Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii
doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii
doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii
Info
Course
Term
Spring 2023

Předmět PB051 se přestavbou studia na FI rokem 2021 mění. Stává se na bakalářské úrovni praktickým doplněním k předmětu IV107 Bioinformatika I (1. polovina semestru) a PA052 Úvod do systémové biologie (2. polovina semestru).

Pokročilejší problémy řešené v bioinformatické části v minulých letech (např. profilové HMM) přechází do nového předmětu PV269, kde se rovněž probírá pokročilá práce s NGS daty, anotacemi genomů a proteinovými strukturami.

Týden 1 - Úvod - 13/2/2023
Open
Chapter contains:
4
PDF
1
Study text
Teacher recommends to study from 13/2/2023 to 19/2/2023.
Týden 2 - Sběr a příprava sekvencí ZNF, hledání u rostlin, zjišťování konsenzuální sekvence - 20/2/2023
Open
Chapter contains:
1
PDF
1
Study text
1
Web
Teacher recommends to study from 20/2/2023 to 26/2/2023.
Týden 3 - mapování výskytu v genomech, anotace - 27/2/2023
Open
Chapter contains:
1
Study text
Teacher recommends to study from 6/3/2023 to 12/3/2023.
Týden 4 - mapování anotace na strukturu proteinu - 6/3/2023
Open
Chapter contains:
1
Study text
1
Web
Teacher recommends to study from 13/3/2023 to 19/3/2023.
Týden 5 - diskuse zadání hodnoceného úkolu, konec 1.části - 13/3/2023
Open
Chapter contains:
2
PDF
1
Study text
2
Web
Teacher recommends to study from 20/3/2023 to 26/3/2023.
Týden 6 - řešení projektu 20/3/2023
Open
Chapter contains:
1
Study text
1
Web
Teacher recommends to study from 27/2/2023 to 5/3/2023.
Týden 7 - Biologické sítě a genová ontologie
Open
Chapter contains:
1
PDF
1
Video
1
Study text
7
Web
Teacher recommends to study from 20/3/2023 to 26/3/2023.
Týden 8 - Integrace dat prostřednictvím biologických sítí
Open
Chapter contains:
1
Other files
1
Study Materials
1
Study text
5
Web
Teacher recommends to study from 27/3/2023 to 2/4/2023.
Týden 9 - Analýza genové exprese a integrace dat
Open
Chapter contains:
1
PDF
1
Study Materials
1
Study text
4
Web
Teacher recommends to study from 17/4/2023 to 24/4/2023.
Týden 10 - Modelování regulace genové exprese
Open
Chapter contains:
1
Image
1
PDF
1
Study text
2
Web
Teacher recommends to study from 17/4/2023 to 1/5/2023.
Týden 11 - Booleovské sítě - metody analýzy
Open
Chapter contains:
1
PDF
1
Study text
2
Web
Teacher recommends to study from 24/4/2023 to 12/5/2023.
Týden 12 - Booleovské sítě s částečnou informací, motivy v sítích
Open
Chapter contains:
1
Homework Vault
1
PDF
1
Study Materials
1
Study text
4
Web
Teacher recommends to study from 9/5/2023 to 15/5/2023.
Previous
Next