VÝVOJOVÉ PROCESY U ROSTLIN (1) rigidní buněčná stěna (celulóza) brání migraci buněk i lokomočnímu pohybu (2) vývoj ovlivněn environmentálními faktory, vznikají fyziologické i genomové adaptace (3) formy těla vznikají na základě rozdílů v rychlostech buněčného dělení a buněčným dělením v odlišných rovinách (4) veškerý postembryonální růst (včetně tvorby orgánů) pochází z meristémů (kmenové buňky) (5) nemají pravou zárodečnou dráhu, tranzice vývoje vegetativního na generativní (6) výrazný regulativní vývoj, mezibuněčnými signály jsou mj. nízkomolekulární hormony (7) cytoplazmatické kanálky (plasmodesmata) spojují sousední buňky skrze stěny (8) jedním z mechanismů diferenciace je i asymetrické buněčné dělení (9) jakákoli buňka dává vznik novému jedinci – totipotence: únik z determinovaného stavu? (10) dvě nezávislé skupiny strukturně odlišných homeotických genů odpovídají za specifikaci květních částí (MADS-boxové) a stonku i listů (homeoboxové), kolinearita genů neplatí Cyanobacteria – pradávní předchůdci řas a rostlin ? Gen pat5 Anabaena (Nostoc) řídí vývoj N2-fixující heterocysty nitrát-bohaté médium nitrát-chudé médium zvýšená exprese (inhibitoru) pat5 delece (inhibitoru) pat5 … jednobuněčná zelená eukaryota : Chlamydomonas a Volvox trepky Chlamydomonas reinhardtii • eukaryotická, ale jde s ní manipulovat mikrobiologickými technikami • snadná kultivace – fotosyntetická či heterotrofní • mobilní, vykazuje rysy jednoduchého chování • lze pěstovat v synchronní či asynchronní kultuře • má rychlý mitotický cyklus, podrobuje se pohlavnímu rozmnožování • propracovaná genetika – jaderné, plastidové i mitochondriální genomy mají vhodné markery • všechny tři genomy mohou být transformovány • dostupné knihovny mutantů a klonů DNA • možné skladování v tekutém dusíku Evoluce mnohobuněčných organizmů Chlamydomonas Gonium Pandorina Eudorina Pleodorina Volvox Pandorina  studium ontogeneze a fylogeneze mnohobuněčnosti a buněčné diferenciace  základní tělní plán: asi 2000 biflagelátních somatických buněk a 16 asexuálních reprodukčních buněk ( gonidia )  diferenciace je buněčně autonomní  centrálním rysem diferenciace je asymetrická mitóza ( cell size determines cell fate, large vs. small )  buněčná stěna Chlamydomonas se vyvinula ve strukturovanou extra-celulární glykoproteinovou matrix, která spojuje buňky do kolonie ( spheroid )  bičíkaté somatické buňky ( specializované k pohybu, fototaxi a chemotaxi ) se podrobují programované smrti  neobvyklá kombinace rostlinných ( fotoautotrofie ) a živočišných ( pohyb a časná diferenciace zárodečné dráhy ) znaků  pozorování Antoni van Leeuwenhoeka (1700), kultivace in vitro a životní cyklus - Bill Darden (1966), identifikovány odlišné sexuální formy  asexuální životní cyklus řízen světlem, trvá 2 dny a vzniká 16 nových jedinců  izogenní linie  nepohlavní embryo tvořené na konci rýhování má už své vlastní somatické a zárodečné buňky  pohlavní reprodukce je iniciována teplem, které vyvolá syntézu glykoproteinového feromonu v somatických buňkách: dormantní diploidní zygota  vrchol „volvocinní“ větve zelených řas, jednobuněčná bičíkatá Chlamydomonas, koloniální Eudorina a Pleodorina, buněčně diferencovaný Volvox Vlastnosti modelu váleče David L. Kirk St. Louis Antoni van Leewenhoek (1632-1723) asexuální životní cyklus váleče ( Volvox carteri ) - asymetrická mitóza definuje zárodečnou dráhu - 16 gonidií a asi 2 000 bičíkovců, programovaná