PřF:Bi7420 Metody analýzy genomu - Informace o předmětu
Bi7420 Moderní metody pro analýzu genomu
Přírodovědecká fakultapodzim 2024
- Rozsah
- 1/0/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
Vyučováno kontaktně - Vyučující
- MVDr. Boris Tichý, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Vojtěch Bystrý, Ph.D. (přednášející)
prof. MUDr. Mgr. Marek Mráz, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Terézia Kurucová (přednášející)
Mgr. Filip Pardy (přednášející) - Garance
- MVDr. Boris Tichý, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Mgr. Vojtěch Bystrý, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta - Rozvrh
- Po 15:00–16:50 B11/305
- Předpoklady
- Bi1700 Buněčná biologie && ( Bi4010 Základy molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie ) && ( Bi4020c Molekulární biologie - cv. || Bi6400 Metody molekulární biologie )
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 40 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 14/40, pouze zareg.: 0/40, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/40 - Mateřské obory/plány
- Bioanalytická laboratorní diagnostika ve zdravotnictví - Lékařská genetika a molekulární diagnostika (program PřF, N-LGM)
- Lékařská genetika a molekulární diagnostika pro odborné pracovníky v laboratorních metodách (program PřF, N-BI)
- Molekulární biologie a genetika (program PřF, N-EXB)
- Molekulární biologie a genetika (program PřF, N-MBG)
- Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
- Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Experimentální biologie živočichů a imunologie)
- Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)
- Cíle předmětu
- Na konci tohoto kurzu bude student schopen s orientovat v moderních mmolekulárně-biologických metodách a vysvětlit principy čipových technologií a sekvenování nové generace
- Výstupy z učení
- Student bude po absolvování předmětu schopen: - aplikovat metodu CRISPR ve svém výzkumu - popsat princip sekvenování nové generace - navrhnout experiment s využitím sekvenování nové generace - analyzovat data získaná sekvenováním nové generace
- Osnova
- 1. Microarrays - technologické aspekty čipových technologií; expresní, CGH, SNP čipy, resekvenační, a proteinové čipy 2. Sekvenování nové generace (NGS) – technologické aspekty různých NGS platforem 3. Příprava knihoven pro sekvenování nové generace 4. Metody pro analýzu nekódujících RNA – miRNA, lncRNA, příklady využití v onkologii 5. Analýza dat – bioinformatické přístupy a statistické metody hodnocení 6. Aplikace - Využití čipových a NGS technologií, design experimentů
- Literatura
- Koubková L, Vojtěšek B, Vyzula R. Next generation sequencing - application in clinical practice. Klin Onkol. 2014;27 Suppl 1:S61-8.
- Výukové metody
- Teoretická příprava.
- Metody hodnocení
- písemný test
- Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
- Statistika zápisu (nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2024/Bi7420