Často obsahuje izomorfní příměs Fe, Mg, Mn, Na a zejména Ce. Šesterečný (hexagonální). V krystalové struktuře jsou někdy ionty F a Cl částečně nahrazeny hydroxylovými skupinami nebo karbonátovými či sulfátovými aniony - podle toho se rozlišuje fluor-apatit, chlor-apatit, karbonát-apatit a další. Ve vrcholech základní buňky jsou ionty F- umístěné na šestinásobně spirálovitých osách ve středech šestiúhelníků. Ionty vápníku vytvářejí nepřerušené řetězce, kde každý iont Ca je spojen s devíti ionty kyslíku. Krystaly bývají tlustě tabulkovité, krátce až dlouze sloupcovité nebo jehličkovité. Agregáty zrnité, vláknité, stébelnaté, celistvé nebo zemité.
Může být bezbarvý, bílý, světle nazelenalý až tmavě zelený, namodralý, nažloutlý, světle fialový i jinak zbarvený. Vryp bílý. Lesk skelný, mastný až matný. Někdy nezřetelná štěpnost, lom nerovný. Lehce rozpustný v HCl, nesnadno tavitelný, elektricky nevodivý. Při malém zahřátí ve tmě některé apatity světélkují.
Mikroskopická, dosti pravidelná součást magmatických a metamorfovaných hornin. Krystalizovaný se nachází v pegmatitech (Písek, Dolní Bory, Rožná a Bobrůvka u Velkého Meziříčí) a greisenech (Cínovec, Krásno u Horního Slavkova). Hojně je u nás rozšířen v diabasech, čedičích a rulách u Kutné Hory a Čáslavi.
Významná ložiska fosfátů typu apatitu jsou v severní Africe (Maroko, Alžírsko, Tunisko, Egypt), západní části USA, Kazachstánu a gigantická ložiska doprovázejí nefelinické syenity na poloostrově Kola v Rusku.
Pěkně zbarvené odrůdy se zpracovávají jako ozdobné kameny, tzv. chřestovec. Zrnité agregáty slouží k výrobě umělých hnojiv (superfosfátu), fosforu, kyseliny fosforečné, k výrobě některých druhů skel a v keramickém průmyslu (tzv. kostní porcelán).