VLLM0522c Lékařská mikrobiologie II - cvičení

Lékařská fakulta
podzim 2012
Rozsah
0/3/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
MUDr. Ondřej Zahradníček (přednášející)
MUDr. Lenka Černohorská, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Monika Dvořáková Heroldová, Ph.D. (cvičící)
Ing. Veronika Holá, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Martina Mahelová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Barbora Mališová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Tereza Peroutková (cvičící)
prof. MUDr. Filip Růžička, Ph.D. (cvičící)
MUDr. Alena Siváková (cvičící)
Mgr. Petra Šišková, Ph.D. (cvičící)
doc. MUDr. Vladana Woznicová, Ph.D. (cvičící)
Ing. Magdalena Flasarová (pomocník)
Iva Holešovská (pomocník)
Garance
prof. MUDr. Filip Růžička, Ph.D.
Mikrobiologický ústav - Společná pracoviště s Fakultní nemocnicí u sv. Anny v Brně - Lékařská fakulta
Kontaktní osoba: MUDr. Ondřej Zahradníček
Dodavatelské pracoviště: Mikrobiologický ústav - Společná pracoviště s Fakultní nemocnicí u sv. Anny v Brně - Lékařská fakulta
Rozvrh seminárních/paralelních skupin
VLLM0522c/01_02: St 7:30–10:00 N02112, P. Šišková
VLLM0522c/03_04: St 10:20–12:50 N02112, M. Dvořáková Heroldová
VLLM0522c/05_06: Pá 7:30–10:00 N02112, O. Zahradníček
VLLM0522c/07_08: Pá 10:20–12:50 N02112, O. Zahradníček
VLLM0522c/09_10: Po 7:30–10:00 N02112, L. Černohorská
VLLM0522c/11_12: Po 10:20–12:50 N02112, O. Zahradníček
VLLM0522c/13_14: Út 7:30–10:00 N02112, O. Zahradníček
VLLM0522c/15_16: Út 10:20–12:50 N02112, M. Dvořáková Heroldová
VLLM0522c/17_18: Čt 7:30–10:00 N02112, T. Peroutková
VLLM0522c/19_20: Čt 10:20–12:50 N02112, M. Mahelová
VLLM0522c/30_32: Rozvrh nebyl do ISu vložen. O. Zahradníček
VLLM0522c/31_33: Rozvrh nebyl do ISu vložen. O. Zahradníček
Předpoklady
VSBC0221p Biochemie I-předn. && VLLM0421c Lékařská mikrobiologie I-cvič. && VSET021 Lékařská etika I && ( VSLT0221s Základy lék. terminol. II -s || VSLT011s Základy lék. terminologie -p ) && ZC041 Zacházení s chemickými látkami
Nezbytným předpokladem pro absolvování předmětu je znalost učiva předmětu VLLM0421c. Tato znalost se považuje za samozřejmou a věci z prvního semestru již nebudou znovu vysvětlovány.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Na konci tohoto kursu bude student schopen
* porozumět významu mikrobiálních nálezů v různých lokalizacích
* rozumět rozdílu mezi běžnou mikrobiální flórou, přechodnými nálezy, kontaminanty a patogeny v různých lokalizacích
* chápat, které infekce jsou vzácné a které se zpravidla vyskytují častěji
* znát základy diagnostického a terapeutického přístupu u nejtypičtějších mikrobiálních onemocnění; nicméně zde může jít pouze o základ a další rozšíření je očekávání v klinických předmětech, zejména Infektologii

Jmenovitě bude student znát běžnou flóru (existuje-li)/přechodné nálezy/běžné kontaminanty/patogeny v 
* jednotlivých částech horních a dolních dýchacích cest, plic a středního ucha
* různých částech gastrointestinálního traktu, jater, žlučníku a slinivky břišní
* jednotlivých částech vylučovacího systému
* jednotlivých částech pohlavního systému
* jednotlivých částech centrálního a periferního nervového systému
* krevního řečiště, kostí, svalů a rozličných tkání
* kůže, očí, zevního ucha

Student také bude znát specifické problémy mikrobiálních infekcí
* během těhotenství a porodu a během prvních dnů po porodu
* u hospitalizovaných, zejmén imunokompromitovaných pacientů (nemocniční infekce) Měl by mít také základní přehled v 
* problematice detekce biofilmu (včetně testování účinnosti antibiotika na biofilm)
* základních procesech klinické mikrobiologie (indikace, odběry a transport vzorků, zpracování vzorku, vydávání výsledku, interpretace výsledku)

Zájemci o hlubší seznámení s problematikou klinické mikrobiologie a antibiotické terapie si mohou později zapsat navazující předmět VSAT081.
