Sort by semester Standard sorting Presentation
PřF NBIFP Bioinformatics
Name in Czech: Bioinformatika
master's full-time single-subject, language of instruction: Czech Czech
Included in the programme: PřF N-BINF Bioinformatics

Introductory information / Instructions

Absolvovat všechny povinné a vybrané povinně volitelné předměty nejvyšší formou ukončení.

Diplomová práce (min 20kr.)

Code Name Guarantor Type of Completion Extent and Intensity Credits Term Specialization
PřF:C4750Diploma Thesis in Bioinformatics I M. Wimmerováz 0/0/1010 2-
PřF:C4751Diploma Thesis in Bioinformatics II M. Wimmerováz 0/0/1010 3-
PřF:C4752Diploma Thesis in Bioinformatics III M. Wimmerováz 0/0/2020 4-
40 credits

Povinné předměty (P a PV více než 90kr.)

Code Name Guarantor Type of Completion Extent and Intensity Credits Term Specialization
PřF:C2138Advanced bioinformatics M. Wimmerovázk 2/0/02+2 2Z
PřF:C2139Advanced bioinformatics - seminary M. Wimmerováz 0/1/01 2-
PřF:C3211Applied bioinformatics M. Wimmerovák 0/23 2Z
PřF:C3750Data management R. Svobodovák 1/0/02 1Z
PřF:C3850Field Seminar in Bioinformatics M. Wimmerováz 0/0/55 1-
PřF:CG010Proteomics J. Havlišzk 2/0/02+2 1Z
PřF:CG020Genomics J. Hejátkozk 2/0/02+2 1Z
PřF:CZMBIState exam of the master's degree study in Bioinformatics M. WimmerováSZk 0/0- 4-
FI:IV106Bioinformatics Seminar M. Lexak 0/1/0(1+1)*2 --
PřF:JA002Advanced Examination in English for Specific Purposes - Science E. Čoupkovázk 0/0/02 3-
FI:MA012Statistics II O. Pokorazk 2/2/03+2 1-
FI:PV251Visualization B. Kozlíkovázk 2/1/03+2 1Z
PřF:S4002Law, ethics and philosophy of science J. Havlišk 2/0/02+2 1Z
43 credits

Machine learning

Student si musí zvolit alespoň jeden z předmětů.

Code Name Guarantor Type of Completion Extent and Intensity Credits Term Specialization
PřF:Bi9680enArtificial Intelligence in Biology, Chemistry, and Bioengineering J. Damborskýzk 2/0/02+2 -Z
FI:PV056Machine Learning and Data Mining J. Sedmidubskýzk 2/0/13+2 -Z
9 credits

Programování

Student si musí zapsat předměty v celkové výši alespoň 5 kreditů.

Code Name Guarantor Type of Completion Extent and Intensity Credits Term Specialization
PřF:C2160C Programming for Chemists T. Trnkak 0/2/02+1 --
PřF:C3220Advanced C Programming for Chemists T. Trnkak 0/2/02+1 --
FI:PB112Foundations of Object Oriented Programming in Java M. Trtíkzk 2/2/03+2 --
FI:PB138Basics of Web Development and Markup Languages S. Pastvazk 2/2/03+2 --
FI:PB178Introduction to Development in C#/.NET M. Macákzk 2/2/03+2 --
21 credits

