PřF BINFO Bioinformatika
Název anglicky: Bioinformatics
bakalářský prezenční se specializací, vyučovací jazyk: čeština čeština
Zahrnut v programu: PřF B-BIC Biochemie

Součásti SZZ a jejich obsah

Součástí SZZ jsou předměty Obecný chemický základ, Biochemie, Buněčná biologie a Biochemické metody zaměřené na širší teoretický základ studenta v oblastech chemie zahrnujících biochemii, anorganickou, organickou, analytickou nebo fyzikální chemii, a dále pak v oblastech v v oblasti porozumění organizace chemických a biologických dat včetně přehledu v základních informatických disciplínách. Další součástí SZZ je Bakalářská práce z Biochemie, která je zaměřena na ověření praktických dovedností studentů v laboratoři, jejich schopnosti interpretace dat, jejich kritického zhodnocení, a schopnosti sepsat text v požadovaném rozsahu.
SZZ navazuje na následující předměty:
C1601 Základy obecné a anorganické chemie
C1660 Základy analytické chemie
C2700 Základy organické chemie
C4660 Fyzikální chemie I
C3181 Biochemie I
C4182 Biochemie II
C4230 Biochemie - praktikum
C7879 Zpracování experimentálních dat
Bi4020 Molekulární biologie
C2133 Úvod do chemoinformatiky
C2135 Bioinformatika v praxi
C2184 Úvod do programování v Pythonu
C3210 Strukturní Bioinformatika
FI:PB001 Úvod do informačních technologií
C5014 Bakalářská práce z biochemie I
C6016 Bakalářská práce z biochemie II

Návrh témat kvalifikačních prací a témata obhájených prací

Vliv přírodních prostředků dentální hygieny na mikrobiom ústní dutiny
Veronika Brychtová, bakalářská práce, obhájeno 20. 6. 2022, https://is.muni.cz/auth/th/cw57t/

Zhodnocení různých vodivostních detektorů v analýze laktátu/pyruvátu pomocí kapilární elektroforézy
Petra Crhonková, bakalářská práce, obhájeno 17. 6. 2022, https://is.muni.cz/auth/th/y3atl/

Imunostanovení s fluorescenčními nanočásticemi pro detekci Melissococcus plutonius
Miroslav Herczeg, bakalářská práce, obhájeno 25. 6. 2019, https://is.muni.cz/auth/th/px0c7/

Stabilita antipsychotik v suché krevní skrvně
Miriam Štolcová, bakalářská práce, obhájeno 8. 7. 2021, https://is.muni.cz/auth/th/bjhj1/

Využití foton-upkonverzních nanočástic v imunostanoveních
Eliška Odstrčilíková, bakalářská práce, obhájeno 15. 7. 2020, https://is.muni.cz/auth/th/fur0u/

Doporučený průchod studijním plánem

Společná část (90-120kr.)

Společný univerzitní základ (15 kr.)

K úspěšnému zakončení studia student v bakalářských studijních programech získá 15 kr. z předmětů tzv. Společného univerzitního základu. Mezi tyto kredity se počítají 2 kredity z předmětů sportovních aktivit (TV), 4 kredity za cizí jazyk, a 9 kreditů za předměty společensko-vědního či přírodovědného základu – tzv. CORE předmětů. Aktuální nabídka CORE předmětů je k dispozici zde: https://www.muni.cz/studenti/spolecny-univerzitni-zaklad

Společensko-vědní a přírodovědný základ

Student povinně zapisuje předměty v minimální celkové hodnotě 9 kreditů za celé bakalářské studium ze základní nabídky Společného univerzitního základu. https://www.muni.cz/studenti/spolecny-univerzitni-zaklad

Jazyky

K úspěšnému ukončení studia na PřF má student povinnost absolvovat zkoušku JASUZ Odborná angličtina - zkouška za 4 kredity. Výuka jazyků je zajišťována Centrem jazykového vzdělávání MU.

Kód Název Garant Ukončení Rozsah Kreditů Semestr Profilace
PřF:JASUZOdborná angličtina - zkouška A. Bízková Doleželovázk 0/0/04 --
4 kredity
TV

Všichni studenti prezenčního studia bakalářských studijních programů mají povinnost během studia splnit podmínky pro udělení dvou zápočtů (1 zápočet = 1 kredit) z předmětů sportovních aktivit vypisovaných pod kódy P9. Předměty zajišťuje Centrum univerzitního sportu Fakulty sportovních studií.

Bakalářská práce (min 10kr.)

Kód Název Garant Ukončení Rozsah Kreditů Semestr Profilace
PřF:C5014Bakalářská práce z biochemie I J. Lochmanz 0/0/55 5P
PřF:C6016Bakalářská práce z biochemie II J. Lochmanz 0/0/1515 6P
20 kreditů

Povinné předměty

Každý akademický rok studia je nutno absolvovat povinný předmět bez kreditového hodnocení C7777 Zacházení s chemickými látkami zakončený zápočtem. Absolvování předmětu C7777 je nutnou podmínkou pro vstup do všech předmětů, ve kterých dochází k manipulaci s chemickými látkami, tzn. laboratorní cvičení, bakalářská práce apod.