Osnova
  • Sylabus výuky lékařské mikrobiologie II (3. ročník, podzimní semestr)
  • P01 Diagnostika stafylokoků
  • P02 Diagnostika streptokoků
  • P03 Dg. ostatních G+ baktérií (enterokoků, liserií, korynebakterií, bacilů)
  • P04 Diagnostika enterobaktérií, vibrií a kampylobakterů
  • P05 Diagnostika čeledi Pasteurellaceae a gramnegativních nefermentujících baktérií
  • P06 Dg. ostatních G- baktérií (neisserie, branhamelly, bordetelly, legionelly, franciselly..)
  • P07 Diagnostika striktně anaerobních baktérií
  • P08 Diagnostika mykobaktérií a nokardií
  • P09 Diagnostika spirochetálních infekcí
  • P10 Základy lékařské mykologie
  • P11 Úvod do problematiky biofilmu v bakteriologické diagnostice
  • P12 Klinická mikrobiologie I (odběr a transport materiálu, uchovávání vzorků)
  • P13 Klinická mikrobiologie II běžná flóra a patogeny v jednotlivých typech vzorků.
  • P14 Opakování
  • Případné odchylky oznámí studentům učitel.
Literatura
  • VOTAVA, Miroslav. Lékařská mikrobiologie obecná. 1. vyd. Brno: Neptun, 2001. 247 s. ISBN 80-902896-2-2. info
  • VOTAVA, Miroslav. Lékařská mikrobiologie speciální. 1. vyd. Brno: NEPTUN, Březová 18, 637 00 Brno, 2003. 495 s. ISBN 80-902896-6-5. info
  • VOTAVA, Miroslav, Filip RŮŽIČKA, Vladana WOZNICOVÁ, Lenka ČERNOHORSKÁ, Milada DVOŘÁČKOVÁ, Monika DVOŘÁKOVÁ HEROLDOVÁ, Veronika HOLÁ a Ondřej ZAHRADNÍČEK. Lékařská mikrobiologie: Vyšetřovací metody. 1. vyd. Brno: Neptun, 2010. 495 s. ISBN 978-80-86850-04-7. info
  • GREENWOOD, David. Lékařská mikrobiologie : přehled infekčních onemocnění : patogeneze, imunita, laboratorní diagnostika a epidemiologie. 1. vyd. Praha: Grada Publishing, 1999. 686 s. ISBN 80-7169-365-0. info
  • BEDNÁŘ, Marek. Lékařská mikrobiologie : bakteriologie, virologie, parazitologie. 1. vyd. Praha: Marvil, 1996. 558 s. info
  • RULÍK, Martin, Veronika HOLÁ, Filip RŮŽIČKA, Miroslav VOTAVA, Dana BAUDIŠOVÁ, Jiří GALLO, Simona KAPRÁLOVÁ, Kateřina KOHUŠOVÁ, Dagmar KOUKALOVÁ, Václav KŮDELA, Jiří MIKEŠ, Radko NOVOTNÝ, Martina SIGLOVÁ, Věra TORŠOVÁ a Jiří ZIMÁK. Mikrobiální biofilmy. 1. vydání. Olomouc: Univerzita Palackého v Olomouci, 2011. 448 s. Monografie. ISBN 978-80-244-2747-8. info
  • Medical microbiology : A guide to microbial infections: Pathogenesis, immunity, laboratory diagnosis and control. Edited by David Greenwood - Richard C. B. Slack - John F. Peutherer - Barer M. 17th ed. Edinburgh: Churchill Livingstone, 2007. 738 s. ISBN 978-0-443-10209-7. info
  • MURRAY, Patrick R., Ken S. ROSENTHAL a George S., et al. KOBAYASHI. Medical microbiology. 6th ed. St. Louis: Mosby, 2008. 960 s. ISBN 0-323-05470-6. info
  • GOERING, R., ET AL. Mims’ Medical Microbiology, 4th. ed. Edited by Cedric A. Mims. Mosby, 2007. info
  • BJARNSHOLT, Thomas, Claus MOSER a Niels HØIBY. Biofilm Infections. Springer, 2011. ISBN 978-1-4419-6084-9. e-book info
  • Pro české studium jsou základní tituly 1, 2 a protokoly z IS MU, ostatní jsou doplňkové. For English study, title No. 7 is essential, plus protocoles on IS MU. Titles No. 8 and 9 are supplementary.