smrt velké buňky malé buňky gonidia somatické buňky somatické reprodukční funkce funkce regA lag vypnut vypnut asymetrická buněčná dělení zralé gonidium symetrická buněčná dělení 32-buněčné embryo Model řízení diferenciace zárodečné dráhy u Volvox geny gls způsobují asymetrické dělení vedoucí ke tvorbě velkých (geny lag zapnuty, regA vypnuty) a malých buněk (regA zapnuty, lag vypnuty) Acetabularia : jednobuněčný model regenerace a posttranskripční regulace Acetabularia acetabulum reprodukční čepička cysty klidová cysta klíčící cysta jádro konjugace zygota 2 dny 8 dnů 60 dnů jádro rhizoid verticilie čepička Řízení diferenciace na úrovni translace rozříznutí stonku RNáza aktinomycin Ddegradace inhibice mRNA transkripce odstranění RNázy (neodstranění aktinomycinu) regenerace regenerace z fragmentu pouze z s jádrem enukleované části Vliv stávající cytoplasmy a syntézy nových mRNA na morfologii regenerované čepičky Acetabularia mediterranea Acetabularia crenulata dekapitace transplantace rhizoidů s jádry „vegetativní hybridy“ chaluha chaluhy mnohobuněčné nižší rostliny : stélka budoucí stélka stěna vajíčko bazální buňka apikální buňka budoucí rhizoid rhizoid receptákule (plodnice) konceptákule (s gametami) vzduchové měchýřky Životní cyklus modelové mnohobuněčné řasy: Fucus spiralis Fucus : model studia polarity zygoty světlo stélka rhizoid polarizace zygoty A B odstranění bazální buňky vede k deleci rhizoidu zbytky bazální buňky umožňují vznik pseudorhizoidu gravitace … vývojové modely : jatrovka Y n = 8A + X n = 8A + Y Marchantia polymorpha porostnice mnohotvará (dvoudomá) Mechy – zkrutek ( jednodomý ) Physcomitrella patens n = 27 chrs, C = 0,46 pg DNA haploidní „tělo“ cílená integrace genů zelený model 21. st. Izolace mutací s fenotypovým projevem Životní cyklus jednodomého mechu Physcomitrella patens Didier G. Schaefer U de Lausanne 2n n meiósa fúze Ceratopteris richardii „C-fern“ kapradina rohatec n = 39 chrs, C = 10 pg model hormonální sex-determinace (feromon ceratopterin) homospóry gametofyt, prokel (autotrofní, jednodomý)antheridium, pelatky (samčí pohlavní orgán) archegonium, zárodečníky (samičí pohlavní orgán) obrvená spermie OPLOZENÍ oocyt kanál GAMETOFYT ( n ) SPOROFYT ( 2n ) zygota embryo starý gametofyt mladý sporofyt list výtrus- nice výtrus- nice MEIÓSA DIPLOIDNÍ SVĚTDIPLOIDNÍ SVĚT řasy houby mechy kapradiny kvetoucí rostliny HAPLOIDNÍ SVĚT krytosemenné rostliny dvojděložné Střídání generací u krytosemen- ných rostlin ZYGOTA embryo (uvnitř semene a plodu) rostlina (stonek, kořen, listy) květ samčí tyčinky samičí pestíky MEIOSA mega- mikro- sporogeneze haploidní spory spermie SPOROFYT ( 2n ) maternální integumenty DVOJÍ OPLOZENÍ SAMIČÍ GAMETOFYT SAMČÍ GAMETOFYT buňka vaječná ( zygota) centrální jádro ( endosperm) GAMETOFYT ( n ) Rostliny mají segmentované tělo: FYTOMERY kořenový meristem primární kořen boční PRÝT KOŘEN základní pletivo cévní svazky semena, plody uzlina internodium uzlina úžlabní pupen epidermis květ apikální meristem list Pyl a semena – klidová a dispersní stádia života rostlin modulace chromatinu: histon-Ac a cytosin-metyl (pohádka o Šípkové Růžence) Hlavní skupiny rostlinných hormonů pleiotropní účinky, tvořeny v jednom pletivu a transportovány do jiného nízká koncentrace, velké účinky - 6 mg auxinu / 1 kg ananasu - jehla na 20 metrů krychlových sena Růstové faktory rostlin či fytohormony funkce jako stimulátor - pozitivní či