IV108 Bioinformatika II
Mgr. Matěj Čuhel
IV108 Bioinformatika II
Mgr. Matěj Čuhel
IV108 Bioinformatika II
Info
Course
Term
Autumn 2006
Prednášející: Dr. Matej Lexa, FI C505.
Konzultační hodiny: Čt 13:00 - 15:00, nebo dle domluvy
Rozvrh: (podzim 2006) Ut 12:00-12:50 B204, Ut 13:00-13:50 B116

Kurz vyžaduje základní znalosti z bioinformatiky, elementární znalosti programování v libovolném jazyce (nejlépe C/Perl nebo C++/Python) a uživatelskou znalost OS UNIX.

Jedná se o předmět v oblasti aplikované informatiky, který si klade za cíl umožnit studentům pochopit a navrhovat vybrané algoritmy pro práci s biologickými sekvencemi a strukturami.

UČEBNICE: Michael S. Waterman (1995). Introduction to computational biology.
Maps, sequences and genomes. Chapman & Hall/CRC, Boca Raton, 431 s. (prezenčně knihovna FI)
Rozsah pro kurz:
29-48 Restriction Maps
183-209 Alignment of 2 sequences by DP
327-343 RNA Secondary Structure

PROJEKT: Program pro hodnocení sekvenčních vzorů. Termín odevzdání 4.12.2006

Určené pasáže ucebnice, prezentace z přednášek (PDF a PPT), obsah cvičení
(kromě dobrovolných příkladů na body) a materiály označené hvězdičkou jsou
povinnými materiály ke zkoušce.
Zadani projektu
Novinky
Open
Chapter contains:
3
Web
2. týden 25/9/2006
Open
Chapter contains:
5
Web
Teacher recommends to study from 26/9/2006 to 2/10/2006.
3. týden 2/10/2006
Open
Chapter contains:
1
Study text
Teacher recommends to study from 3/10/2006 to 9/10/2006.
4. týden 9/10/2006
Open
Chapter contains:
5
Web
Teacher recommends to study from 10/10/2006 to 16/10/2006.
5. týden 16/10/2006
Open
Chapter contains:
7
Web
Teacher recommends to study from 17/10/2006 to 23/10/2006.
6. týden 23/10/2006
Open
Chapter contains:
8
Web
Teacher recommends to study from 24/10/2006 to 30/10/2006.
7. týden 30/10/2006
Open
Chapter contains:
6
Web
Teacher recommends to study from 31/10/2006 to 6/11/2006.
8. týden 6/11/2006
Open
Chapter contains:
5
Web
Teacher recommends to study from 7/11/2006 to 13/11/2006.
9. týden 13/11/2006
Open
Chapter contains:
11
Web
Teacher recommends to study from 14/11/2006 to 20/11/2006.
10. týden 20/11/2006
Open
Chapter contains:
8
Web
Teacher recommends to study from 21/11/2006 to 27/11/2006.
11. týden 28/11/2006
Open
Chapter contains:
7
Web
Teacher recommends to study from 28/11/2006 to 4/12/2006.
12. týden 5/12/2006
Open
Chapter contains:
8
Web
Teacher recommends to study from 5/12/2006 to 11/12/2006.
13. týden 12/12/2006
Open
Chapter contains:
1
Study text
Teacher recommends to study from 12/12/2006 to 18/12/2006.
14. týden 19/12/2006
Open
Chapter contains:
1
Study text
Teacher recommends to study from 19/12/2006 to 25/12/2006.
Previous
Next