C2110 Operační systém UNIX a základy programování 4. lekce / modul 1 -1C2110
Operační systém UNIX a
základy programování
Petr Kulhánek
kulhanek@chemi.muni.cz
Národní centrum pro výzkum biomolekul, Přírodovědecká fakulta
Masarykova univerzita, Kamenice 5, CZ-62500 Brno
PS/2020 Distanční forma výuky: Rev1
4. lekce / modul 1
C2110 Operační systém UNIX a základy programování 4. lekce / modul 1 -2Desktopové
prostředí
➢ GNOME
➢ standardní aplikace
➢ příkazová řádka
➢ vědecko-technické aplikace
C2110 Operační systém UNIX a základy programování 4. lekce / modul 1 -3GNOME
- Standardní aplikace
Vyhledávání
Hlavní menu
Firefox firefox webový prohlížeč
LibreOffice libreoffice textový editor (Writer), tabulkový kalkulátor (Calc)
prezentace (Impress)
Gimp gimp editor rastrové grafiky
Inkscape inkscape editor vektorové grafiky
Okular okular prohlížeč PDF dokumentů
jméno příkazu, který spouští aplikaci, v příkazové řádce
C2110 Operační systém UNIX a základy programování 4. lekce / modul 1 -4Přizpůsobení
rychlého přístupu
C2110 Operační systém UNIX a základy programování 4. lekce / modul 1 -5Cvičení
1
1. Vytvořte si vzdálené VNC sezení na klastr WOLF (viz samostatná prezentace).
VNC server spouštějte s volbou --fullgui.
2. Spusťte program Gimp pomocí menu prostředí GNOME. V programu
nakreslete domeček jedním tahem. Vzniklé trojúhelníky vyplňte různými
barvami.
3. Spusťte program Inkscape. V programu nakreslete vlajku české republiky.
Zkuste odhadnout principiální rozdíl mezi programy Inkscape a Gimp.
4. Spusťte program LibreOffice. V tabulkovém kalkulátoru zobrazte průběh
funkce sinus v rozsahu 0 až 360˚.
C2110 Operační systém UNIX a základy programování 4. lekce / modul 1 -6-
Terminály
Příkazová řádka je přístupná přímo z textových terminálů. V grafickém prostředí X11 je
nutné spustit vhodnou aplikaci emulující textový terminál:
➢ gnome-terminal (Terminal)
➢ konsole (Konsole)
➢ xterm (XTerm)
xterm
konsole
jednoduché, standard na
všech UNIXových
systémech
Výchozím adresářem je: /home/username
jednoduché, přitom značně konfigurovatelné
gnome-terminal
C2110 Operační systém UNIX a základy programování 4. lekce / modul 1 -7Příkazová
řádka
[kulhanek@wolf ~]$
jméno uživatele
jméno počítače
aktuální adresář (~ znamená domovský adresář /home/username)
Prompt - typ uživatele / výzvy ($ běžný uživatel, # super uživatel, další možné %, >)
místo pro příkaz
Příkaz se vykoná zmáčknutím klávesy Enter.
Kopírování textu: Ne pomocí Ctrl+C! Pro kopírování textu z terminálu stačí text označit, pro
následné vložení stiskněte kolečko (prostřední tlačítko) myši.
Automatické doplňování: zmáčknutím klávesy Tab (tabulátor) se interpret příkazové řádky
snaží dokončit rozepsané slovo. Doplňují se jména příkazů, cesty a jména souborů (pokud
jeden stisk nic nevyvolá, existuje více možností doplnění, opakovaný stisk je zobrazí).
Historie: pomocí kurzorových šipek nahoru a dolů lze procházet seznamem již zadaných
příkazů. Příkaz z historie lze znovu použít nebo upravit a upravený použít. Historie je
přístupná i příkazem history.
C2110 Operační systém UNIX a základy programování 4. lekce / modul 1 -8Správce
souborů
!!!! nepoužívat !!!!
Těžko na cvičišti – lehko na bojišti.
Během cvičení, pokud není řečeno jinak,
používejte výhradně příkazovou řádku.
V superpočítačových centrech nejsou většinou grafické rozhranní dostupná.
OK
Správci souborů:
GNOME: nautilus
KDE: dolphin
C2110 Operační systém UNIX a základy programování 4. lekce / modul 1 -9Vědecko-technické
aplikace
Přehled dostupných aplikací:
$ module
$ module versions vmd
Přehled dostupných verzí modulu:
Aktivace modulu:
$ module add vmd
Spuštění aplikace z modulu vmd
$ vmd
Vědeckotechnické aplikace, které jsou instalovány v několika verzích (verze aplikace, typ
kompilace, paralelní verze), jsou dostupné ve formě modulů. Před použitím aplikace je
nutné příslušný modul aktivovat.
$ module add vmd:1.9.0
číslo verze se od jména
modulu odděluje dvojtečkou
aktivuje výchozí verzi modulu
zadává se do příkazové řádky, text se píše bez znaku $
jméno modulu a aplikace nemusí být stejné
$ module help vmd
Dokumentace k modulu:
C2110 Operační systém UNIX a základy programování 4. lekce / modul 1 -10Cvičení
2
1. Otevřete terminál v grafickém rozhraní GNOME na klastru WOLF. Vyzkoušejte si gnometerminal
(Terminal), konsole (Konsole), xterm (Xterm). Pro další práci si jeden vyberte.
2. Z terminálu spusťte program Inkscape. Do příkazové řádky napište „inkscape“ a
zmáčkněte Enter.
3. Co se stane pokud napíšete „Inkscape“?
4. Zobrazte všechny dostupné moduly.
5. K čemu slouží modul vmd?
6. V programu vmd otevřete soubor struktura.pdb (L2.M4.C2.U1).
7. K čemu slouží modul nemesis?
8. Aktivujte modul „nemesis“ a spusťte program nemesis.
9. V programu namodelujte molekulu kyseliny octové a proveďte optimalizaci její
geometrie.
C2110 Operační systém UNIX a základy programování 4. lekce / modul 1 -11Cvičení
3
1. Otevřete novy terminál v grafickém rozhraní GNOME na klastru WOLF.
1. Vypište obsah proměnné PATH (echo $PATH).
2. Adresáře proměnné PATH vypište na jednotlivé řádky.
3. Je v terminálu dostupná aplikace nemesis (type, which)?
4. Přidejte modul nemesis.
5. Vypište obsah proměnné PATH.
6. V kterém adresáři se nachází aplikace nemesis?