negativní účinek stejné hormony mohou vyvolávat odlišné reakce – rozdíly v citlivosti Řízená organogeneze ve tkáňové kultuře tabáku explantát živný agar žádný růst kalus kořeny prýty auxin 0 vysoká vysoká nízká cytokinin 0 vysoká nízká vysokáFolke Skoog (1908-2001) ROSTLINNÉ BUŇKY JSOU TOTIPOTENTNÍ Reprodukce bez sexu - klonování vegetativní množení in vitro provázeno somaklonální variabilitou Schopnost haploidie a dihaploidie vylučuje parentální imprinting ve sporofytu Apikální dominance řízená auxinem auxin tvořený v apikálu se šíří stonkem dolů, inhibujíce vývin úžlabních pupenů koncentrace auxinu klesá směrem dolů, kde axilární pupeny se uvolňují z inhibice a vytvářejí laterální prýty apikální meristém dekapitace inhibice vývin vývin Agrobacterium Ti-plazmid bakterie rostlinná buňka T-DNA bakt. chr. crown-gall či hairy-roots KONJUGACE MEZI BAKTÉRIÍ A ROSTLINOU ? rostl. chr. T-DNA T-DNA Koevoluce agrobakterií a rostlin : genetická kolonizace vs. inženýrství Mary-Dell Chilton (1977) fenolické látky z poraněné rostliny Růstové regulátory rostlin s pleiotropními účinky: cytokininy – hormony dělení buněk a mladosti Ric Amasino (Wisconsin 1995) promotor SAG isopentenyl transferáza senescence cytokininy Podivný model – „Ice Plant“ Mesembryanthemum crystallinum ( kosmatec krystalový, 2děložné, ř. Caryophyllales ) - studium abiotického stresu, odolnosti vůči soli, fotosyntézy - v různých fázích života a za odlišných vnějších okolností mění morfotyp i fyziologii - model flexibility - C = 0,39 pg DNA, n = 9 chrs semenáček, fotosyntéza C3, sukulentní kotyledony, nízká tolerance k NaCl, jádra 2C juvenilní, fotosyntéza C3, vyšší tolerance k NaCl, velké primární listy, jádra 2C-16C dospělá, přechod fotosyntézy z C3 na CAM, vysoká tolerance k NaCl, měchýřkové buňky, velké primární listy, jádra 2C-32C kvetoucí, fotosyntéza CAM, měchýřkové buňky, vysoká tolerance k NaCl, malé sekundární listy, jádra 2C-64C semena-plodící, fotosyntéza CAM, jen měchýřkové buňky, vysoká tolerance k NaCl, žádné listy, jádra 2C-256C epidermální měchýřkové buňky (epidermal bladder cells) jádra 256C dospělá rostlina po 2týdenním solném stresu, dosud velké primární listy John Cushman, Nevada dospělá rostlina po 5týdenním solném stresu, tvoří úzké sekundární listy Craterostigma plantagineum (Scrophulariaceae, dvojděložné) - studium tolerance k desikaci (znovuvzkřížení) květ gametogeneze a oplození K C A G pylové zrno pylová láčka vajíčko embryo embryogeneze semeno klíčení semenáček hypokotyl kořen lístky děložní růst a zrání týdny Arabidopsis thaliana Vývoj zygoty a časná embryogeneze krytosemenných rostlin … zygota bazální buňka terminální buňka základ embrya suspenzor časné embryo suspenzor globulární stádium stádium stádium srdce torpéda hypofýza děložní kořenový prýtový lístky meristém meristém … embryogeneze Uspořádání rostlinného embrya radiální symetrie vznik osy a bilaterální symetrie globulární stádium stádium srdce protoderm základní meristém prokambium osa prýt - kořen kotyledon prýtový meristém prokambium kořenový meristém Signální systémy v časné embryogenezi rostlin signály z (vlastního) embrya potlačují embryonální vývoj v buňkách suspenzoru signály ze suspenzoru podporují embryonální vývoj oktant globular srdce torpédo semenáček prýtový meristém kotyledony kořenový meristém hypokotyl kořen „ Osudové mapování “ embrya: již od globulárního stádia je možné rozlišit tři hlavní oblasti