E4013 Týmový projekt z Matematické biologie a biomedicíny – biomedicínská bioinformatika

Přírodovědecká fakulta
jaro 2024
Rozsah
0/2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.
Vyučující
doc. Mgr. Natália Martínková, Ph.D. (přednášející)
doc. Mgr. David Bednář, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Eva Budinská, Ph.D. (přednášející)
doc. Ing. Vlad Popovici, PhD (přednášející)
Mgr. Jan Böhm (cvičící)
Mgr. Soňa Smetanová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Barbora Zwinsová, Ph.D. (cvičící)
Garance
prof. RNDr. Ladislav Dušek, Ph.D.
RECETOX – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Mgr. Natália Martínková, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: RECETOX – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 19. 2. až Ne 26. 5. Pá 10:00–11:50 D29/347-RCX2
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Anotace
V průběhu předmětu studenti týmově řeší zadanou úlohu z oblasti bioinformatiky. Hlavním cílem předmětu je podpořit schopnost studentů pracovat týmově a spolupracovat na zadané úloze a realizaci jednotlivých kroků analýzy včetně prezentace výsledků.
Výstupy z učení
Student bude po absolvování předmětu schopen: - praktického nastudování biologické a bioinformatické podstaty problému a metod, - praktického provedení bioinformatického úkolu - týmové spolupráce - prezentace výsledků
Klíčová témata
Zadání studentských prací bude vybráno z následujících oblastí: - analýza dat sekvenování nové generace (genomika, transkriptomika, metagenomika - mikrobiom) - analýza sekvencí DNA - analýza dat hmotnostních spektrometrie (metabolomika, proteomika) - strukturní bioinformatika - a pod
Studijní zdroje a literatura
  • KOLAJOVÁ, Lenka. Týmová spolupráce : jak efektivně vést tým pro dosažení nejlepších výsledků. 1. vyd. Praha: Grada, 2006, 105 s. ISBN 8024717646. URL info
Přístupy, postupy a metody používané ve výuce
Diskuse nad zadanými úkoly, průběžné prezentace řešení.
Způsob ověření výstupů z učení a požadavky na ukončení
Kritické zhodnocení řešení zadaného úkolu.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2023, podzim 2024, podzim 2025.