Kód Název Garant Ukončení Rozsah Kreditů Semestr Profilace
PřF:Bi4020Molekulární biologie J. Šmardazk 3/0/03+2 4Z
PřF:C1200Úvod do studia biochemie J. Lochmank 2/0/02+1 1P
PřF:C1471Aplikovaná matematika pro biochemiky R. Svobodovázk 1/0/01+2 2-
PřF:C1472Aplikovaná matematika pro biochemiky - seminář R. Svobodováz 0/1/01 2-
PřF:C1601Základy obecné a anorganické chemie M. Nečaszk 2/0/02+2 1Z
PřF:C1605Základy obecné a anorganické chemie - seminář M. Nečasz 0/2/02 1-
PřF:C1660Základy analytické chemie K. Novotnýzk 2/0/02+2 3Z
PřF:C2131Úvod do bioinformatiky M. Wimmerovázk 2/0/02+2 2Z
PřF:C2700Základy organické chemie J. Literákzk 2/0/02+2 2Z
PřF:C2701Základy org. chemie - seminář J. Literákz 0/1/01 2-
PřF:C3150Fyzikální chemie I - seminář H. Semrádz 0/2/02 2-
PřF:C3181Biochemie I P. Skládalzk 2/0/02+2 3Z
PřF:C4182Biochemie II P. Skládalzk 2/0/02+2 4Z
PřF:C4185Seminář k bakalářské práci I P. Bouchalz 0/2/02 5P
PřF:C4221Biochemická laboratorní technika J. Lochmanz 0/0/44 2P
PřF:C4222Základní laboratorní výpočty V. Sedláčekz 0/1/02 1P
PřF:C4230Biochemie - praktikum J. Lochmanz 0/0/66 4P
PřF:C4660Fyzikální chemie I M. Munzarovázk 2/0/02+2 2Z
PřF:C6185Seminář k bakalářské práci II P. Bouchalz 0/2/02 6P
PřF:C7879Zpracování experimentálních dat K. Dadákovázk 1/0/01+2 3P
PřF:F2120Fyzika Z. Bochníčekk 2/1/03+1 1-
PřF:M1035Matematika pro biochemiky M. Čadekzk 2/2/06 1-
74 kreditů

Povinně-volitelné předměty

Kód Název Garant Ukončení Rozsah Kreditů Semestr Profilace
PřF:C2132Úvod do bioinformatiky - seminář M. Wimmerováz 0/1/01 2-
1 kredit

Volitelné předměty

Student si zapisuje předměty tak, aby za celé studium získal alespoň 180 kreditů.

Specializační část

Povinné předměty

Kód Název Garant Ukončení Rozsah Kreditů Semestr Profilace
PřF:C1473Vybrané kapitoly z aplikované matematiky pro biochemiky T. Račekz 1/0/01 3P
PřF:C2110Operační systém UNIX a základy programování P. Kulhánekk 0/2/02+1 3-
PřF:C2133Úvod do chemoinformatiky R. Svobodovázk 2/0/02+2 1P
PřF:C2135Bioinformatika v praxi L. Malinovskák 0/2/02+1 4P
PřF:C2142Návrh algoritmů pro přírodovědce T. Račekzk 1/2/03+2 2-
PřF:C2143Seminář k návrhu algoritmů pro přírodovědce T. Račekz 0/1/01 2P
PřF:C2145Strukturní bioinformatika v praxi R. Svobodovák 0/1/13 5-
PřF:C2150Zpracování informací a vizualizace v chemii a biochemii P. Kulhánekk 0/2/02+1 4P
PřF:C2184Úvod do programování v Pythonu T. Račekk 0/2/02+1 1P
PřF:C3210Strukturní bioinformatika M. Wimmerovázk 1/0/01+2 3P
PřF:C4020Fyzikální chemie II M. Munzarovázk 2/0/02+2 3-
PřF:C4040Fyzikální chemie II - seminář M. Munzarováz 0/2/02 3-
PřF:C5020Chemická struktura P. Brožzk 2/0/02+2 5-
PřF:C5030Chemická struktura - seminář P. Brožz 0/1/01 5-
PřF:C9088RNA a DNA sekvenční analýza R. Svobodovázk 1/1/02+2 6P
PřF:C9530Strukturní biochemie L. Žídekzk 2/0/02+2 3P
PřF:E1051Úvod do matematické biologie a biomedicíny II T. Pavlíkz 1/0/01 6P
FI:PB001Úvod do informačních technologií L. Matyskazk 2/0/02+2 1P
53 kreditů

Povinně-volitelné předměty

Student je povinen z výběru povinně volitelných předmětů získat minimálně 19 kreditů.

Kód Název Garant Ukončení Rozsah Kreditů Semestr Profilace
PřF:Bi8350Evoluční genomika R. Hobzazk 2/0/02+2 6-
PřF:C2115Praktický úvod do superpočítání P. Kulhánekk 0/2/02 4-
PřF:C2160Programování v jazyce C pro chemiky M. Wimmerovák 0/2/02+1 4-
PřF:C3200Chemická literatura C. Mazalzk 1/0/01+2 3-
PřF:C3220Pokročilé programování v jazyce C pro chemiky T. Trnkak 0/2/02+1 5-
PřF:C6200Biochemické metody Z. Farkazk 4/0/04+2 6-
PřF:C9531Strukturní biochemie - seminář L. Žídekz 0/2/02 3-
PřF:C9920Úvod do kvantové chemie M. Munzarovázk 2/1/03+2 5-
PřF:C9930Metody kvantové chemie M. Munzarovázk 2/1/03+2 6-
PřF:E5444Analysis of sequencing data E. Budinskázk 2/1/02+2 3-
FI:PB029Elektronická příprava dokumentů P. Sojkazk 2/1/03+2 3-
FI:PB168Základy databázových a informačních systémů V. Dohnalzk 2/2/03+2 3-
47 kreditů