Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii
doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii
doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii
Info
Předmět
Období
jaro 2025

Předmět PB051 se přestavbou studia na FI rokem 2021 mění. Stává se na bakalářské úrovni praktickým doplněním k předmětu IV107 Bioinformatika I (1. polovina semestru) a PA052 Úvod do systémové biologie (2. polovina semestru).

Pokročilejší problémy řešené v bioinformatické části v minulých letech (např. profilové HMM) přechází do nového předmětu PV269, kde se rovněž probírá pokročilá práce s NGS daty a anotacemi genomů.

Týden 1 - Úvod, sběr HOX sekvencí - 17. 2. 2025
Kapitola obsahuje:
2
PDF
1
Studijní text
Učitel doporučuje studovat od 17. 2. 2025 do 23. 2. 2025.
Týden 2 - Konstrukce dendrogramů a fylogenetických stromů - 24. 2. 2025
Kapitola obsahuje:
1
Studijní text
Učitel doporučuje studovat od 24. 2. 2025 do 2. 3. 2025.
Týden 3 - Vizualizace v kontextu genomu - 3. 3. 2025
Kapitola obsahuje:
1
Studijní text
Učitel doporučuje studovat od 3. 3. 2025 do 9. 3. 2025.
Týden 4 - Návrh PCR primerů - 10. 3. 2025
Kapitola obsahuje:
1
Studijní text
Učitel doporučuje studovat od 10. 3. 2025 do 16. 3. 2025.
Týden 5 - Mapování variace na strukturu proteinu - 17. 3. 2025
Kapitola obsahuje:
1
Studijní text
2
Web
Učitel doporučuje studovat od 17. 3. 2025 do 23. 3. 2025.
Týden 6 - Diskuse zadání hodnoceného úkolu a projektu, konec 1.části - 24. 3. 2025
Kapitola obsahuje:
1
Studijní text
4
Web
Učitel doporučuje studovat od 24. 3. 2025 do 30. 3. 2025.
Týden 7 - Biologické sítě a genová ontologie
Kapitola obsahuje:
1
PDF
1
Studijní text
7
Web
Učitel doporučuje studovat od 24. 3. 2025 do 30. 3. 2025.
Týden 8 - Integrace dat prostřednictvím biologických sítí
Kapitola obsahuje:
1
Další soubory
1
Studijní materiály
1
Studijní text
4
Web
Učitel doporučuje studovat od 7. 4. 2025 do 13. 4. 2025.
Týden 9 - Analýza genové exprese a integrace dat
Kapitola obsahuje:
1
PDF
1
Studijní materiály
1
Studijní text
9
Web
Učitel doporučuje studovat od 15. 4. 2025 do 22. 4. 2025.
Týden 10 - Modelování regulace genové exprese
Kapitola obsahuje:
1
Obrázek
1
PDF
1
Studijní text
4
Web
Učitel doporučuje studovat od 28. 4. 2025 do 19. 5. 2025.
Týden 11 - Booleovské sítě - metody analýzy
Kapitola obsahuje:
1
PDF
1
Studijní text
2
Web
Učitel doporučuje studovat od 28. 4. 2025 do 16. 5. 2025.
Týden 12 - Booleovské sítě s částečnou informací, motivy v sítích
Kapitola obsahuje:
1
Odevzdávárna
1
PDF
1
Studijní materiály
1
Studijní text
4
Web
Učitel doporučuje studovat od 13. 5. 2025 do 19. 5. 2025.
Předchozí
Následující