0.34 0.36 0.38 0.40 0.42 0.44 0.46 0.48 −0.4−0.20.00.20.4 Sample to Sample PCA (normalized) Comp.1 Comp.2 control1 control2 KD1_1 KD1_2 KD2_1 KD2_2 0.34 0.38 0.42 0.46 −0.4−0.20.00.20.4 Sample to Sample PCA (normalized) PC1 PC2 control1 control2 KD1_1 KD1_2 KD2_1 KD2_2 0.34 0.38 0.42 0.46 −0.6−0.4−0.20.00.20.4 Sample to Sample PCA (normalized) PC1 PC3 control1control2 KD1_1 KD1_2 KD2_1 KD2_2 −0.4 0.0 0.2 0.4 −0.6−0.4−0.20.00.20.4 Sample to Sample PCA (normalize PC2 PC3 control1control2 KD1_1 KD1_2 KD2_1 KD2_2