C2110 Operační systém UNIX a základy programování

Přírodovědecká fakulta
podzim 2013
Rozsah
0/2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
Vyučující
RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Pavel Janoš, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Jakub Štěpán, Ph.D. (cvičící)
Ing. Tomáš Trnka, Ph.D. (cvičící)
Garance
RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul - Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul - Přírodovědecká fakulta
Rozvrh seminárních/paralelních skupin
C2110/01: Po 13:00–14:50 C04/118, P. Kulhánek, J. Štěpán, T. Trnka
C2110/02: Út 15:00–16:50 C04/118, P. Kulhánek, J. Štěpán, T. Trnka
Předpoklady
Základy práce s počítačem (např. MS Windows XX, Word, Excel)
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 42 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/42, pouze zareg.: 0/42, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/42
Mateřské obory/plány
předmět má 26 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Na konci kurzu bude student ovládat základní příkazy operačních systémů Unix a Linux. Bude je schopen spojovat do složitejších konstrukcí pomocí skriptování. Dále bude schopen vytvářet skripty v programovacích jazycích AWK a gnuplot. Jejich kombinací bude schopen analýzovat výstupy ze základních vědecko-technických výpočtů. Nabyté schopnosti jsou nezbytným předpokladem pro počítačovou chemii a molekulové modelování a pro případné navazující studium programování v kompilovaných jazycích (C/C++).
Osnova
  • 1. Klastr WOLF (struktura, pravidla používání, správci)
  • 2. Přihlašování (místní a vzdálené přihlášení, export displeje, změna hesla)
  • 3. Programové vybavení (systémové aplikace, vědeckotechnické aplikace)
  • 4. Textové editory (vi, grafické textové editory)
  • 5. Příkazová řádka (terminály, struktura, historie a automatické dokončování)
  • 6. Souborový systém (struktura, absolutní a relativní cesty, práva, speciální soubory, diskové oddíly)
  • 7. Příkazy (manuálové stránky, přehled příkazů)
  • 8. Procesy (procesy, standardní vstup a výstup, přesměrování, roury)
  • 9. Úvod do skriptování (co je to skriptování, výhody a nevýhody, spouštění skriptů)
  • 10. Skriptování v jazyce Bash (proměnné, základní řídící konstrukce)
  • 11. Skriptování v programu gnuplot (vykreslování 2D a 3D grafů, interaktivní versus neinteraktivní mód)
  • 12. Skriptování v jazyce AWK (základní konstrukce, jednoduché zpracovávání textových souborů)
  • 13. Použití skriptování při analýze dat (znázornění průběhu výpočtu Gibbsových energií, studentské projekty)
Literatura
  • HAHN, Harley a Peter NORTON. Průvodce UNIXEM od Petera Nortona : Jak komunikovat s UNIXEM, jak UNIX ukládá a zobrazuje informace, používání unixového systému souborů, práce s editorem vi : Peter Norton's Guide to UNIX (Orig.). 1.vyd. Brno: UNIS, 1993. XXIV, 562. info
  • BRANDEJS, Michal. UNIX - Linux : praktický průvodce. 1. vyd. Praha: Grada, 1996. 340 s. ISBN 8071691704. info
  • PETRLÍK, Lukáš. Jemný úvod do systému UNIX. 1. vyd. České Budějovice: Kopp, 1995. 189 s. ISBN 80-85828-28-6. info
Výukové metody
přednášky, procvičování praktických příkladů, diskuze
Metody hodnocení
Účast v cvičení je povinná (povolené jsou dvě dopředu omluvené absence). V pruběhu semestru se uskuteční dva testy (2x 10 bodů). Ve zkouškovém období pak zavěrečný test (50 bodů) a samostatné sestavení skriptu (30 bodů). Pro uspěšné zakončení přemětu je zapotřebí získat minimálně 80 bodů.
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2007 - akreditace, jaro 2000, podzim 2010 - akreditace, jaro 2001, jaro 2002, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, podzim 2007, podzim 2008, podzim 2009, podzim 2010, podzim 2011, podzim 2011 - akreditace, podzim 2012, podzim 2014, podzim 2015, podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021.