PřF:FB850 Biomolekulární interakce - Informace o předmětu

FB850 Biomolekulární interakce

Přírodovědecká fakulta
jaro 2021

Rozsah

1/0/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.

Vyučující

prof. Mgr. Richard Štefl, Ph.D. (přednášející)

Garance

Předpoklady

Základní znalosti o složení a primární sekvenci proteinů a nukleových kyselin.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.

Cíle předmětu

Předmět si klade za cíl seznámit studenty se základními typy interakcí, kterými spolu interagují proteiny s nukleovými kyselinami, zejména RNA.

Osnova

1. Struktura biomolekul – sekundární, terciární, kvartérní: Ribonukleová kyselina, Deoxyribonukleová kyselina, Proteiny
2. Rozpoznání RNA proteiny: Strukturní motivy, Sekvenční motivy
3. Metody pro studium interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami a jejich komplexů: Biochemické metody pro určení interakčních afinit, Strukturní metody pro studium interakcí na atomární úrovni, Přednosti a nevýhody jednotlivých metod
4. Vizualizační programy
5. Statické zobrazení struktur
6. Zobrazení dynamických dat – „morphing“

Literatura

Raymond F. Gesteland, Thomas R. Cech: The RNA World 3rd Ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2005
Victor A. Bloomfield, Donald M. Crothers, Ignacio Tinoc, Jr.: Nucleic Acids: Structures, properties, functions, University Science Books, 1st Ed., 2000
Wolfram Saenger: Principles of Nucleic Acid Structure, Springer, 1988
Donald Voeth and Judith G. Voeth: Biochemistry 4th Ed., Willey, 2010

Výukové metody

Samostatné studium literatury, prezentace a diskuze

Metody hodnocení

Prezentace a diskuze studovaného problému

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.