Zaměření

Strukturní bioinformatika a drug design

Compulsory courses
Code Name Guarantor Type of Completion Extent and Intensity Credits Term Specialization
PřF:C2136Advanced chemoinformatics and drug design R. Svobodovázk 2/0/02+2 2P
PřF:C2137Advanced chemoinformatics and drug design - seminar R. Svobodováz 0/1/01 2-
PřF:C3760AI in structural bioinformatics R. Svobodovák 1/1/03 2P
FI:PV082 -- 0/0- 3P
8 credits
Selective courses
Code Name Guarantor Type of Completion Extent and Intensity Credits Term Specialization
PřF:C3770Structural bioinformatics seminar R. Svobodováz 0/2/02 --
PřF:C3771Structural bioinformatics seminar II R. Svobodováz 0/2/02 --
PřF:C7920Structure and functions of proteins M. Wimmerovázk 2/0/02+2 --
PřF:C7925Nucleic acids structure and dynamics J. Šponerzk 2/0/02+2 --
PřF:C9530Structure of biomacromolecules L. Žídekzk 2/0/02+2 --
PřF:C9531Structure of biomacromolecules L. Žídekz 0/2/02 --
PřF:C9920Introduction to Quantum Chemistry M. Munzarovázk 2/1/03+2 --
23 credits

Sekvenční bioinformatika

Compulsory courses
Code Name Guarantor Type of Completion Extent and Intensity Credits Term Specialization
PřF:C3780Bioinformatics Workflow Managers R. Svobodovázk 2/2/05 2P
FI:IV108Bioinformatics II M. Lexazk 1/1/02+2 2P
FI:PV269Advanced Methods in Bioinformatics M. Lexazk 1/2/03+2 3P
14 credits
Selective courses
Code Name Guarantor Type of Completion Extent and Intensity Credits Term Specialization
PřF:C3790AI-Assisted Bioinformatics Data Analysis in R V. Bystrýk 0/2/02 --
PřF:C7188Introduction to molecular medicine O. Slabýzk 2/0/02+2 --
PřF:C7490Molecular diagnostics of inherited diseases J. Fajkuszk 1/0/01+2 --
PřF:C7920Structure and functions of proteins M. Wimmerovázk 2/0/02+2 --
FI:IV110Exercises in Sequence Analysis M. Lexak 0/2/02+1 --
FI:IV124Complex Networks J. Spurnýk 0/2/02+1 --
FI:MA015Graph Algorithms J. Obdržálekzk 2/1/03+2 --
FI:PV021Neural Networks T. Brázdilzk 2/0/24+2 --
30 credits

Výpočetní systémová biologie

Compulsory courses
Code Name Guarantor Type of Completion Extent and Intensity Credits Term Specialization
FI:IV108Bioinformatics II M. Lexazk 1/1/02+2 2P
FI:IV120Continuous and Hybrid Systems D. Šafránekzk 2/1/03+2 3P
FI:PA054Formal Methods in Systems Biology D. Šafránekzk 2/0/02+2 2P
13 credits
Selective courses
Code Name Guarantor Type of Completion Extent and Intensity Credits Term Specialization
PřF:C7170Structure and function of the cell O. Šerýzk 2/0/02+2 --
PřF:C7188Introduction to molecular medicine O. Slabýzk 2/0/02+2 --
FI:IV124Complex Networks J. Spurnýk 0/2/02+1 --
FI:MA015Graph Algorithms J. Obdržálekzk 2/1/03+2 --
FI:PA183Exercises in Systems Biology D. Šafránekk 0/1/12+1 --
FI:PB172Lab Seminar – Sybila D. Šafránekk 0/2/02+1 --
FI:PV021Neural Networks T. Brázdilzk 2/0/24+2 --
FI:PV270Biocomputing D. Šafránekzk 2/0/02+2 --
32 credits

Elective courses

Code Name Guarantor Type of Completion Extent and Intensity Credits Term Specialization
PřF:Bi0001The Stories of Science: Cancer J. Šmardak 1/0 jednou za týden 1 hodina.1+1 --
PřF:Bi8350Evolutionary genomics R. Hobzazk 2/0/02+2 --
FI:PA152Efficient Use of Database Systems V. Dohnalzk 2/0/13+2 --
FI:PA195NoSQL Databases V. Dohnalk 2/1/03+1 --
FI:PV247Modern Development of User Interfaces S. Pastvaz 0/3/14 --
FI:PV287Artificial Intelligence and Machine Learning in Healthcare V. Nováčekk 1/1/02+1 --
22 credits