podél A – B osy 1 2 3 mutace ovlivňující tvorbu základní osy embrya Geny embryonálního vývoje rostlin : mutace způsobují deleční vývojové typy podél apikálně-bazální osy embrya (analogie s geny velkých mezer u drozofily ?) Apikální meristém (M) a základy listů (L) Arabidopsis : meristém má trojvrstevnou strukturu, vrstva L1 a L2 (tunica) mají rovinu dělení antiklinální, corpus L3 má roviny různé listové primordium tunica corpus kolmé ekvatoriální roviny dělení buněk pláště L1 a L2 Charakter (kmenových) buněk prýtového meristému je určován antagonistickými účinky genů : - Shootmeristemless a Wuchsel potlačují diferenciaci a zajišťují proliferaci meristému - Clavata3 naopak stimuluje diferenciaci WT mutace STM kmenové buňky centrálního meristému list list diferenciace diferenciace (Kathy Barton, Stanford) Rostlinné meristémy jsou schopny regulace odstranění špičky meristému vede k regeneraci původního meristému listové primordium nový meristém odstranění celého meristému vede ke tvorbě nového meristému na novém místě Regenerace u rostlin je POLARIZOVANÁ : izolované části stonku regenerují vždy - kořeny z bazální části řezu a - stonek z nejbližšího pupene k apikální části vrstva meristemu L 2 ( i ) květen- ství 1 2 34 5 6 7 8 „Osudová mapa“ embryonálního prýtového meristému Arabidopsis - vývoj meristému je závislý na signálech z rostliny - rostliny se vyznačují výrazným regulativním typem vývoje gene FWA = suppressor of flowering Gen LEAFY řídí tranzici vegetativního růstu v kvetení Detlef Weigel (La Jolla 1995) Genetické řízení procesů vývinu květů vegetativní meristém krok 1 květní geny př. Embryonic flower meristém květenství krok 2 geny meristémové identity př. Leafy květní meristém krok 3 katastrální geny př. Superman tvorba květních orgánových primordií krok 4 homeotické geny př. Apetala 3 determinace květních orgánových primordií KVĚT: komplex reprodukčních orgánů krytosemenných rostlin pylová zrna blizna (G) – W4 prašník (A) – W3 nitka koruna (C) – W2 čnělka pylová láčka semeník vajíčka kalich (K) – W1 květní lůžko stopka 1 2 3 4 pestík tyčinka koruna kalich 1 2 3 4 Johann Wolfgang von Goethe (1747-1832) The Metamorphosis of Plants (1790) … From first to last, the plant is nothing but leaf … ( … rostlina je složena pouze z listů, které se vyskytují v různých tvarech … ) MADS-boxové geny : alternativní regulátory segmentace a vývoje M … MCM1 gen kvasinky A … agamous květní gen Arabidopsis D … deficiens květní gen Antirrhinum S … serum response faktor člověka N … amino-terminální oblast (extenze) MADS - box … konzervativní 5’-oblast I … slabě konzervativní vmezeřená oblast K … kóduje proteinovou doménu podobnou cívkové struktuře keratinu C … karboxy-terminální oblast (aktivátor) Model ABC (1990) květního vývoje … už neplatí, KVARTETOVÝ model (2000) :wild-typ kalich koruna prašník pestík mutant skupiny B kalich kalich pestík pestík mutant skupiny A pestík prašník prašník pestík mutant skupiny C kalich koruna koruna kalich objev dalších MADS-boxových genů třídy D ( OVULA ) a E ( SEPALLATA ) … nezbytné ke tvorbě kruhů 2-4 kalich koruna prašník pestík Homeotické geny s MADS-boxem řídí specifitu květních orgánů: model ABC u Arabidopsis thaliana  tři skupiny transkripčních faktorů ABC určují specifitu čtyř květních kruhů K (kalichu), C (koruny), A (tyčinek) a G (pestíku) WT mutace A: apetala 2 mutace B: pistillata mutace C: agamous KCAG (bisexuální) GAAG (hypersexuální) KKGG (samičí) KCCK (asexuální) Domény účinku homeotických genů ABC studované s pomocí GUS Rostliny mají homeotické geny dvojího typu - MADS-boxové … řídí identitu květních kruhů - homeoboxové … určují architekturu vegetativních částí složený list složený list vyššího řádu transgenní rajče wild-typu u transgenního rajčete bushy rajčete s chimérickým genem knotted1 fenotyp ( Petroselinum ) Samčí a samičí sporogeneze, gametogeneze a dvojí oplození u Arabidopsis MIKROSPOROGENEZE A MIKROGAMETOGENEZE - gametofyt je haploidní, vyžaduje specifickou genovou expresi - představuje střídání životních cyklů, rodozměnu - model buněčné biologie, asymetrická první pylová mitóza - generativní buňka je uvnitř buňky vegetativní (Bacillus subtilis!) - řízený růst a zánik buňky vegetativní (pylová láčka) - vznik dvou funkčních „souřadných“ spermií (?) mutant: kvartet zralé pylové zrno mutant: symetrická pylová mitóza mutant : sidecar V S Dvojí oplození u krytosemenných rostlin : Sergej Gavrilovič Navašin 1898 1p : 2m 1p : 1m Maternální či paternální exces vedou k narušení exprese imprintovaných genů v endospermu Rod Scott (Bath 1998) Robert Fisher (Berkeley 1998) Leafy cotyledon : klíčový regulátor embryogeneze * odpovídá za maturaci embrya ( = hlídá spánek Šípkové Růženky ! ) * CCAAT vazebný faktor wild – type in vitro záchrana mutace lec1 (leafy cotyledon) ektopická konstitutivní exprese vede k permanentním projevům embryonálního růstu Úlohy komplexů POLYCOMB v životním cyklu rostlin Proteiny skupiny POLYCOMB - jsou antagonisty (represory) homeotických genů s homeoboxem či MADS doménou - specifikují místo účinku homeotických transkripčních faktorů Arabidopsis CURLY LEAF versus AGAMOUS Justin Goodrich (Edinburgh) listy wild-typu listy mutace clf : ektopická exprese květního genu AG DŮKAZ TEORIE PARENTÁLNÍHO KONFLIKTU U ROSTLIN Řecká tragédie MEDEA (431 př. Kr.) … Medea zabíjí své děti za Iásonovu zradu … Euripides (480–406 př. Kr.) Parentální imprinting u rostlin : maternální efekt genu MEDEA maternální wt-alela: kontrola (redukce) embryonální proliferace Ueli Grossniklaus (Zurich 1998) wt mutace medea MM / mm / ... pohádka o Otesánkovi, aneb infanticida Fenotyp mutace medea • embryo odvozené z vajíčka medea nadměrně roste a umírá v průběhu desikace semene • letalita embrya je nezávislá na paternálním příspěvku a dávce genu • embryo vykazuje zvýšenou buněčnou proliferaci na úkor endospermu DEMETER řídí maternální expresi genu MEDEA Steve Jacobsen (UCLA 2002) DME / DME dme / DME dme / dme abort viabilní GUS GFP exprese DME v centrální buňce samičího gametofytu (DNA glykosyláza?) Imprintované geny u rostlin Gen druh exprese mechanismus funkce MEDEA Arabidopsis maternální Polycomb remodelování chromatinu PHERES1 Arabidopsis paternální Polycomb transkripční faktor FWA Arabidopsis maternální DNA-metyltransferáza transkripční faktor FIS2 Arabidopsis maternální DNA-metyltransferáza remodelování chromatinu FIE Arabidopsis maternální ? remodelování chromatinu AGL80 Arabidopsis maternální ? transkripční faktor AtFH5 Arabidopsis maternální ? regulace aktinu FIE1 kukuřice maternální DNA-metyltransferáza remodelování chromatinu FIE2 kukuřice maternální DNA-metyltransferáza remodelování chromatinu R kukuřice maternální ? syntéza pigmentu … Oidipovský komplex APOMIXE klonování rostlin semeny z neoplozených vajíček tvorba hybridů F1 (bez oplození) (bez oplození) (s oplozením) APOMIXE