Studijní plán

Zobrazení údajů

Řazení po semestrech Klasické řazení Prezentace

PřF BIOMB Biomedicínská bioinformatika

Název anglicky: Biomedical bioinformatics
bakalářský prezenční se specializací, vyučovací jazyk: čeština

Zahrnut v programu: PřF B-MBB Matematická biologie a biomedicína

Součásti SZZ a jejich obsah

Bakalářská státní závěrečná zkouška se skládá ze čtyř částí, v případě prvních tří se jedná o písemnou zkoušku, v případě čtvrté pak o ústní obhajobu závěrečné práce:
1. Biologie - tématické okruhy biologické části SZZ jsou zaměřeny na ověření znalostí z oblasti buněčné biologie, fyziologie, genetiky a molekulární biologie.
2. Matematika a statistika - tématické okruhy matematické části SZZ jsou zaměřeny na ověření znalostí z oblasti matematické analýzy, lineární algebry, pravděpodobnosti a statistiky, vícerozměrných statistických metod a základních principů matematického modelování.
3. Bioinformatika - specializační část SZZ je zaměřena na ověření znalostí z oblasti bioinformatiky a základních metod pro hodnocení a interpretaci dat z molekulárně biologických experimentů.
4. Obhajoba bakalářské práce.

Návrh témat kvalifikačních prací a témata obhájených prací

1. Barbora Zwinsová (2012): Studium exprese genů specifických pro BRAF mutantní nádory kolorekta napříč různými částmi tlustého střeva u časných stupňů vývoje karcinomu (https://is.muni.cz/auth/th/356955/prif_b/),
2. Kamil Jaroň (2013): Genomické ostrovy v genomu plísně asociované se syndromem bílých nosů (https://is.muni.cz/auth/th/376090/prif_b/),
3. Marta Surgentová (2013): Výpočetní analýza proteinových tunelů (https://is.muni.cz/auth/th/380406/prif_b/),
4. Kristína Luermann (2014): Signál selekce v kódující sekvenci DNA (https://is.muni.cz/auth/th/393972/prif_b/),
5. Tereza Hlubinková (2015): Vliv meziplatformové normalizace genových expresních dat na výkonnost genových expresních signatur (https://is.muni.cz/auth/th/408164/prif_b/).

Doporučený průchod studijním plánem

Společná část (90-120kr.)

Společný univerzitní základ (15 kr.)

K úspěšnému zakončení studia student v bakalářských studijních programech získá 15 kr. z předmětů tzv. Společného univerzitního základu. Mezi tyto kredity se počítají 2 kredity z předmětů sportovních aktivit (TV), 4 kredity za cizí jazyk, a 9 kreditů za předměty společensko-vědního či přírodovědného základu – tzv. CORE předmětů. Aktuální nabídka CORE předmětů je k dispozici zde: https://www.muni.cz/studenti/spolecny-univerzitni-zaklad

Společensko-vědní a přírodovědný základ

Student povinně zapisuje předměty v minimální celkové hodnotě 9 kreditů za celé bakalářské studium ze základní nabídky Společného univerzitního základu. https://www.muni.cz/studenti/spolecny-univerzitni-zaklad

Jazyky

K úspěšnému ukončení studia na PřF má student povinnost absolvovat zkoušku JASUZ Odborná angličtina - zkouška za 4 kredity. Výuka jazyků je zajišťována Centrem jazykového vzdělávání MU.

Kód	Název	Garant	Ukončení	Rozsah	Kreditů	Semestr	Profilace
PřF:JASUZ	Odborná angličtina - zkouška	A. Bízková Doleželová	zk	0/0/0	4	-	-
					4 kredity

Všichni studenti prezenčního studia bakalářských studijních programů mají povinnost během studia splnit podmínky pro udělení dvou zápočtů (1 zápočet = 1 kredit) z předmětů sportovních aktivit vypisovaných pod kódy P9. Předměty zajišťuje Centrum univerzitního sportu Fakulty sportovních studií.

Bakalářská práce (min 10kr.)

Kód	Název	Garant	Ukončení	Rozsah	Kreditů	Semestr	Profilace
PřF:E5012	Bakalářská práce z matematické biologie a biomedicíny I	L. Dušek	z	0/5/0	5	5	Z
PřF:E5013	Seminář k bakalářské práci z Matematické biologie a biomedicíny	L. Dušek	z	0/2/0	1	5	Z
PřF:E6012	Bakalářská práce z matematické biologie a biomedicíny II	L. Dušek	z	0/5/0	5	6	Z
PřF:E6013	Seminář k bakalářské práci z Matematické biologie a biomedicíny	L. Dušek	z	0/2/0	1	6	Z
					12 kreditů

