PřF:C8862 Výpočty volných energií - cv. - Informace o předmětu
C8862 Výpočty volných energií - cvičení
Přírodovědecká fakultajaro 2021
Předmět se v období jaro 2021 nevypisuje.
- Rozsah
- 0/1. 1 kr. Ukončení: z.
- Vyučující
- RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D. (přednášející)
- Garance
- RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta - Předpoklady
- C2110 UNIX a programování && C7800 Molekulové modelování && NOW ( C8863 Výpočty volných energií )
Předpokládají se základní znalosti obecné, fyzikální, výpočetní chemie a operačního systému UNIXového typu. - Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- předmět má 20 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Kurz je zaměřen na získání základních znalostí v oblasti výpočtů volných energií pomocí metod výpočetní chemie. Student si prakticky vyzkouší vybrané metody probírané na přednášce na modelových systémech.
- Výstupy z učení
- Student bude po absolvování předmětu schopen:
- zvolit vhodnou metodu výpočtu volné energie;
- určit složení reakční směsi v rovnováze;
- navrhnout vhodné termodynamické cykly;
- popsat chemické přeměny pomocí potenciálu střední síly; - Osnova
- volné energie metodami koncových stavů
- solvatační volné energie pomocí termodynamické integrace
- volná energie konformačních přeměn pomocí metod potenciálu střední síly
- Literatura
- Free energy calculations : theory and applications in chemistry a biology. Online. Edited by Christophe Chipot - Andrew Pohorille. Berlin: Springer, 2007. xviii, 517. ISBN 9783540384472. [citováno 2024-04-23] info
- CRAMER, Christopher J. Essentials of computational chemistry : theories and models. Online. 2nd ed. Chichester: John Wiley & Sons, 2004. xx, 596. ISBN 0470091819. [citováno 2024-04-23] info
- LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. Online. 2nd ed. Harlow: Prentice Hall, 2001. xxiii, 744. ISBN 0582382106. [citováno 2024-04-23] info
- Výukové metody
- praktické cvičení
- Metody hodnocení
- Zápočet je udělen za dokončení projektu a jeho obhájení. Účast je povinná (povolené jsou dvě dopředu omluvené absence).
- Další komentáře
- Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
v roce 2014 bude výuka probíhat blokově.
- Statistika zápisu (jaro 2021, nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/jaro2021/C8862