematických koncepcí II. • "tradiční" koncept šesti říší: Archezoa, Protozoa, Chromista, Plantae, Fungi, Animalia (Cavalier-Smith 1993; Corliss 1994) Vývoj systematických koncepcí III. • Archezoa (praprvoci) – primárně amitochondriální eukaryota (nejznámější jsou Archamoebae a Metamonada); dnes nejsou taková známá (neznamená, že nejsou nebo nebyla), protože všechna známá eukaryota mají aspoň zbytky mitochondrií (byť jen na genové úrovni) • Adl et al. 2005: koncept šesti superskupin eukaryot na základě genomické analýzy - linie, kde došlo ke ztrátě mitochondrií (Adl et al. 2005) Fylogeneze eukaryot – moderní pojetí (do 2012) Opisthokonta: houby, mnohobuněční živočichové, někteří „prvoci“ Amoebozoa: měňavky, hlenky, řada „bičíkovců“ (pohyb hlavně bičíky) Rhizaria: „bičíkovci“ a kořenonožci (pohyb hlavně panožkami) Excavata: většinou „bičíkovci“ (např. trypanozomy) a někteří kořenonožci Archaeplastida: pravé rostliny, zelené řasy, ruduchy a glaukofytní řasy Chromalveolata: „prvoci“ (např. nálevníci), rozsivky, hnědé řasy (chaluhy) a „plísně“ „6 říší“ * * * * - linie, kde vznikly mnohobuněčné formy - Unikonta - Bikonta Archaea (Adl et al. 2005) Poslední consensus fylogeneze eukaryot Adl et al. 2012; Eukar. Microbiol. Rhizaria !!! Světle šedě dole jsou skupiny eukaryot nejasného fylogenetického postavení tzv. incertae sedis. Fylogeneze eukaryot – aktuální pojetí Opisthokonta: houby, mnohobuněční živočichové, příbuzní jednobuněční Amoebozoa: měňavky, hlenky, několik linií „bičíkovců“ „Excavata“: většinou „bičíkovci“ (např. trypanozomy), některé měňavky Archaeplastida: pravé rostliny a zelené řasy, ruduchy, skrytěnky SAR: rozsivky, chaluhy, „kořenonožci“, nálevníci, výtrusovci, obrněnky 5 superskupin * * * * - linie, kde vznikly mnohobuněčné formy - Opimoda - Diphoda Archaea ? (Adl et al. 2012) • Eukaryota jsou monofylum – všechny živočišné a rostlinné organismy lze redukovat na jediný prvotní druh (společný předek) • jednobuněční eukaryonti netvoří monofyletickou skupinu, i když jsou si podobní svou jednobuněčností či chyběním buněčné somatické diferenciace • v minulosti představa lineární fylogeneze, představa fylogeneze jako žebříku pokroku - byla doba, kdy vznikly dnešní formy jednobuněčných organizmů, z nich posléze bezobratlí, kteří připravili půdu pro obratlovce • dnešní organismy jsou výsledky evoluce, která má podobu košatého stromu a my vidíme jen koncové větve (v minulosti existoval jednobuněčný předek, ze kterého vznikly jak některé dnešní jednobuněčné formy, tak některé mnohobuněčné) Průběh fylogeneze eukaryot 103 106 103 105 104 Srovnání druhové bohatosti superskupin eukaryot „Říše“ Opisthokonta • jednobuněčná stádia mají jediný, jednoduše stavěný tlačný bičík na zadním konci • mitochondrie s plochými kristami • u některých skupin je schopnost syntetizovat kolagen a využívat glykogen jako hlavní zásobní látku Fungi několik skupin jednobuněčných organismů, fylogeneze nejasná Ministeriida Choanoflagellata Metazoa ? - Holozoa fylogeneze „Choanozoa“ • = CHOANOZOA s.str. • sladkovodní i mořské, volně žijící i přisedlé, soliterní i koloniální, často s želatinózním obalem a někdy s jemnými křemičitými nebo celulózními schránkami • bičík je obklopený cytoplazmatickým „límečkem“ = kruhem 15-50 mikrovillů (tyčinkovité výběžky plazmy) vyztužených aktinovým cytoskeletem a propojených vláknitou sítí • přes mikrovili je pohybem bičíku hnána voda, zachycení potravy, fagocytóza CHOANOFLAGELLATA – trubénky Proterospongia haeckeli - trubénka Haeckelova trubénky - zástupci buňky v kolonii bývají propojeny cytoplazmatickými můstky, vnitřek obsahuje améboidní buňky ve slizovité hmotě - připomíná jednoduše stavěného živočicha; množí se nepohlavně, některé přisedlé produkují stádia s tlačným bičíkem - ty se nemohou dělit (zůstalo to i mnohobuněčným - spermie, neuron) Hexactinellida Demospongia? - Eumetazoa „Porifera“ Choanoflagellata Calcispongia Ctenophora Placozoa Cnidaria Bilateria (+ Myxozoa) dřívějšíRadiatačiDiploblastica ? Bazální mnohobuněční (Metazoa) – fylogeneze Porifera – možné fylogenetické scénáře (Brocks & Butterfield 2009: Nature) !!! Hexactinellida Demospongia - Eumetazoa „Porifera“ Choanoflagellata Ctenophora Placozoa Cnidaria Bilateria (+ Myxozoa) Bazální mnohobuněční (Metazoa) - fylogeneze Homoscleromorpha Calcispongia dřívější"Radiata"či"Diploblastica" Porifera – aktuální fylogeneze (Nosenko et al. 2013) • Homoscleromorpha (plakiny) – nová linie (popis 2012), původně mezi Demospongia • mořští, 84 spp. dvou čeledí, většinou v mělkých vodách • unikátní čtyřosé křemičité jehlice: volně v těle (netvoří kostru, uvnitř amorfní org. hmota) Plakina sp. potrava amébocyty napojené na choanocyty potravní vakuola mikrovily propojené mikrofibrily jsou mikrofágové - pomocí choanocytů vychytávají potravu (řasy a detrit) z vody - účinný filtrační aparát, který nemá jinde obdoby houbovci – příjem potravy plazmatický límeček Cladorhizidae – predátoři mezi houbovci • nemají filtrační kanálky ani choanocyty, makrofágie – adaptace na hlubokomořské podmínky, pasivní lapání na háčky (korýšů)