Povinné předměty

Kód	Název	Garant	Ukončení	Rozsah	Kreditů	Semestr	Profilace
PřF:Bi1700	Buněčná biologie	R. Veselská	zk	2/0/0	2+2	1	Z
PřF:Bi3060	Obecná genetika	P. Kuglík	zk	3/0/0	3+2	1	Z
PřF:Bi4010	Základy molekulární biologie	J. Doškař	zk	2/0/0	2+2	2	Z
PřF:Bi6790	Biologie živočichů	M. Vácha	zk	2/0/0	2+2	4	Z
PřF:C3580	Biochemie	P. Bouchal	zk	3/0/0	3+2	3	-
PřF:C7777	Zacházení s chemickými látkami	J. Literák	z	0/0/0 2 hodiny školení autorizovanou osobou.	-	1	-
PřF:E1020	Soft-skills I - Počítačová gramotnost	P. Šebej	z	0/1/0	1	1	-
PřF:E1041	Úvod do matematické biologie a biomedicíny I	T. Pavlík	z	0/1/0	1	1	-
PřF:E1051	Úvod do matematické biologie a biomedicíny II	T. Pavlík	z	1/0/0	1	2	-
PřF:E2020	Soft-skills II - Informační gramotnost	P. Šebej	z	0/1/0	1	2	-
PřF:E3011	Algoritmizace a programování	D. Schwarz	k	2/2/0	4+1	2	P
PřF:E3020	Soft-skills III - Vědecké myšlení	P. Šebej	z	0/1/0	1	3	-
PřF:E4020	Soft-skills IV - Prezentační dovednosti	J. Urík	z	0/1/0	1	4	-
PřF:E5046	Biostatistika pro matematickou biologii a biomedicínu	T. Pavlík	zk	2/1/0	3+2	3	P
PřF:E6090	Bakalářská státní závěrečná zkouška z Matematické biologie a biomedicíny	L. Dušek	-	0/0/0	-	6	Z
PřF:E7491	Regresní modelování	T. Pavlík	zk	2/1	3+2	5	P
PřF:E8600	Vícerozměrné metody	J. Jarkovský	zk	2/1/0	3+2	4	P
PřF:E8600c	Vícerozměrné metody - cvičení	J. Jarkovský	z	0/1/0	1	4	-
PřF:M1101	Matematická analýza I	P. Hasil	zk	4/2/0	6+3	1	Z
PřF:M1111	Lineární algebra a geometrie I	M. Čadek	zk	2/2/0	4+2	1	Z
PřF:M2100	Matematická analýza II	R. Šimon Hilscher	zk	4/2/0	6+3	2	Z
PřF:M2110	Lineární algebra a geometrie II	J. Paseka	zk	2/2/0	4+2	2	Z
PřF:M3121	Pravděpodobnost a statistika I	J. Koláček	zk	2/2/0	4+2	3	Z
PřF:M4122	Pravděpodobnost a statistika II	J. Koláček	zk	2/2/0	4+2	4	Z
					91 kreditů

Volitelné předměty

Student si vybírá z volitelných předmětů na MU až do celkové výše 180 kreditů za studium. Je doporučeno vybírat ze 13 doporučovaných předmětů, které nejlépe odpovídají potřebám studia. Níže uvedený předmět slouží jako osvědčený příklad.

Kód	Název	Garant	Ukončení	Rozsah	Kreditů	Semestr	Profilace
PřF:Bi3060c	Obecná genetika - cvičení	P. Lízal	z	0/2/0	2	1	-
					2 kredity

Specializační část

Povinné předměty

Kód	Název	Garant	Ukončení	Rozsah	Kreditů	Semestr	Profilace
PřF:Bi6170	Genetika II	J. Řepková	zk	2/0/0	2+2	5	P
PřF:Bi6270	Cytogenetika a cytogenomika	P. Kuglík	zk	2/0/0	2+2	6	P
PřF:Bi6400	Metody molekulární biologie	R. Pantůček	zk	3/0/0	3+2	4	P
PřF:Bi7090	Molekulární biologie eukaryot	J. Šmarda	zk	2/0/0	2+2	5	P
PřF:C2110	Operační systém UNIX a základy programování	P. Kulhánek	k	0/2/0	2+1	1	-
PřF:C2131	Úvod do bioinformatiky	M. Wimmerová	zk	2/0/0	2+2	2	P
PřF:C2132	Úvod do bioinformatiky - seminář	M. Wimmerová	z	0/1/0	1	2	-
PřF:C2135	Bioinformatika v praxi	L. Malinovská	k	0/2/0	2+1	4	P
PřF:C2142	Návrh algoritmů pro přírodovědce	T. Raček	zk	1/2/0	3+2	4	P
PřF:C2184	Úvod do programování v Pythonu	T. Raček	k	0/2/0	2+1	3	-
PřF:E4013	Týmový projekt z Matematické biologie a biomedicíny – biomedicínská bioinformatika	L. Dušek	z	0/2/0	2	3	-
PřF:E7490	Pokročilé neparametrické metody	L. Dušek	zk	1/1/0	3+2	6	-
PřF:E7492	Analýza sekvencí DNA	N. Martínková	zk	2/1/0	3+2	5	P
PřF:E7527	Analýza dat v R	E. Budinská	k	2/0/0	2+1	3	-
PřF:M4180	Numerické metody I	J. Zelinka	zk	2/2/0	4+2	6	-
PřF:M5444	Markovské řetězce	M. Budíková	zk	2/1/0	3+2	5	-
					62 kreditů