Výukové metody
praktické cvičení
samostudium s e-learningovými materiály
pomocné drilové učebnice (pro nácvik názvů parazitů a pro názvy nemocí : názvy mikrobů)
Metody hodnocení
Předpoklady udělení zápočtu:
(1) absolvování všech praktických cvičení, přičemž
- dvě omluvené nebo s vyučujícím dohodnuté absence jsou přípustné, student je však i tak povinen prokázat, že si učivo doplnil (předložením řádně vyplněného protokolu a případně také prokázáním znalosti učiva, na které student chyběl)
- větší počet je nutno nahradit; nahrazování mimo příslušný týden výuky je možné jen výjimečně a po domluvě s vyučujícím
- neomluvené absence nejsou tolerovány
(2) kompletní a učitelem potvrzený zápis ze všech praktik v protokolu (pokud učitel zápis nepodepíše pro nedostatečnost, je student povinen zápis přepracovat)
(3) zodpovězení všech kontrolních otázek v IS MU na dostatečný počet bodů (počet bodů je uveden u každé sady otázek)
(4) úspěšné napsání zápočtového testu; datum konání zápočtového testu bude včas oznámeno.
Navazující předměty
Informace učitele
http://www.medmicro.info
E-mailový a telefonický kontakt – E-mail and phone contact:
Doc. MUDr. Filip Růžička, PhD: fruzic@fnusa.cz, TEL 543 183 090 (přednosta ústavu/head)
prof. MUDr. Miroslav Votava, CSc.: miroslav.votava@fnusa.cz, TEL 543 183 117
as. MUDr. Ondřej Zahradníček: zahradnicek@fnusa.cz, TEL 543 183 113
odb. as. MUDr. Lenka Černohorská, PhD.: lenka.cernohorska@fnusa.cz, TEL 543 183 093
odb. as. Mgr. Monika Dvořáková Heroldová, PhD: monika.heroldova@fnusa.cz
as. Mgr. Barbora Žaloudiková: barzal@cktch.cz
as. Mgr. Martina Mahelová: 150878@mail.muni.cz
as. Mgr. Petra Šišková: 151271@mail.muni.cz
as. MUDr. Alena Siváková: alena.sivakova@fnusa.cz
as. Mgr. Tereza Peroutková: peroutkova.tereza@fnusa.cz
Další informace jsou průběžně zveřejňovány na nástěnce v praktikárně ústavu. More information in Practical Hall.
Další komentáře
Studijní materiály
Poznámka k ukončení předmětu: Podmínky zápočtu jsou uvedeny v Doplňkových údajích k předmětu
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2000, podzim 2001, podzim 2002, podzim 2003, podzim 2004, podzim 2005, podzim 2006, podzim 2007, podzim 2008, podzim 2009, podzim 2010, podzim 2011, podzim 2013, podzim 2014, podzim 2015, podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021.