Studijní plán

Student musí absolvovat státní doktorské závěrečné zkoušky jejichž předmětem je prověření odborných znalostí v oboru genomika a proteomika a v souvisejících disciplínách, zejm. v molekulární a buněčné biologii, strukturní biologii, bioinformatice a v oblasti experimentálních přístupů používaných v oboru. Témata předem specifikuje školitel a schvaluje OR (nebo předseda OR). Student by měl v rozpravě prokázat především dostatečný všeobecný rozhled v oboru a dále hlubší znalosti v oblastech souvisejících s řešeným tématem, včetně přehledu o recentních významných publikacích v rámci své specializace.

Nutnou podmínkou obhajoby disertační práce je, aby alespoň část výsledků již byla uveřejněná nebo přijatá ke zveřejnění v časopise z databáze Web of Science (WoS) s impaktním faktorem nad mediánem oboru a aby byl student prvním autorem publikace. Pokud má časopis nižší IF (pod mediánem), pak je nutné mít minimálně 2 články.

Vlastní obhajoba disertační práce probíhá formou prezentace tezí práce a následnou diskusí s oponenty, členy zkušební komise a odbornou veřejností. Student musí prokázat schopnost samostatné tvořivé vědecké práce, umět prezentovat výsledky vlastního výzkumu a umět je kriticky hodnotit.

Výzkumné aktivity:
Příprava disertační práce – probíhá po celou dobu studia a tvoří min. 60 % pracovní zátěže
Studium odborné literatury vztahující se k oblasti výzkumu
Publikační činnost – sestává z minimálně jednoho prvo-autorského článků v impaktovaném časopise (nad mediánem oboru), tvoří 10 % pracovní zátěže
Obhajoba tezí disertační práce
Účast na konferenci – nutno prokázat aktivní účast na min. jedné mezinárodní konferenci
Zahraniční stáž – nutno absolvovat v délce 1 měsíce (v součtu za dobu studia)

Vzdělávací aktivity:
Odborné předměty - vhodně doplňující znalosti studenta v oblasti genomiky a proteomiky (viz nabídka studijního plánu - celkem max. 20 % pracovní zátěže)
Oborový seminář genomiky a proteomiky
Pedagogická činnost – doktorand se může podílet na vedení bakalářských a diplomových (jako konzultant) prací, může přispívat do pravidelné výuky atd., a to v rozsahu max. 150 hodin za studium (do 10 % pracovní zátěže)
Soft skills - např. Akademické psaní
Odborná angličtina

Příklady (10 vybraných) úspěšně obhájených disertací:

Pavlištová: Effect of chromatin assembly on genome stability (https://is.muni.cz/auth/th/wx0ba/)

Kateřina Zábrady: Analysis of MAGE (Melanoma AntiGEn) proteins and their interaction partners (https://is.muni.cz/auth/th/ap968/)

Eliška Janoušková: Dynamics of Telomeric Proteins (https://is.muni.cz/auth/th/pm7q7/)

Kateřina Šedová: Characterisation of Protein Modifications by Mass Spectrometry (https://is.muni.cz/auth/th/eypvg/)

Zuzana Vrzalová: Complex molecular diagnostics of congenital adrenal hyperplasia (https://is.muni.cz/auth/th/x4k2c/)

Karin Jaške: Crossroads of genetics and epigenetics: nucleosome assembly and chromosome integrity (https://is.muni.cz/auth/th/laaa5/)

Markéta Žďárská: Differential proteomics and phosphoproteomics of hormonal regulations in plants (https://is.muni.cz/auth/th/dhio8/)

Michal Zimmermann: Protein-DNA interactions involved in regulation of telomere maintenance (https://is.muni.cz/auth/th/fsxl1/)

Marc Guerineau: Analysis of SMC5-6 complex subunits and their functional homologs (https://is.muni.cz/auth/th/uccar/)

Eva Majerová: Epigenetic mechanisms in the regulation of telomere maintenance (https://is.muni.cz/auth/th/eyt2h/)