Praktikum z molekulární biologie p roka ryot - BÍ7311
úterý: 13:00 - 16:50; čtvrtek: 09:00 - 09:50      místnost: E25-119
I. skupina_
Datum	č.		Úloha
	3.2021		Bezpečnost práce a rozdělení studentů do skupin, informace k cvičení pro všechny zaregistrované
	05.10.2021 07.10.2021	1	1. Úloha: Izolace spontánních mutant metodou gradientních ploten 1. Úloha: Izolace spontánních mutant metodou gradientních ploten - pokračování, II.Úloha: HGT: GTA - příprava a teorie
	12.10.2021 14.10.2021	2	I. Úloha: Izolace spontánních mutant metodou gradientních ploten - přečárkování sp. mutant; II.Úloha: HGT - transdukce phiJB, GTA - přenos do recipienta II. Úloha: HGT - transdukce phiJB, GTA - vyhodnocení, 1. Úloha: Izolace spontánních mutant metodou gradientních ploten - vyhodnocení
	19.10.2021 21.10.2021	3	III. Úloha: Konjugace; IV. Úloha: PFGE - příprava bločků z transduktant a polylysogenních lab. kmenů III. Úloha: Konjugace vyhodnocení frekvence; IV. Úloha: PFGE - instrukce k vlastnímu přístroji
	26.10.2021 02.11.2021	4	IV. Úloha: PFGE - štěpení bločků; V. Úloha: Konformace plazmidové DNA (pDNA bude k dispozici, dělají ELFO), PCR na geny rezistence na plazmidech; VI. Úloha: Sestřih fágového endolyzinu: Izolace RNA Trizolem IV. Úloha:PFGE - nanášení na gel
	02.11.2021 04.11.2021	5	VI. Úloha: Sestřih fágového endolyzinu - přepis RNA do cDNA, PCR VI. Úloha: Sestřih fágového endolyzinu - ELFO; V. Úloha: PCR na geny rezistence - ELFO
	09.11.2021 11.11.2021	6	VII. Úloha: Stanovení počtu plazmidů pomocí qPCR v donorových a recipientních kmenech z úlohy č. II VII. Úloha: Stanovení počtu plazmidů pomocí qPCR v donorových a recipientních kmenech - vyhodnocení; kontrola vyplněných pracovních listů
II. skupina			
Datum	č.		Úloha
	09.11.2021 11.11.2021	1	1. Úloha: Izolace spontánních mutant metodou gradientních ploten 1. Úloha: Izolace spontánních mutant metodou gradientních ploten - pokračování, II.Úloha: HGT: GTA - příprava a teorie
	16.11.2021 18.11.2021	2	I. Úloha: Izolace spontánních mutant metodou gradientních ploten - přečárkování sp. mutant; II.Úloha: HGT - transdukce phiJB, GTA - přenos do recipienta II. Úloha: HGT - transdukce phiJB, GTA - vyhodnocení, 1. Úloha: Izolace spontánních mutant metodou gradientních ploten - vyhodnocení
	23.11.2021 25.11.2021	3	III. Úloha: Konjugace; IV. Úloha: PFGE - příprava bločků z transduktant a polylysogenních lab. kmenů III. Úloha: Konjugace vyhodnocení frekvence; IV. Úloha: PFGE - instrukce k vlastnímu přístroji
	30.11.2021 02.12.2021	4	IV. Úloha: PFGE - štěpení bločků; V. Úloha: Konformace plazmidové DNA (pDNA bude k dispozici, dělají ELFO), PCR na geny rezistence na plazmidech; VI. Úloha: Sestřih fágového endolyzinu: Izolace RNA Trizolem IV. Úloha:PFGE - nanášení na gel
	07.12.2021 09.12.2021	5	VI. Úloha: Sestřih fágového endolyzinu - přepis RNA do cDNA, PCR VI. Úloha: Sestřih fágového endolyzinu - ELFO; V. Úloha: PCR na geny rezistence - ELFO
	14.12.2021 16.12.2021	6	VII. Úloha: Stanovení počtu plazmidů pomocí qPCR v donorových a recipientních kmenech z úlohy č. II VII. Úloha: Stanovení počtu plazmidů pomocí qPCR v donorových a recipientních kmenech - vyhodnocení; kontrola vyplněných pracovních listů
04.11.2021 16.12.2021			Závěrečný test na zápočet - skupina 1. Závěrečný test na zápočet - skupina 2.
Seznám úloh plánovaných na podzim 2021:
1. Izolace spontánních mutant metodou gradientních ploten
2. HGT - transdukce phiJB, GTA
3. Konjugace
4. PFGE
5. Konformace plazmidové DNA
6. Sestřih fágového endolyzinu (metoda izolace RNA Trizolem, přepis do cDNA, PCR)
7. Stanovení počtu plazmidů pomocí qPCR