Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii
doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii
doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii
Info
Course
Term
Spring 2022

Předmět PB051 se přestavbou studia na FI rokem 2021 mění. Stává se na bakalářské úrovni praktickým doplněním k předmětu IV107 Bioinformatika I (1. polovina semestru) a PA052 Úvod do systémové biologie (2. polovina semestru).

Pokročilejší problémy řešené v bioinformatické části v minulých letech (např. profilové HMM) přechází do nového předmětu PV269, kde se rovněž probírá pokročilá práce s NGS daty, anotacemi genomů a proteinovými strukturami.

Týden 1 - Úvod - 15/2/2022
Open
Chapter contains:
2
PDF
1
Study text
Teacher recommends to study from 14/2/2022 to 20/2/2022.
Týden 2 - Sběr a příprava sekvencí ZNF - 22/2/2022
Open
Chapter contains:
1
PDF
1
Study text
1
Web
Teacher recommends to study from 21/2/2022 to 27/2/2022.
Týden 3 - hledání u rostlin, zjišťování konsenzuální sekvence - 1/3/2022
Open
Chapter contains:
1
Study text
1
Web
Teacher recommends to study from 28/2/2022 to 6/3/2022.
Týden 4 - mapování výskytu v genomech, anotace - 8/3/2022
Open
Chapter contains:
1
Study text
Teacher recommends to study from 7/3/2022 to 13/3/2022.
Týden 5 - mapování anotace na strukturu proteinu - 15/3/2022
Open
Chapter contains:
1
Study text
Teacher recommends to study from 14/3/2022 to 20/3/2022.
Týden 6 - diskuse zadání hodnoceného úkolu, konec 1.části - 22/3/2022
Open
Chapter contains:
2
PDF
1
Study text
2
Web
Teacher recommends to study from 21/3/2022 to 27/3/2022.
Týden 7 - Biologické sítě a genová ontologie
Open
Chapter contains:
1
PDF
1
Study text
7
Web
Teacher recommends to study from 28/3/2022 to 3/4/2022.
Týden 8 - Integrace dat prostřednictvím biologických sítí
Open
Chapter contains:
2
Study Materials
1
Study text
5
Web
Teacher recommends to study from 11/4/2022 to 18/4/2022.
Týden 9 - Analýza genové exprese a integrace dat
Open
Chapter contains:
1
PDF
1
Study Materials
1
Video
1
Study text
2
Web
Teacher recommends to study from 18/4/2022 to 25/4/2022.
Týden 10 - Booleovské sítě - základní principy
Open
Chapter contains:
1
Image
1
PDF
1
Study text
2
Web
Teacher recommends to study from 25/4/2022 to 9/5/2022.
Týden 11 - Booleovské sítě - metody analýzy
Open
Chapter contains:
1
PDF
1
Study text
2
Web
Teacher recommends to study from 25/4/2022 to 13/5/2022.
Týden 12 - Booleovské sítě s částečnou informací, motivy v sítích
Open
Chapter contains:
1
PDF
1
Study Materials
1
Study text
4
Web
Teacher recommends to study from 10/5/2022 to 16/5/2022.
Previous
Next